Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8E733

Protein Details
Accession A0A1B8E733    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39VDSRNPRDRRGGRQEPDRGNBasic
278-297GGIRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-98GGGRRDDRRDRDGGRSDGRRDDPRRDDRGRH
123-151RSQRDRRRDGEGDSKRRSRSPRGERSRER
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MTEPPYKRSRRDFDSDRPPVDSRNPRDRRGGRQEPDRGNDRNRSYRSRTPERPQDRGYDRDNQRYDRGGGRRDDRRDRDGGRSDGRRDDPRRDDRGRHGQRDMDRDVDRRQYRDDRGARDNDRSQRDRRRDGEGDSKRRSRSPRGERSREREPAADTAHPNMARIVEQSMPLRQGSRQESRHATPPVAFKVGRPDSRAGSRDPGGQSPAQPDAAAASTIHKNKPKAADFIAADDMDVEEGEEDDIEVEDDAMAAMQAMMGFGGFGTTKQKKVLGNDIGGIRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.71
4 0.68
5 0.62
6 0.57
7 0.59
8 0.59
9 0.56
10 0.59
11 0.63
12 0.62
13 0.71
14 0.73
15 0.73
16 0.74
17 0.76
18 0.72
19 0.76
20 0.81
21 0.78
22 0.78
23 0.74
24 0.69
25 0.66
26 0.67
27 0.65
28 0.65
29 0.63
30 0.65
31 0.66
32 0.68
33 0.71
34 0.72
35 0.74
36 0.74
37 0.79
38 0.79
39 0.79
40 0.74
41 0.74
42 0.69
43 0.65
44 0.6
45 0.59
46 0.57
47 0.6
48 0.61
49 0.56
50 0.54
51 0.52
52 0.5
53 0.48
54 0.48
55 0.44
56 0.45
57 0.49
58 0.54
59 0.58
60 0.65
61 0.63
62 0.62
63 0.63
64 0.6
65 0.61
66 0.6
67 0.57
68 0.55
69 0.55
70 0.53
71 0.53
72 0.54
73 0.55
74 0.53
75 0.56
76 0.58
77 0.61
78 0.66
79 0.65
80 0.65
81 0.65
82 0.72
83 0.72
84 0.67
85 0.62
86 0.59
87 0.59
88 0.6
89 0.53
90 0.48
91 0.41
92 0.39
93 0.4
94 0.43
95 0.41
96 0.36
97 0.4
98 0.41
99 0.42
100 0.49
101 0.51
102 0.47
103 0.5
104 0.55
105 0.52
106 0.51
107 0.54
108 0.51
109 0.53
110 0.52
111 0.54
112 0.57
113 0.62
114 0.63
115 0.6
116 0.6
117 0.55
118 0.56
119 0.58
120 0.58
121 0.59
122 0.57
123 0.59
124 0.53
125 0.56
126 0.56
127 0.55
128 0.56
129 0.58
130 0.63
131 0.68
132 0.76
133 0.78
134 0.79
135 0.78
136 0.72
137 0.63
138 0.54
139 0.46
140 0.41
141 0.36
142 0.32
143 0.24
144 0.21
145 0.23
146 0.21
147 0.19
148 0.15
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.08
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.17
162 0.21
163 0.28
164 0.29
165 0.33
166 0.37
167 0.39
168 0.45
169 0.41
170 0.36
171 0.31
172 0.33
173 0.31
174 0.29
175 0.27
176 0.2
177 0.29
178 0.34
179 0.33
180 0.32
181 0.32
182 0.32
183 0.37
184 0.38
185 0.31
186 0.29
187 0.28
188 0.3
189 0.3
190 0.28
191 0.25
192 0.24
193 0.24
194 0.22
195 0.23
196 0.18
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.08
203 0.1
204 0.15
205 0.18
206 0.23
207 0.27
208 0.28
209 0.32
210 0.41
211 0.41
212 0.41
213 0.4
214 0.42
215 0.37
216 0.39
217 0.37
218 0.28
219 0.24
220 0.2
221 0.17
222 0.1
223 0.09
224 0.06
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.02
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.13
253 0.17
254 0.19
255 0.22
256 0.27
257 0.3
258 0.35
259 0.44
260 0.42
261 0.41
262 0.43
263 0.46
264 0.45
265 0.43
266 0.42
267 0.37
268 0.35
269 0.36
270 0.38
271 0.44
272 0.5
273 0.59
274 0.64
275 0.7
276 0.75
277 0.8
278 0.82
279 0.78
280 0.72
281 0.65
282 0.57
283 0.54
284 0.51
285 0.45
286 0.41
287 0.39
288 0.38