Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8EDH6

Protein Details
Accession A0A1B8EDH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
609-632DVSGRGPKAKPNQQPKQQKPNVPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
615-636PKAKPNQQPKQQKPNVPAAPKK
Subcellular Location(s) cyto 13cyto_nucl 13, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
IPR012387  Trl1_fun  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051730  F:GTP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MTDPDTVPFVAQDIQEIGSFLKDLESHAKKWVGVSRSKKTFSCKKNAFDVQNSPDKLVVDSWRFQEWDYKRDDLPTYARGLFTYHTKDNRPEIAVRGYDKFFNTDEIEATKWHNIEQYTKGPYELSLKENGCIIFISGLSDDSLLVCSKHSTGPREDANLSHAMAGERWVDRQLKAIGKTRQDLSRELRKRNATAVAELCDDDFEEHILAYRGDSAGLYLHGININIPEFTTYSGPQVQEFASEWGFKRTDFLVLDDITTVRKFLESVAETGSYNGRDVEGFVIRCKSNFRTKEYQDWFFKYKFEEPYLMFRQWRECTKAMINGKPPLFKKHVKITEEYLLFARKKLAENPKLAKEYNGNHGIIELRDDFLKEKNLKGSDLLRLEYSNEGEAPQHATKNIILVPVATIGCGKTTISIALQHLFGWGHVQNDNIQGKGRPPRFTKEVMRQLEDQPVVIADRNNAQKHERKQLIGDVHHQYMSSARLVALNFVHDIESIDKIRQVTQGRVFARGDNHQTIQAATDKNKVMGIMQGFINRFEPLRPDQDPDHGFDSVIDLDPTSDSRQNLETVIARLSDLYPKLFTDMPTSDDLDDAIAFALNEYRPELKHDVSGRGPKAKPNQQPKQQKPNVPAAPKKKALEYIAIDIPTNQILDVLEKTFSAQEDTKAAFFRQLQETRRVQPKFHVTLIHRASSKQCPEIWDKYKSLFEEYGDEEKPLGDCQVQLERVVWSDRIMAIVVRLVTEGWECVNTVPHITVGTRADDVKPKESNDLLQQWLQVGSGEETGIFEAVIQGVTVDGTVHAVLQKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.14
5 0.11
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.12
11 0.22
12 0.26
13 0.27
14 0.34
15 0.36
16 0.35
17 0.4
18 0.44
19 0.4
20 0.45
21 0.53
22 0.56
23 0.62
24 0.67
25 0.65
26 0.68
27 0.71
28 0.71
29 0.73
30 0.71
31 0.68
32 0.73
33 0.78
34 0.76
35 0.73
36 0.72
37 0.68
38 0.69
39 0.64
40 0.55
41 0.49
42 0.42
43 0.36
44 0.32
45 0.32
46 0.28
47 0.31
48 0.32
49 0.34
50 0.34
51 0.33
52 0.38
53 0.35
54 0.37
55 0.38
56 0.39
57 0.37
58 0.41
59 0.43
60 0.38
61 0.39
62 0.36
63 0.36
64 0.34
65 0.33
66 0.29
67 0.28
68 0.25
69 0.26
70 0.3
71 0.32
72 0.36
73 0.4
74 0.46
75 0.5
76 0.53
77 0.5
78 0.46
79 0.44
80 0.45
81 0.44
82 0.41
83 0.39
84 0.36
85 0.36
86 0.34
87 0.32
88 0.27
89 0.27
90 0.26
91 0.22
92 0.22
93 0.21
94 0.21
95 0.19
96 0.22
97 0.22
98 0.19
99 0.19
100 0.22
101 0.21
102 0.25
103 0.29
104 0.33
105 0.34
106 0.34
107 0.34
108 0.3
109 0.3
110 0.32
111 0.29
112 0.25
113 0.28
114 0.28
115 0.28
116 0.31
117 0.29
118 0.23
119 0.2
120 0.17
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.2
138 0.24
139 0.28
140 0.34
141 0.36
142 0.4
143 0.39
144 0.35
145 0.34
146 0.31
147 0.27
148 0.21
149 0.19
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.23
160 0.27
161 0.3
162 0.34
163 0.41
164 0.43
165 0.46
166 0.49
167 0.49
168 0.49
169 0.45
170 0.47
171 0.46
172 0.5
173 0.53
174 0.55
175 0.58
176 0.58
177 0.57
178 0.56
179 0.56
180 0.47
181 0.45
182 0.42
183 0.36
184 0.32
185 0.3
186 0.25
187 0.17
188 0.16
189 0.11
190 0.09
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.09
218 0.11
219 0.1
220 0.13
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.14
231 0.14
232 0.17
233 0.18
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.19
238 0.17
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.18
243 0.16
244 0.15
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.14
253 0.13
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.19
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.2
274 0.22
275 0.28
276 0.32
277 0.38
278 0.44
279 0.47
280 0.57
281 0.59
282 0.62
283 0.57
284 0.57
285 0.54
286 0.45
287 0.44
288 0.37
289 0.37
290 0.33
291 0.31
292 0.29
293 0.27
294 0.34
295 0.37
296 0.36
297 0.31
298 0.29
299 0.33
300 0.33
301 0.36
302 0.33
303 0.3
304 0.31
305 0.33
306 0.39
307 0.38
308 0.39
309 0.39
310 0.39
311 0.4
312 0.41
313 0.4
314 0.39
315 0.4
316 0.4
317 0.4
318 0.44
319 0.5
320 0.47
321 0.48
322 0.46
323 0.47
324 0.43
325 0.39
326 0.3
327 0.27
328 0.25
329 0.23
330 0.21
331 0.16
332 0.18
333 0.25
334 0.34
335 0.35
336 0.41
337 0.46
338 0.49
339 0.5
340 0.48
341 0.42
342 0.37
343 0.34
344 0.34
345 0.33
346 0.27
347 0.24
348 0.24
349 0.24
350 0.18
351 0.18
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.23
365 0.24
366 0.23
367 0.23
368 0.22
369 0.18
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.08
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.13
386 0.13
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.17
418 0.17
419 0.15
420 0.15
421 0.14
422 0.18
423 0.26
424 0.29
425 0.28
426 0.31
427 0.36
428 0.39
429 0.44
430 0.47
431 0.48
432 0.54
433 0.51
434 0.51
435 0.48
436 0.46
437 0.46
438 0.39
439 0.29
440 0.2
441 0.17
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.07
446 0.12
447 0.17
448 0.18
449 0.2
450 0.23
451 0.29
452 0.34
453 0.43
454 0.41
455 0.37
456 0.37
457 0.41
458 0.43
459 0.38
460 0.39
461 0.33
462 0.31
463 0.3
464 0.28
465 0.22
466 0.19
467 0.18
468 0.12
469 0.09
470 0.08
471 0.1
472 0.1
473 0.12
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.12
486 0.12
487 0.14
488 0.18
489 0.19
490 0.22
491 0.26
492 0.33
493 0.32
494 0.35
495 0.34
496 0.31
497 0.32
498 0.31
499 0.31
500 0.27
501 0.27
502 0.25
503 0.24
504 0.22
505 0.21
506 0.21
507 0.18
508 0.17
509 0.21
510 0.2
511 0.21
512 0.21
513 0.19
514 0.15
515 0.16
516 0.15
517 0.12
518 0.12
519 0.15
520 0.15
521 0.16
522 0.17
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.15
527 0.15
528 0.21
529 0.22
530 0.24
531 0.25
532 0.32
533 0.33
534 0.32
535 0.31
536 0.26
537 0.24
538 0.2
539 0.21
540 0.14
541 0.14
542 0.1
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.1
547 0.11
548 0.13
549 0.13
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.17
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.18
571 0.18
572 0.19
573 0.2
574 0.22
575 0.19
576 0.18
577 0.17
578 0.12
579 0.11
580 0.08
581 0.06
582 0.05
583 0.04
584 0.05
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.09
589 0.11
590 0.11
591 0.17
592 0.21
593 0.2
594 0.25
595 0.28
596 0.31
597 0.35
598 0.42
599 0.41
600 0.45
601 0.45
602 0.47
603 0.53
604 0.57
605 0.61
606 0.64
607 0.7
608 0.72
609 0.82
610 0.85
611 0.87
612 0.86
613 0.83
614 0.77
615 0.78
616 0.76
617 0.72
618 0.72
619 0.69
620 0.7
621 0.69
622 0.66
623 0.58
624 0.56
625 0.5
626 0.49
627 0.43
628 0.4
629 0.37
630 0.36
631 0.32
632 0.27
633 0.25
634 0.19
635 0.15
636 0.1
637 0.07
638 0.07
639 0.09
640 0.11
641 0.11
642 0.1
643 0.1
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.15
650 0.19
651 0.21
652 0.21
653 0.22
654 0.21
655 0.21
656 0.22
657 0.25
658 0.31
659 0.36
660 0.38
661 0.45
662 0.5
663 0.53
664 0.61
665 0.58
666 0.5
667 0.52
668 0.58
669 0.55
670 0.52
671 0.52
672 0.46
673 0.54
674 0.57
675 0.54
676 0.45
677 0.42
678 0.44
679 0.46
680 0.47
681 0.41
682 0.39
683 0.39
684 0.45
685 0.53
686 0.54
687 0.51
688 0.49
689 0.49
690 0.51
691 0.48
692 0.46
693 0.38
694 0.33
695 0.31
696 0.34
697 0.35
698 0.31
699 0.3
700 0.24
701 0.23
702 0.22
703 0.19
704 0.16
705 0.11
706 0.11
707 0.14
708 0.21
709 0.21
710 0.21
711 0.22
712 0.21
713 0.23
714 0.25
715 0.21
716 0.15
717 0.16
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.13
722 0.11
723 0.14
724 0.12
725 0.1
726 0.1
727 0.09
728 0.1
729 0.11
730 0.1
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.1
735 0.14
736 0.14
737 0.15
738 0.15
739 0.15
740 0.16
741 0.16
742 0.2
743 0.17
744 0.19
745 0.2
746 0.21
747 0.24
748 0.3
749 0.34
750 0.36
751 0.38
752 0.38
753 0.42
754 0.42
755 0.43
756 0.43
757 0.44
758 0.41
759 0.39
760 0.38
761 0.33
762 0.32
763 0.27
764 0.2
765 0.17
766 0.14
767 0.13
768 0.12
769 0.11
770 0.11
771 0.11
772 0.11
773 0.08
774 0.06
775 0.06
776 0.07
777 0.07
778 0.06
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.04
785 0.06
786 0.06
787 0.07