Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8DQJ5

Protein Details
Accession A0A1B8DQJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40SATPDGKKYKKRADEEAERQAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-103TQKRKREEEEAEAKEEREEKRRKLAEESKIRREREEKEEEARRRKRV
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFASLMSKEISKAKAPASATPDGKKYKKRADEEAERQAAYAAHQEQLEKERVARETQKRKREEEEAEAKEEREEKRRKLAEESKIRREREEKEEEARRRKRVGLPELVEKEKEEVVDDDDIVEAELVGLLEEIGEPTSLPGENHRQKVRRYRRVTTVMTTGPIPTSLKLVDEKDMKVEKMPPPEDVEATKWLYRQLASYFTMVLKEWEDALLREEKRDTFASKAAYNAMAQSKQNMTPLFRKFEKGDLDVGILEPVVEIVKAAQERRYVDANDGYLTLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHESDKGHVMGDEVTRKFLQSIKRCLSFAQVRWPPEDVRQLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.33
4 0.37
5 0.38
6 0.43
7 0.44
8 0.44
9 0.49
10 0.52
11 0.58
12 0.61
13 0.64
14 0.66
15 0.71
16 0.73
17 0.76
18 0.77
19 0.8
20 0.8
21 0.81
22 0.74
23 0.64
24 0.58
25 0.49
26 0.4
27 0.3
28 0.28
29 0.19
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.26
35 0.29
36 0.23
37 0.24
38 0.26
39 0.27
40 0.33
41 0.39
42 0.45
43 0.52
44 0.6
45 0.68
46 0.69
47 0.72
48 0.72
49 0.71
50 0.67
51 0.65
52 0.66
53 0.6
54 0.59
55 0.55
56 0.49
57 0.43
58 0.42
59 0.36
60 0.35
61 0.4
62 0.39
63 0.48
64 0.53
65 0.53
66 0.58
67 0.64
68 0.64
69 0.67
70 0.71
71 0.71
72 0.74
73 0.72
74 0.68
75 0.65
76 0.61
77 0.58
78 0.59
79 0.52
80 0.53
81 0.61
82 0.64
83 0.69
84 0.7
85 0.67
86 0.62
87 0.64
88 0.62
89 0.63
90 0.62
91 0.6
92 0.56
93 0.6
94 0.61
95 0.57
96 0.5
97 0.41
98 0.35
99 0.27
100 0.23
101 0.16
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.02
118 0.02
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.08
129 0.18
130 0.24
131 0.3
132 0.36
133 0.39
134 0.45
135 0.56
136 0.64
137 0.64
138 0.65
139 0.65
140 0.68
141 0.71
142 0.68
143 0.59
144 0.53
145 0.43
146 0.37
147 0.32
148 0.24
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.18
162 0.2
163 0.19
164 0.18
165 0.22
166 0.22
167 0.27
168 0.28
169 0.25
170 0.27
171 0.28
172 0.28
173 0.24
174 0.22
175 0.18
176 0.19
177 0.19
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.2
205 0.22
206 0.21
207 0.17
208 0.2
209 0.22
210 0.21
211 0.22
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.23
223 0.22
224 0.23
225 0.28
226 0.32
227 0.35
228 0.34
229 0.37
230 0.35
231 0.39
232 0.4
233 0.34
234 0.33
235 0.27
236 0.27
237 0.23
238 0.22
239 0.15
240 0.1
241 0.08
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.07
249 0.09
250 0.11
251 0.14
252 0.18
253 0.2
254 0.23
255 0.28
256 0.25
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.23
261 0.22
262 0.19
263 0.15
264 0.14
265 0.11
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.13
284 0.14
285 0.18
286 0.22
287 0.22
288 0.26
289 0.31
290 0.36
291 0.42
292 0.47
293 0.46
294 0.48
295 0.51
296 0.48
297 0.42
298 0.37
299 0.29
300 0.25
301 0.27
302 0.28
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.26
307 0.27
308 0.28
309 0.34
310 0.35
311 0.45
312 0.49
313 0.53
314 0.53
315 0.52
316 0.57
317 0.55
318 0.5
319 0.51
320 0.5
321 0.48
322 0.51
323 0.53
324 0.47
325 0.45
326 0.5