Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JUN4

Protein Details
Accession I2JUN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-153ASREIARRERRKRAERELRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-99KRKAELKHEIERKK
144-155IARRERRKRAER
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 12, mito 7.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MDQVTKNQFPFFIKTIXQNLQRKSKESGRSHRXFQTGRXNKGFTISIDKRLASFGQDDDRFKMSDKFSVLTDALTQAHDEAKAELKRKAELKHEIERKKLLDDQHKLRRIAREAHMRRGIGSSDXXYINDKEPASSGLASXREIARRERRKRAERELRMGSMSTESRVKLLARKDGREISDRVAIGVAASAXXNNETDSYDSNLFMHAAGKSTRRGEEQXYEGSLFGAQDAVNDIYRARDSDKYKGLGMETANKEMNSIAKEKRFDDLSSSGPVSFEMEKSDSREEENRNNFDRAEKASGLHIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.45
3 0.51
4 0.56
5 0.56
6 0.62
7 0.63
8 0.65
9 0.68
10 0.67
11 0.68
12 0.7
13 0.75
14 0.74
15 0.72
16 0.72
17 0.75
18 0.69
19 0.67
20 0.68
21 0.68
22 0.66
23 0.63
24 0.59
25 0.51
26 0.51
27 0.46
28 0.45
29 0.39
30 0.39
31 0.39
32 0.37
33 0.37
34 0.36
35 0.34
36 0.26
37 0.23
38 0.18
39 0.24
40 0.27
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.29
45 0.29
46 0.32
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.25
51 0.23
52 0.26
53 0.25
54 0.19
55 0.18
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.16
66 0.19
67 0.22
68 0.24
69 0.25
70 0.29
71 0.33
72 0.36
73 0.37
74 0.42
75 0.45
76 0.52
77 0.6
78 0.6
79 0.59
80 0.59
81 0.53
82 0.47
83 0.45
84 0.43
85 0.43
86 0.46
87 0.51
88 0.56
89 0.61
90 0.6
91 0.59
92 0.59
93 0.53
94 0.52
95 0.5
96 0.52
97 0.49
98 0.56
99 0.56
100 0.5
101 0.46
102 0.41
103 0.35
104 0.25
105 0.23
106 0.15
107 0.12
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.15
125 0.2
126 0.29
127 0.37
128 0.44
129 0.54
130 0.62
131 0.68
132 0.73
133 0.78
134 0.8
135 0.76
136 0.76
137 0.7
138 0.61
139 0.53
140 0.45
141 0.35
142 0.26
143 0.21
144 0.14
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.24
153 0.26
154 0.28
155 0.31
156 0.34
157 0.35
158 0.35
159 0.34
160 0.28
161 0.28
162 0.26
163 0.23
164 0.19
165 0.16
166 0.12
167 0.11
168 0.08
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.13
190 0.16
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.23
195 0.25
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.28
200 0.26
201 0.24
202 0.23
203 0.19
204 0.13
205 0.11
206 0.08
207 0.07
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.19
218 0.22
219 0.3
220 0.35
221 0.36
222 0.36
223 0.36
224 0.34
225 0.31
226 0.29
227 0.31
228 0.28
229 0.3
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.25
234 0.27
235 0.2
236 0.22
237 0.24
238 0.28
239 0.32
240 0.32
241 0.36
242 0.36
243 0.34
244 0.35
245 0.32
246 0.29
247 0.31
248 0.31
249 0.26
250 0.24
251 0.23
252 0.2
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.19
258 0.23
259 0.28
260 0.25
261 0.29
262 0.35
263 0.38
264 0.46
265 0.53
266 0.55
267 0.55
268 0.56
269 0.52
270 0.49
271 0.47
272 0.42
273 0.4
274 0.34
275 0.3
276 0.36