Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6AG72

Protein Details
Accession A0A1A6AG72    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-201AESVEKDKRREERKRKRERKREEEELQKMGBasic
215-237GSDSKEAAKKRRKMENRGDREVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-193KDKRREERKRKRERKRE
221-228AAKKRRKM
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSEKPQSSSAAARPSWNKDEWEAKAKSKDEENAEYAKSAEAAMLSGKAPPRRRLGDDMPKPTKALEARKEDLDLNKNLNKTMLVQTSTTGKGPRGAGFYCEMCNRTFKDSLSYLDHINGRGHLRMLGQTTQVERSTLTQVRAKIAALREATRTAVTAKNFDFQARLKAVREAESVEKDKRREERKRKRERKREEEELQKMGIFRNNRADQEQKDGSDSKEAAKKRRKMENRGDREVEEAIKEREDMASMMGFGGFGGAKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.47
4 0.45
5 0.43
6 0.49
7 0.48
8 0.52
9 0.48
10 0.49
11 0.54
12 0.53
13 0.51
14 0.49
15 0.5
16 0.47
17 0.48
18 0.46
19 0.42
20 0.4
21 0.37
22 0.32
23 0.26
24 0.2
25 0.14
26 0.11
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.1
33 0.15
34 0.21
35 0.27
36 0.33
37 0.39
38 0.44
39 0.49
40 0.53
41 0.59
42 0.63
43 0.66
44 0.7
45 0.67
46 0.63
47 0.58
48 0.51
49 0.47
50 0.42
51 0.42
52 0.4
53 0.43
54 0.45
55 0.46
56 0.47
57 0.44
58 0.43
59 0.4
60 0.34
61 0.32
62 0.33
63 0.32
64 0.31
65 0.29
66 0.24
67 0.21
68 0.24
69 0.22
70 0.2
71 0.2
72 0.2
73 0.23
74 0.24
75 0.22
76 0.18
77 0.15
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.18
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.19
95 0.22
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.25
100 0.21
101 0.22
102 0.23
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.1
121 0.11
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.2
130 0.18
131 0.17
132 0.19
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.15
139 0.15
140 0.12
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.16
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.2
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.21
159 0.22
160 0.25
161 0.28
162 0.3
163 0.33
164 0.32
165 0.37
166 0.43
167 0.49
168 0.55
169 0.63
170 0.69
171 0.76
172 0.86
173 0.91
174 0.94
175 0.95
176 0.95
177 0.94
178 0.91
179 0.91
180 0.87
181 0.87
182 0.81
183 0.73
184 0.63
185 0.53
186 0.45
187 0.37
188 0.33
189 0.25
190 0.23
191 0.3
192 0.33
193 0.34
194 0.38
195 0.42
196 0.4
197 0.46
198 0.46
199 0.36
200 0.36
201 0.36
202 0.33
203 0.33
204 0.31
205 0.28
206 0.31
207 0.35
208 0.41
209 0.49
210 0.56
211 0.58
212 0.68
213 0.73
214 0.76
215 0.83
216 0.84
217 0.84
218 0.85
219 0.8
220 0.7
221 0.64
222 0.56
223 0.46
224 0.38
225 0.33
226 0.26
227 0.23
228 0.23
229 0.2
230 0.18
231 0.18
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.06