FuNGI

A0A1A6A4C4

Protein Details

Accession

A0A1A6A4C4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
353-375	DRDRDRERERSHRDRDRDRDDKY	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, cysk 3, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004882 Luc7-rel
Gene Ontology	GO:0005685 C:U1 snRNP GO:0003729 F:mRNA binding GO:0006376 P:mRNA splice site selection
Pfam	View protein in Pfam PF03194 LUC7

Amino Acid Sequences

MMGPEAMGIQPINVDWWSEKVCRNFLFGTCPHIIFGNTKMDLGPCPKIHSDRILKQFQEHAMGHPADPRVNAFRQEHENKLYGFVDDVDRRIRASQRKLEKTPEENRKTIDLMREIGEIELSIQGGTEEIEALGEAGKVEESMEKLSAVDALKQLKADKERDLQHLNENAGASGHQKLRVCETCGAMLSVLDSDKRLADHFGGKLHLGYHELRKLLGMFAEARMTGRPWPIIPPTSEKPAIALPGDNNGANGDDEDPEPIPEPPTSGIASNYSPIPPSTSVPSAPSGPRHSTLAPPPPPGDDAPHTPNHSKIPPADEIPVVGHGDKVKREAGELEDDLKERRGSRDESHRSGDRDRDRERERSHRDRDRDRDDKYDRERGDPCVSYIGVAGMMIEKGIETGIETEIDTATGVRGIGIEKGTERVVIGRESTRDQGRQAKDEFSELNHKNVGSQLGTSRGRWGSLTTEMVEMEMRTKLGMDVEFQCC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.14
4	0.19
5	0.23
6	0.29
7	0.32
8	0.39
9	0.38
10	0.42
11	0.41
12	0.38
13	0.41
14	0.37
15	0.38
16	0.35
17	0.34
18	0.3
19	0.28
20	0.28
21	0.23
22	0.26
23	0.27
24	0.24
25	0.24
26	0.24
27	0.24
28	0.26
29	0.29
30	0.32
31	0.25
32	0.3
33	0.34
34	0.38
35	0.41
36	0.46
37	0.51
38	0.52
39	0.6
40	0.62
41	0.59
42	0.58
43	0.59
44	0.52
45	0.5
46	0.42
47	0.37
48	0.36
49	0.36
50	0.33
51	0.32
52	0.32
53	0.26
54	0.26
55	0.26
56	0.25
57	0.26
58	0.32
59	0.3
60	0.33
61	0.41
62	0.45
63	0.48
64	0.46
65	0.47
66	0.41
67	0.42
68	0.38
69	0.28
70	0.24
71	0.2
72	0.22
73	0.2
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.22
78	0.25
79	0.31
80	0.34
81	0.41
82	0.48
83	0.56
84	0.64
85	0.67
86	0.72
87	0.72
88	0.72
89	0.73
90	0.75
91	0.71
92	0.65
93	0.63
94	0.57
95	0.52
96	0.47
97	0.43
98	0.34
99	0.3
100	0.29
101	0.27
102	0.24
103	0.21
104	0.18
105	0.12
106	0.09
107	0.08
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.04
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.05
127	0.06
128	0.06
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.16
140	0.17
141	0.18
142	0.2
143	0.24
144	0.25
145	0.27
146	0.32
147	0.36
148	0.41
149	0.43
150	0.4
151	0.41
152	0.42
153	0.37
154	0.32
155	0.28
156	0.22
157	0.18
158	0.17
159	0.12
160	0.13
161	0.13
162	0.16
163	0.17
164	0.18
165	0.25
166	0.28
167	0.3
168	0.28
169	0.28
170	0.25
171	0.24
172	0.24
173	0.17
174	0.13
175	0.1
176	0.08
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.09
186	0.13
187	0.13
188	0.14
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.12
196	0.15
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.12
204	0.09
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.12
217	0.14
218	0.16
219	0.17
220	0.21
221	0.22
222	0.26
223	0.26
224	0.23
225	0.22
226	0.21
227	0.2
228	0.14
229	0.13
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.11
263	0.1
264	0.11
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.16
269	0.18
270	0.18
271	0.18
272	0.21
273	0.22
274	0.23
275	0.24
276	0.24
277	0.24
278	0.25
279	0.3
280	0.35
281	0.33
282	0.33
283	0.32
284	0.31
285	0.32
286	0.29
287	0.27
288	0.2
289	0.22
290	0.24
291	0.27
292	0.29
293	0.28
294	0.3
295	0.3
296	0.29
297	0.27
298	0.25
299	0.26
300	0.25
301	0.26
302	0.25
303	0.21
304	0.2
305	0.18
306	0.18
307	0.14
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.14
312	0.14
313	0.16
314	0.17
315	0.16
316	0.17
317	0.18
318	0.18
319	0.2
320	0.2
321	0.2
322	0.19
323	0.2
324	0.2
325	0.2
326	0.2
327	0.16
328	0.19
329	0.21
330	0.24
331	0.29
332	0.4
333	0.45
334	0.48
335	0.53
336	0.53
337	0.53
338	0.53
339	0.56
340	0.53
341	0.53
342	0.53
343	0.56
344	0.57
345	0.62
346	0.64
347	0.66
348	0.67
349	0.69
350	0.74
351	0.75
352	0.79
353	0.8
354	0.83
355	0.82
356	0.8
357	0.74
358	0.74
359	0.7
360	0.7
361	0.67
362	0.67
363	0.59
364	0.57
365	0.56
366	0.52
367	0.53
368	0.45
369	0.39
370	0.33
371	0.31
372	0.26
373	0.23
374	0.18
375	0.11
376	0.1
377	0.08
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.1
406	0.12
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.13
411	0.14
412	0.15
413	0.17
414	0.18
415	0.21
416	0.24
417	0.3
418	0.33
419	0.33
420	0.37
421	0.43
422	0.45
423	0.49
424	0.48
425	0.47
426	0.42
427	0.44
428	0.4
429	0.35
430	0.4
431	0.35
432	0.37
433	0.34
434	0.33
435	0.3
436	0.32
437	0.31
438	0.22
439	0.22
440	0.21
441	0.27
442	0.29
443	0.29
444	0.33
445	0.3
446	0.3
447	0.29
448	0.28
449	0.24
450	0.27
451	0.29
452	0.24
453	0.24
454	0.23
455	0.23
456	0.22
457	0.18
458	0.15
459	0.13
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.14
465	0.14
466	0.16

A0A1A6A4C4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer