FuNGI

A0A1A6AFJ1

Protein Details

Accession

A0A1A6AFJ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-32	AGPSRPKSSTPQRKNASKSTPGT	Hydrophilic
488-510	VKKVGPQYVKPPRPPRPGHPNAH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
497-508	KPPRPPRPGHPN

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024337 tRNA_splic_suSen54 IPR024336 tRNA_splic_suSen54_N
Gene Ontology	GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12928 tRNA_int_end_N2

Amino Acid Sequences

MSNPHMSAEAGPSRPKSSTPQRKNASKSTPGTPALAQAEEGDNPRTNLTTINPSTAGGGGDAEGDEDGDEERMDIKLIQSFADKIQHLPSSSETDGITSRGKITIPRRGEKDFEPLNETVNLQEMMLQKSREALFGALVGVRGGHSKAISHAIITPSNPYPKVLIIHGHLFDTIGMTNKYPTTPSQQAKGKGKTYSQIELLPEEALYLLERGTLQIWLARDFSEQEMEEGYGEWCEEEYGVKGAVEMSVMEGFATFIGREGLSWERYQAYAYMKRLGYTVHRTRPFIPDHFLSDYLSTSSSPELDMNARYPGMDPFQTWWLSIPRWIAGFFRFIGRKLRNTVGRISSIGLGDRRFRGTLLEGWSGNSYKSIFEHLRIIPQGHANPLPPRPEQQPQLSAALTSTSTSTLISDSKYDALIRNPYLPFFHIWKPSAAFTKRNWDKGSENGLKECPPSYWAGVVESRNTPIPTIQQLDEVFNFLPDEPKGPVKKVGPQYVKPPRPPRPGHPNAHGKKDENDNDKGSTSKFSFAYLLSMIGLSTAPGKEDEKNTTTTPFVNIPALRNGDRAFVVAVNDSGNTGWIRFGRSGFAEFAPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.39
4	0.44
5	0.52
6	0.58
7	0.65
8	0.72
9	0.8
10	0.84
11	0.85
12	0.82
13	0.8
14	0.75
15	0.7
16	0.69
17	0.61
18	0.57
19	0.48
20	0.45
21	0.38
22	0.34
23	0.28
24	0.22
25	0.22
26	0.22
27	0.23
28	0.21
29	0.2
30	0.21
31	0.21
32	0.21
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.26
37	0.26
38	0.29
39	0.28
40	0.27
41	0.28
42	0.26
43	0.23
44	0.13
45	0.12
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.07
50	0.06
51	0.06
52	0.05
53	0.05
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.05
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.12
64	0.13
65	0.14
66	0.15
67	0.16
68	0.18
69	0.24
70	0.23
71	0.21
72	0.26
73	0.28
74	0.27
75	0.28
76	0.28
77	0.28
78	0.28
79	0.28
80	0.23
81	0.21
82	0.21
83	0.22
84	0.21
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.16
89	0.22
90	0.28
91	0.35
92	0.4
93	0.46
94	0.5
95	0.52
96	0.56
97	0.51
98	0.53
99	0.49
100	0.44
101	0.42
102	0.37
103	0.36
104	0.33
105	0.31
106	0.22
107	0.19
108	0.17
109	0.11
110	0.16
111	0.16
112	0.19
113	0.22
114	0.21
115	0.19
116	0.23
117	0.24
118	0.21
119	0.19
120	0.16
121	0.13
122	0.13
123	0.14
124	0.09
125	0.09
126	0.08
127	0.06
128	0.06
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.07
133	0.08
134	0.1
135	0.15
136	0.14
137	0.14
138	0.16
139	0.18
140	0.19
141	0.19
142	0.21
143	0.2
144	0.24
145	0.24
146	0.22
147	0.2
148	0.21
149	0.22
150	0.2
151	0.2
152	0.18
153	0.22
154	0.22
155	0.21
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.13
160	0.11
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.11
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.14
169	0.19
170	0.27
171	0.29
172	0.36
173	0.41
174	0.48
175	0.55
176	0.59
177	0.56
178	0.51
179	0.5
180	0.49
181	0.47
182	0.42
183	0.35
184	0.32
185	0.29
186	0.26
187	0.25
188	0.19
189	0.14
190	0.11
191	0.09
192	0.07
193	0.06
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.07
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.03
243	0.03
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.07
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.15
257	0.19
258	0.2
259	0.25
260	0.24
261	0.24
262	0.24
263	0.23
264	0.22
265	0.26
266	0.32
267	0.34
268	0.37
269	0.39
270	0.41
271	0.45
272	0.44
273	0.37
274	0.33
275	0.27
276	0.27
277	0.27
278	0.25
279	0.21
280	0.17
281	0.16
282	0.13
283	0.12
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.1
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.15
310	0.14
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.12
315	0.11
316	0.13
317	0.11
318	0.14
319	0.14
320	0.15
321	0.23
322	0.25
323	0.27
324	0.3
325	0.35
326	0.36
327	0.37
328	0.41
329	0.35
330	0.34
331	0.31
332	0.28
333	0.24
334	0.19
335	0.18
336	0.15
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.16
341	0.15
342	0.15
343	0.15
344	0.15
345	0.18
346	0.2
347	0.21
348	0.2
349	0.21
350	0.22
351	0.21
352	0.18
353	0.15
354	0.11
355	0.09
356	0.1
357	0.14
358	0.14
359	0.15
360	0.2
361	0.2
362	0.23
363	0.24
364	0.24
365	0.2
366	0.23
367	0.23
368	0.2
369	0.21
370	0.19
371	0.22
372	0.24
373	0.27
374	0.24
375	0.27
376	0.29
377	0.34
378	0.36
379	0.37
380	0.38
381	0.36
382	0.37
383	0.34
384	0.29
385	0.23
386	0.19
387	0.14
388	0.11
389	0.09
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.15
404	0.2
405	0.2
406	0.24
407	0.24
408	0.24
409	0.24
410	0.24
411	0.23
412	0.22
413	0.26
414	0.27
415	0.28
416	0.29
417	0.3
418	0.31
419	0.37
420	0.36
421	0.35
422	0.32
423	0.42
424	0.46
425	0.5
426	0.49
427	0.45
428	0.44
429	0.47
430	0.54
431	0.5
432	0.46
433	0.42
434	0.43
435	0.4
436	0.38
437	0.32
438	0.23
439	0.18
440	0.18
441	0.17
442	0.17
443	0.16
444	0.18
445	0.21
446	0.22
447	0.23
448	0.22
449	0.22
450	0.23
451	0.23
452	0.21
453	0.18
454	0.2
455	0.22
456	0.24
457	0.23
458	0.24
459	0.25
460	0.28
461	0.26
462	0.25
463	0.2
464	0.17
465	0.17
466	0.13
467	0.14
468	0.12
469	0.14
470	0.14
471	0.22
472	0.24
473	0.26
474	0.32
475	0.32
476	0.41
477	0.47
478	0.54
479	0.54
480	0.55
481	0.63
482	0.68
483	0.73
484	0.74
485	0.76
486	0.76
487	0.78
488	0.81
489	0.8
490	0.8
491	0.82
492	0.79
493	0.79
494	0.8
495	0.75
496	0.78
497	0.74
498	0.66
499	0.62
500	0.64
501	0.64
502	0.59
503	0.59
504	0.52
505	0.49
506	0.48
507	0.44
508	0.35
509	0.33
510	0.28
511	0.28
512	0.25
513	0.24
514	0.25
515	0.23
516	0.25
517	0.19
518	0.18
519	0.13
520	0.13
521	0.11
522	0.1
523	0.09
524	0.06
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.11
529	0.14
530	0.18
531	0.23
532	0.29
533	0.29
534	0.33
535	0.34
536	0.35
537	0.35
538	0.31
539	0.3
540	0.26
541	0.25
542	0.28
543	0.28
544	0.29
545	0.34
546	0.37
547	0.35
548	0.36
549	0.34
550	0.31
551	0.29
552	0.27
553	0.22
554	0.18
555	0.18
556	0.16
557	0.16
558	0.14
559	0.13
560	0.13
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.1
565	0.13
566	0.14
567	0.18
568	0.2
569	0.21
570	0.23
571	0.25
572	0.28
573	0.27

A0A1A6AFJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer