Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A9P1

Protein Details
Accession A0A1A6A9P1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-36ATGGSARRRNSKRENESKALPTHydrophilic
52-72TGPKDDPSKHQGRRRTRPYVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-42RRRNSKRENESKALPTAKRQKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MPLVDYNSSSSSEDATGGSARRRNSKRENESKALPTAKRQKKLPSLPETFDTGPKDDPSKHQGRRRTRPYVDGEYNAHLYLSLKIPSGFRTVLEDVLSVFQEEVPSHKIHSLLSSLHISLTHPLPLRRHQIDPLRAALADRLRSTRRSFRMSLASEIKVYYNRSTSTNAAASSAALRAEGEGSGGRAFIALRVGAGANELEDILDQIIHPLLEIYHLPKYHENPEFHTSFGWTLLQPTLDRASSEVIPNTMNPDGAAMVSEDTNAFIEETSDVRNEDHIRHSPFTDEMIKRINTVFREKIMDKQPQGGWEVDRVYLKAAKEVHVLHLGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.22
6 0.24
7 0.27
8 0.36
9 0.41
10 0.49
11 0.57
12 0.66
13 0.71
14 0.77
15 0.82
16 0.79
17 0.8
18 0.76
19 0.72
20 0.69
21 0.6
22 0.59
23 0.61
24 0.64
25 0.64
26 0.65
27 0.67
28 0.7
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.74
33 0.71
34 0.67
35 0.63
36 0.54
37 0.5
38 0.43
39 0.35
40 0.31
41 0.3
42 0.31
43 0.28
44 0.32
45 0.36
46 0.43
47 0.49
48 0.54
49 0.61
50 0.68
51 0.76
52 0.8
53 0.82
54 0.76
55 0.75
56 0.76
57 0.76
58 0.69
59 0.62
60 0.56
61 0.49
62 0.46
63 0.38
64 0.3
65 0.2
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.19
75 0.17
76 0.15
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.17
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.14
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.14
110 0.17
111 0.2
112 0.25
113 0.33
114 0.33
115 0.34
116 0.37
117 0.43
118 0.45
119 0.44
120 0.41
121 0.34
122 0.31
123 0.29
124 0.26
125 0.21
126 0.17
127 0.16
128 0.18
129 0.19
130 0.22
131 0.26
132 0.32
133 0.34
134 0.37
135 0.38
136 0.38
137 0.44
138 0.42
139 0.43
140 0.38
141 0.34
142 0.29
143 0.28
144 0.25
145 0.19
146 0.19
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.18
206 0.21
207 0.28
208 0.34
209 0.33
210 0.35
211 0.4
212 0.39
213 0.35
214 0.32
215 0.26
216 0.2
217 0.19
218 0.15
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.17
237 0.15
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.16
262 0.18
263 0.2
264 0.25
265 0.3
266 0.35
267 0.36
268 0.36
269 0.34
270 0.33
271 0.34
272 0.37
273 0.31
274 0.29
275 0.33
276 0.33
277 0.32
278 0.34
279 0.35
280 0.3
281 0.37
282 0.37
283 0.34
284 0.41
285 0.4
286 0.46
287 0.49
288 0.54
289 0.48
290 0.51
291 0.5
292 0.46
293 0.48
294 0.42
295 0.36
296 0.31
297 0.31
298 0.27
299 0.27
300 0.24
301 0.25
302 0.26
303 0.25
304 0.26
305 0.26
306 0.26
307 0.29
308 0.31
309 0.31