Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A5C6

Protein Details
Accession A0A1A6A5C6    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-140IELKKPPSPKLEHKGKEKDTBasic
216-239DQSKICQNCKRPGHRSKDCKHIICHydrophilic
679-700APTPSSRSTKGKRKAKNADDADHydrophilic
765-792GSGSAGKAKKSKKAKNKNKTTPQGSSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-473RGR
531-570PGHSYRHPRSAHRDRSRSPPSRPRDKARAIERSRNRDRDR
685-694RSTKGKRKAK
760-783GGGGGGSGSAGKAKKSKKAKNKNK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSRTASAGPSRHSSPAPHTSTSSCFTPLPRSLLSGTGIRFSPSPPPDAGPSKPPRSPSFEPGEIKESALGRDIFIDEIPQQSRPPSPNSPDTSSNNHFQPPGLFTTSLMPSVRQTDDGPSIELKKPPSPKLEHKGKEKDTQEVGSALLLPSHVLVDSVTPSKGEEEKLAINEEGGEDLMEGVFFVDDDISKGSKRYFDPEEDETKEVEATFLATADQSKICQNCKRPGHRSKDCKHIICTTCGAEDSHERRDCPVGLVCFGCGSRGHRKQDCPDPVSRMSRRTGCDRCGSRDHMENTCHTIWRVYAYLSHDVRAEIIKDKYAADGWEREAIGGRASEEWCYNCAREGHLGDDCSKRRGSLAKLTVPSAFSHEMASRGPFFTSSSRRNADLPPPIHSRFDLDDEQDDYDSLPFISGGYKNFGGSNAGKKTRQKEKARQMGMAQNDSSDGDPSWFDSASTPGSRGRGRGLNIRGRGRRGNTYSYSTPDNRNGNGNINGRRPWDSEYREPFRDRDRDRGRENGFDRSSAPGPGPGHSYRHPRSAHRDRSRSPPSRPRDKARAIERSRNRDRDRVGEGGGGGKMPFSHGHLMDPSIPSSAPPKVSFGKLSDPGSRSSEGDRPGNSNGAKSLINRVLGGPGSGGKSDDGSRNSTPSRSGAKETVNTSVGGRKIPIVEIPSPKAAPTPSSRSTKGKRKAKNADDADGQGERDWENEWRKEGNGGGKVQHWGKEIDDEMKQLNGGLKIKGKARSGELNSALGAGGGGGGGGGSGSAGKAKKSKKAKNKNKTTPQGSSAGQEQGQGQGQGQGQGSSKAGNSGQRYHGGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.48
4 0.45
5 0.45
6 0.44
7 0.47
8 0.47
9 0.41
10 0.34
11 0.31
12 0.31
13 0.36
14 0.37
15 0.38
16 0.35
17 0.36
18 0.34
19 0.35
20 0.35
21 0.31
22 0.27
23 0.25
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.28
29 0.26
30 0.29
31 0.27
32 0.3
33 0.35
34 0.4
35 0.41
36 0.42
37 0.49
38 0.52
39 0.54
40 0.57
41 0.55
42 0.59
43 0.62
44 0.59
45 0.59
46 0.59
47 0.6
48 0.58
49 0.56
50 0.48
51 0.43
52 0.39
53 0.31
54 0.24
55 0.25
56 0.22
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.12
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.21
69 0.27
70 0.28
71 0.34
72 0.37
73 0.42
74 0.5
75 0.55
76 0.57
77 0.58
78 0.59
79 0.61
80 0.57
81 0.56
82 0.5
83 0.46
84 0.41
85 0.35
86 0.34
87 0.29
88 0.29
89 0.27
90 0.24
91 0.22
92 0.27
93 0.27
94 0.27
95 0.24
96 0.2
97 0.19
98 0.23
99 0.24
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.27
104 0.27
105 0.27
106 0.26
107 0.29
108 0.31
109 0.33
110 0.32
111 0.34
112 0.4
113 0.44
114 0.49
115 0.52
116 0.58
117 0.65
118 0.72
119 0.73
120 0.76
121 0.8
122 0.78
123 0.79
124 0.71
125 0.68
126 0.61
127 0.55
128 0.47
129 0.37
130 0.32
131 0.23
132 0.22
133 0.14
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.17
153 0.2
154 0.21
155 0.23
156 0.2
157 0.18
158 0.16
159 0.15
160 0.12
161 0.09
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.17
181 0.19
182 0.24
183 0.26
184 0.3
185 0.35
186 0.39
187 0.43
188 0.42
189 0.41
190 0.36
191 0.32
192 0.28
193 0.22
194 0.17
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.13
206 0.16
207 0.22
208 0.28
209 0.34
210 0.42
211 0.51
212 0.6
213 0.65
214 0.72
215 0.77
216 0.81
217 0.84
218 0.8
219 0.82
220 0.8
221 0.75
222 0.69
223 0.68
224 0.6
225 0.54
226 0.51
227 0.41
228 0.34
229 0.3
230 0.26
231 0.19
232 0.25
233 0.25
234 0.31
235 0.31
236 0.31
237 0.32
238 0.35
239 0.33
240 0.28
241 0.28
242 0.21
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.14
249 0.11
250 0.15
251 0.23
252 0.31
253 0.38
254 0.43
255 0.48
256 0.54
257 0.62
258 0.65
259 0.59
260 0.56
261 0.54
262 0.54
263 0.57
264 0.54
265 0.47
266 0.44
267 0.45
268 0.45
269 0.48
270 0.47
271 0.43
272 0.48
273 0.48
274 0.48
275 0.49
276 0.5
277 0.45
278 0.47
279 0.47
280 0.43
281 0.41
282 0.37
283 0.38
284 0.34
285 0.31
286 0.24
287 0.21
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.11
292 0.13
293 0.16
294 0.23
295 0.23
296 0.23
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.18
301 0.16
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.24
339 0.24
340 0.23
341 0.22
342 0.2
343 0.2
344 0.24
345 0.25
346 0.27
347 0.32
348 0.35
349 0.36
350 0.37
351 0.36
352 0.32
353 0.28
354 0.24
355 0.19
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.1
367 0.14
368 0.2
369 0.22
370 0.27
371 0.28
372 0.29
373 0.31
374 0.32
375 0.33
376 0.34
377 0.32
378 0.31
379 0.35
380 0.35
381 0.34
382 0.31
383 0.28
384 0.22
385 0.25
386 0.21
387 0.17
388 0.17
389 0.17
390 0.17
391 0.15
392 0.13
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.12
410 0.18
411 0.2
412 0.23
413 0.25
414 0.3
415 0.36
416 0.43
417 0.52
418 0.55
419 0.6
420 0.68
421 0.74
422 0.72
423 0.67
424 0.6
425 0.55
426 0.49
427 0.41
428 0.3
429 0.21
430 0.19
431 0.18
432 0.15
433 0.1
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.15
448 0.15
449 0.16
450 0.18
451 0.19
452 0.21
453 0.27
454 0.32
455 0.36
456 0.41
457 0.47
458 0.46
459 0.46
460 0.49
461 0.45
462 0.46
463 0.43
464 0.43
465 0.38
466 0.41
467 0.39
468 0.37
469 0.38
470 0.33
471 0.33
472 0.34
473 0.34
474 0.29
475 0.32
476 0.31
477 0.31
478 0.35
479 0.37
480 0.35
481 0.35
482 0.35
483 0.34
484 0.35
485 0.32
486 0.29
487 0.31
488 0.33
489 0.38
490 0.44
491 0.48
492 0.49
493 0.5
494 0.48
495 0.47
496 0.51
497 0.46
498 0.48
499 0.52
500 0.55
501 0.56
502 0.62
503 0.58
504 0.57
505 0.56
506 0.54
507 0.46
508 0.4
509 0.38
510 0.33
511 0.31
512 0.24
513 0.22
514 0.18
515 0.18
516 0.18
517 0.22
518 0.19
519 0.22
520 0.26
521 0.35
522 0.33
523 0.4
524 0.42
525 0.42
526 0.51
527 0.58
528 0.64
529 0.65
530 0.7
531 0.66
532 0.73
533 0.78
534 0.75
535 0.73
536 0.72
537 0.71
538 0.74
539 0.77
540 0.75
541 0.75
542 0.75
543 0.75
544 0.74
545 0.76
546 0.71
547 0.74
548 0.74
549 0.75
550 0.76
551 0.78
552 0.73
553 0.69
554 0.66
555 0.62
556 0.59
557 0.51
558 0.43
559 0.35
560 0.3
561 0.26
562 0.22
563 0.17
564 0.11
565 0.09
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.14
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.18
575 0.19
576 0.19
577 0.17
578 0.14
579 0.13
580 0.12
581 0.15
582 0.16
583 0.17
584 0.17
585 0.2
586 0.22
587 0.25
588 0.27
589 0.26
590 0.3
591 0.31
592 0.34
593 0.36
594 0.35
595 0.35
596 0.36
597 0.35
598 0.3
599 0.29
600 0.3
601 0.28
602 0.3
603 0.29
604 0.29
605 0.29
606 0.33
607 0.3
608 0.26
609 0.23
610 0.22
611 0.22
612 0.19
613 0.25
614 0.23
615 0.23
616 0.23
617 0.22
618 0.22
619 0.21
620 0.2
621 0.13
622 0.11
623 0.12
624 0.12
625 0.12
626 0.1
627 0.11
628 0.14
629 0.19
630 0.19
631 0.23
632 0.24
633 0.28
634 0.3
635 0.29
636 0.29
637 0.28
638 0.32
639 0.3
640 0.34
641 0.34
642 0.37
643 0.4
644 0.4
645 0.4
646 0.34
647 0.32
648 0.28
649 0.28
650 0.25
651 0.21
652 0.2
653 0.17
654 0.17
655 0.18
656 0.19
657 0.19
658 0.24
659 0.28
660 0.3
661 0.32
662 0.31
663 0.3
664 0.3
665 0.26
666 0.25
667 0.27
668 0.31
669 0.34
670 0.4
671 0.45
672 0.51
673 0.59
674 0.66
675 0.69
676 0.71
677 0.74
678 0.78
679 0.85
680 0.84
681 0.85
682 0.79
683 0.74
684 0.69
685 0.61
686 0.54
687 0.44
688 0.36
689 0.26
690 0.23
691 0.17
692 0.14
693 0.14
694 0.18
695 0.24
696 0.27
697 0.3
698 0.3
699 0.31
700 0.33
701 0.35
702 0.36
703 0.34
704 0.34
705 0.32
706 0.33
707 0.37
708 0.38
709 0.37
710 0.32
711 0.27
712 0.26
713 0.29
714 0.29
715 0.28
716 0.27
717 0.25
718 0.24
719 0.23
720 0.22
721 0.18
722 0.2
723 0.2
724 0.21
725 0.23
726 0.27
727 0.31
728 0.37
729 0.42
730 0.42
731 0.4
732 0.43
733 0.49
734 0.49
735 0.53
736 0.5
737 0.45
738 0.41
739 0.37
740 0.31
741 0.22
742 0.16
743 0.08
744 0.05
745 0.03
746 0.03
747 0.02
748 0.02
749 0.02
750 0.02
751 0.02
752 0.02
753 0.02
754 0.03
755 0.08
756 0.09
757 0.13
758 0.21
759 0.26
760 0.36
761 0.46
762 0.57
763 0.64
764 0.74
765 0.83
766 0.86
767 0.93
768 0.95
769 0.95
770 0.95
771 0.92
772 0.88
773 0.81
774 0.75
775 0.65
776 0.57
777 0.5
778 0.44
779 0.36
780 0.31
781 0.27
782 0.26
783 0.27
784 0.24
785 0.21
786 0.21
787 0.22
788 0.24
789 0.24
790 0.23
791 0.21
792 0.23
793 0.23
794 0.19
795 0.19
796 0.19
797 0.21
798 0.25
799 0.29
800 0.33
801 0.37
802 0.41