Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6AFW1

Protein Details
Accession A0A1A6AFW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78FDQLLSKSRKNLKGKGKEREKIVHydrophilic
445-467GISLNQQKKADKRQRLEERDEKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-75SRKNLKGKGKERE
483-503KGGLGKGSKTGEAGKFARSRR
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 5.5, cyto_nucl 4.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR023179  GTP-bd_ortho_bundle_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
CDD cd00882  Ras_like_GTPase  
cd01856  YlqF  
Amino Acid Sequences MSFVRPIFPYPAKIPSWFAGHMSRSLRELPTLLENIDLVIEARDARLPLTSINSAFDQLLSKSRKNLKGKGKEREKIVVYTKRDLAERRFEEPLRKAFEQHADQKIMFADTRSDKDVRDVLKHAVRIAKDNAEIIPDLRVLVIGMPNVGKSSLLNALRRVGLRKGKAFRTGAEAGITRKLTGTVKIYDEPSVYVYDTPGVMVPYLGRGVEGAEKGLKLALTAGIKESLFEQDAMVDYLLWKLNKRLVAVSSLDDNDPKKHKSYLSLLPLPPDFQPTDDLPTLLDALSERLGFLQKGGEKDHDATCNWLIRAFREGKLGEFTLDDLVPPGTPIMNQPSQRENDIDQSVPYLRIPSTETDPSSASDPISATTPEPVSSSTPDLRNQGEEIPLSASTPNDTDLDKKVSQAVQAYLFANANTNTQTKSLSSDASRGAAASSSSSGPGVGISLNQQKKADKRQRLEERDEKLRAKGINVPQRTWTNAKGGLGKGSKTGEAGKFARSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.38
3 0.4
4 0.35
5 0.35
6 0.34
7 0.34
8 0.38
9 0.37
10 0.36
11 0.33
12 0.36
13 0.34
14 0.3
15 0.29
16 0.25
17 0.27
18 0.27
19 0.24
20 0.21
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.17
37 0.19
38 0.18
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.16
45 0.15
46 0.23
47 0.26
48 0.27
49 0.34
50 0.44
51 0.52
52 0.58
53 0.66
54 0.68
55 0.73
56 0.81
57 0.83
58 0.85
59 0.81
60 0.78
61 0.77
62 0.7
63 0.66
64 0.65
65 0.63
66 0.58
67 0.58
68 0.56
69 0.51
70 0.51
71 0.5
72 0.47
73 0.49
74 0.47
75 0.46
76 0.48
77 0.48
78 0.51
79 0.52
80 0.53
81 0.5
82 0.47
83 0.45
84 0.44
85 0.49
86 0.49
87 0.5
88 0.5
89 0.45
90 0.44
91 0.44
92 0.39
93 0.33
94 0.27
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.22
99 0.25
100 0.26
101 0.24
102 0.27
103 0.32
104 0.29
105 0.29
106 0.29
107 0.31
108 0.35
109 0.35
110 0.34
111 0.34
112 0.32
113 0.32
114 0.33
115 0.3
116 0.27
117 0.27
118 0.24
119 0.21
120 0.21
121 0.16
122 0.14
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.05
138 0.08
139 0.14
140 0.17
141 0.19
142 0.2
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.27
147 0.27
148 0.3
149 0.33
150 0.39
151 0.43
152 0.45
153 0.51
154 0.49
155 0.43
156 0.43
157 0.4
158 0.33
159 0.29
160 0.27
161 0.21
162 0.24
163 0.23
164 0.16
165 0.14
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.17
171 0.2
172 0.21
173 0.22
174 0.21
175 0.21
176 0.18
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.07
204 0.05
205 0.05
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.2
247 0.21
248 0.24
249 0.29
250 0.32
251 0.36
252 0.4
253 0.38
254 0.38
255 0.37
256 0.34
257 0.28
258 0.23
259 0.17
260 0.12
261 0.14
262 0.13
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.1
270 0.09
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.1
281 0.11
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.19
287 0.22
288 0.2
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.22
293 0.2
294 0.2
295 0.17
296 0.16
297 0.22
298 0.22
299 0.21
300 0.23
301 0.23
302 0.22
303 0.24
304 0.24
305 0.18
306 0.15
307 0.15
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.12
320 0.18
321 0.2
322 0.23
323 0.28
324 0.29
325 0.31
326 0.31
327 0.27
328 0.27
329 0.27
330 0.25
331 0.2
332 0.21
333 0.2
334 0.18
335 0.17
336 0.13
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.14
341 0.18
342 0.21
343 0.21
344 0.21
345 0.22
346 0.22
347 0.23
348 0.21
349 0.16
350 0.13
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.19
364 0.21
365 0.24
366 0.26
367 0.29
368 0.28
369 0.28
370 0.27
371 0.25
372 0.22
373 0.2
374 0.18
375 0.16
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.14
386 0.17
387 0.23
388 0.22
389 0.22
390 0.25
391 0.25
392 0.27
393 0.27
394 0.26
395 0.22
396 0.24
397 0.23
398 0.21
399 0.2
400 0.18
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.16
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.15
410 0.19
411 0.19
412 0.21
413 0.21
414 0.24
415 0.24
416 0.24
417 0.23
418 0.19
419 0.18
420 0.14
421 0.13
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.11
434 0.21
435 0.24
436 0.27
437 0.3
438 0.35
439 0.43
440 0.54
441 0.59
442 0.6
443 0.64
444 0.72
445 0.81
446 0.83
447 0.85
448 0.82
449 0.8
450 0.79
451 0.78
452 0.7
453 0.63
454 0.6
455 0.52
456 0.46
457 0.47
458 0.48
459 0.51
460 0.52
461 0.51
462 0.52
463 0.54
464 0.57
465 0.53
466 0.47
467 0.44
468 0.43
469 0.45
470 0.44
471 0.41
472 0.44
473 0.42
474 0.4
475 0.37
476 0.36
477 0.33
478 0.3
479 0.35
480 0.29
481 0.34
482 0.34
483 0.38