Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A341

Protein Details
Accession A0A1A6A341    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26STNLTKKQQKLAAFRNKQKAKKAGAHydrophilic
54-77AVKSSEKSSKKEKEKSKAKDQEDEHydrophilic
339-359GGNPKFQKKKWTPTGANAQPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-70SKKEKEKSK
95-100KGKKRK
112-116KKKTK
216-217RK
261-273KTRVRGGRRVKSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSTNLTKKQQKLAAFRNKQKAKKAGANDIDQPDLPEQDLLDDNEEVPDEDAAVAVKSSEKSSKKEKEKSKAKDQEDEVAPPQAEGSTDSAKPVDKGKKRKTAWDEEEEGADKKKTKKDVKQRFILFVGNLSFKTTKEEVQEHFKEALGQLPSVRLLTTKPTPQNPKTKSRGIAFLELPNSSLMQAALKLHHSNLKGRTINVELTAGGGGNSEDRKRKLAERNERVGVQREKRAEREKEEGGEQDDNVAGQGEDAGEQKEGKTRVRGGRRVKSKSKTSDDSTPSTKQPRYDPSDPNAPLSGWASRQAGTVSAAPSRSFNSARPPRGNNAGGRPQGGGGNGGNPKFQKKKWTPTGANAQPVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.81
3 0.83
4 0.85
5 0.84
6 0.84
7 0.83
8 0.8
9 0.78
10 0.76
11 0.76
12 0.73
13 0.71
14 0.69
15 0.63
16 0.56
17 0.48
18 0.43
19 0.34
20 0.28
21 0.24
22 0.17
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.15
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.05
42 0.07
43 0.08
44 0.11
45 0.19
46 0.23
47 0.28
48 0.38
49 0.48
50 0.56
51 0.65
52 0.72
53 0.75
54 0.81
55 0.85
56 0.86
57 0.86
58 0.8
59 0.79
60 0.72
61 0.7
62 0.63
63 0.58
64 0.48
65 0.43
66 0.38
67 0.29
68 0.26
69 0.17
70 0.15
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.23
80 0.29
81 0.34
82 0.45
83 0.54
84 0.63
85 0.65
86 0.73
87 0.74
88 0.75
89 0.73
90 0.7
91 0.65
92 0.55
93 0.55
94 0.47
95 0.4
96 0.31
97 0.26
98 0.24
99 0.25
100 0.3
101 0.37
102 0.45
103 0.53
104 0.62
105 0.72
106 0.76
107 0.79
108 0.77
109 0.71
110 0.63
111 0.56
112 0.45
113 0.36
114 0.3
115 0.22
116 0.19
117 0.18
118 0.16
119 0.14
120 0.2
121 0.18
122 0.19
123 0.21
124 0.25
125 0.25
126 0.33
127 0.34
128 0.32
129 0.31
130 0.29
131 0.25
132 0.22
133 0.23
134 0.15
135 0.14
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.07
142 0.07
143 0.11
144 0.14
145 0.2
146 0.23
147 0.3
148 0.38
149 0.44
150 0.53
151 0.54
152 0.59
153 0.59
154 0.6
155 0.58
156 0.52
157 0.53
158 0.46
159 0.45
160 0.37
161 0.34
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.17
166 0.14
167 0.1
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.13
178 0.14
179 0.19
180 0.22
181 0.28
182 0.28
183 0.27
184 0.3
185 0.27
186 0.27
187 0.23
188 0.2
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.07
198 0.09
199 0.13
200 0.15
201 0.18
202 0.2
203 0.27
204 0.35
205 0.44
206 0.53
207 0.57
208 0.62
209 0.62
210 0.62
211 0.56
212 0.55
213 0.52
214 0.46
215 0.43
216 0.43
217 0.44
218 0.49
219 0.56
220 0.53
221 0.5
222 0.52
223 0.48
224 0.44
225 0.43
226 0.38
227 0.33
228 0.28
229 0.23
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.06
236 0.04
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.21
249 0.28
250 0.36
251 0.45
252 0.54
253 0.58
254 0.65
255 0.72
256 0.77
257 0.78
258 0.78
259 0.78
260 0.79
261 0.77
262 0.74
263 0.7
264 0.7
265 0.66
266 0.63
267 0.59
268 0.54
269 0.52
270 0.53
271 0.5
272 0.45
273 0.47
274 0.5
275 0.54
276 0.58
277 0.58
278 0.55
279 0.63
280 0.6
281 0.56
282 0.48
283 0.39
284 0.33
285 0.29
286 0.27
287 0.18
288 0.21
289 0.2
290 0.19
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.19
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.2
302 0.23
303 0.22
304 0.23
305 0.31
306 0.4
307 0.48
308 0.53
309 0.56
310 0.57
311 0.63
312 0.66
313 0.6
314 0.6
315 0.6
316 0.55
317 0.52
318 0.47
319 0.4
320 0.37
321 0.31
322 0.25
323 0.17
324 0.21
325 0.24
326 0.24
327 0.27
328 0.27
329 0.35
330 0.4
331 0.43
332 0.47
333 0.52
334 0.62
335 0.69
336 0.78
337 0.75
338 0.77
339 0.85
340 0.8