Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JTM6

Protein Details
Accession I2JTM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
418-465GRGMDRSRDRERNRERDRDRDRDRRSDRDRDRERDRDRERDRDRRSDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-510GRGMXDRSRDRERNRERDRDRDRDRRSDRDRDRERDRDRERDRDRRSDIGRRRDGDNYRDRRSNRGPDYDRDRGVKRGRGQXSG
515-522DRSAKRPR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
Amino Acid Sequences MNDYSKLERIPLPVRKSAGPGMKSLALEWNTEGTYLAYTWSDKSIFVSKFDPIKCTCEESMNYANAAPKQINSISWNPRAPTQFATTSNDNXIRXFSIEDSSIVFASEYVSDSVAEFTNVKFSPDGEYLAAFSTKKAITVFEVDEKFGVPKFVXVATSPYLSRFRDFDWSYTGHRILVGDSCGFVDVFELVXKDGKMELSTTKKGTHISSCAIGKICSRDSAKWFSLVLDNSEVLLVDTEYMVVVKQFSNFGSLSTVRLLDSKLLTXGQNAFEGIDGTSITGEAELDDPYGKIVFAVCPTYGGHTILFDSEQSKPGDAAQSMKQLEYDMFRFNPVNPKISAGIRGLTVNALVPGDSVGGKNXRKQENEKQKMEQKIEQKDQNRKREREDSXDRYYXYNSMAADRDRQXSRKYERERDIQRGGDGRYGRGMXDRSRDRERNRERDRDRDRDRRSDRDRDRERDRDRERDRDRRSDIGRRRDGDNYRDRRSNRGPDYDRDRGVKRGRGQXSGGYHSDRSAKRPRLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.52
4 0.54
5 0.53
6 0.46
7 0.42
8 0.41
9 0.41
10 0.39
11 0.36
12 0.35
13 0.28
14 0.28
15 0.27
16 0.25
17 0.21
18 0.21
19 0.2
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.12
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.18
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.28
35 0.3
36 0.37
37 0.38
38 0.39
39 0.34
40 0.37
41 0.37
42 0.4
43 0.37
44 0.35
45 0.35
46 0.37
47 0.4
48 0.37
49 0.35
50 0.3
51 0.32
52 0.28
53 0.29
54 0.23
55 0.18
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.31
61 0.36
62 0.42
63 0.45
64 0.41
65 0.46
66 0.47
67 0.44
68 0.4
69 0.38
70 0.36
71 0.36
72 0.41
73 0.38
74 0.39
75 0.43
76 0.43
77 0.39
78 0.34
79 0.32
80 0.27
81 0.26
82 0.25
83 0.19
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.19
109 0.19
110 0.21
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.11
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.18
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.21
131 0.2
132 0.16
133 0.15
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.16
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.27
150 0.26
151 0.25
152 0.26
153 0.28
154 0.29
155 0.32
156 0.3
157 0.21
158 0.21
159 0.19
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.25
189 0.25
190 0.22
191 0.21
192 0.23
193 0.22
194 0.22
195 0.21
196 0.19
197 0.17
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.2
202 0.21
203 0.25
204 0.3
205 0.29
206 0.27
207 0.27
208 0.23
209 0.24
210 0.22
211 0.19
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.07
218 0.07
219 0.05
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.14
300 0.16
301 0.15
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.17
307 0.18
308 0.17
309 0.16
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.26
316 0.25
317 0.26
318 0.24
319 0.26
320 0.26
321 0.26
322 0.28
323 0.19
324 0.18
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.11
329 0.11
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.11
340 0.17
341 0.19
342 0.26
343 0.33
344 0.39
345 0.45
346 0.54
347 0.6
348 0.65
349 0.68
350 0.68
351 0.69
352 0.7
353 0.69
354 0.65
355 0.62
356 0.61
357 0.63
358 0.63
359 0.64
360 0.68
361 0.72
362 0.76
363 0.78
364 0.73
365 0.73
366 0.75
367 0.74
368 0.74
369 0.74
370 0.7
371 0.68
372 0.67
373 0.62
374 0.55
375 0.48
376 0.39
377 0.32
378 0.25
379 0.21
380 0.2
381 0.24
382 0.25
383 0.34
384 0.37
385 0.38
386 0.44
387 0.5
388 0.58
389 0.62
390 0.69
391 0.66
392 0.72
393 0.76
394 0.77
395 0.74
396 0.67
397 0.59
398 0.55
399 0.49
400 0.45
401 0.39
402 0.32
403 0.3
404 0.29
405 0.26
406 0.28
407 0.3
408 0.31
409 0.4
410 0.47
411 0.52
412 0.61
413 0.65
414 0.69
415 0.76
416 0.79
417 0.79
418 0.82
419 0.78
420 0.79
421 0.83
422 0.83
423 0.83
424 0.82
425 0.81
426 0.81
427 0.83
428 0.82
429 0.81
430 0.82
431 0.81
432 0.82
433 0.84
434 0.81
435 0.84
436 0.83
437 0.83
438 0.82
439 0.8
440 0.8
441 0.78
442 0.8
443 0.8
444 0.81
445 0.81
446 0.8
447 0.79
448 0.77
449 0.77
450 0.77
451 0.77
452 0.77
453 0.78
454 0.71
455 0.69
456 0.69
457 0.69
458 0.68
459 0.69
460 0.66
461 0.65
462 0.7
463 0.68
464 0.68
465 0.71
466 0.72
467 0.69
468 0.71
469 0.69
470 0.7
471 0.77
472 0.76
473 0.72
474 0.67
475 0.63
476 0.61
477 0.64
478 0.63
479 0.63
480 0.65
481 0.65
482 0.63
483 0.63
484 0.61
485 0.61
486 0.61
487 0.55
488 0.48
489 0.44
490 0.49
491 0.49
492 0.49
493 0.51