FuNGI

A0A1A5ZY49

Protein Details

Accession

A0A1A5ZY49

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-102	GVQRMKFKPKVPIRRVKQEVD	Hydrophilic
226-255	KKAKGKDEKQEKQSKKKSKSKLKSKAAETD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
119-140	RGGAARGAPRGRGGPGRGRGRG
225-250	DKKAKGKDEKQEKQSKKKSKSKLKSK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSAPTRSKPSLIAAAQRQGQPSQPQAQAQSTSTSNQLIPSNLASIPMSTVSSSQSGSGAGSISARSTPAPGARAEGSVPPGGVQRMKFKPKVPIRRVKQEVDVKPDVSSIPTASPSAARGGAARGAPRGRGGPGRGRGRGNAPSTSIAAGVFGGPRPVAAASSSRRFAAAAAPTTRGYDEQDAEVYSDHSDTEGGAGRPIDIDLVSTMSESAPTSLFRDRRLNQDKKAKGKDEKQEKQSKKKSKSKLKSKAAETDDVALDVDPDLPRVKDEPISPEKRAAPLREDDTMLSDDELQDRDDQGRRVRNFAQTGGNDSPLNEDEDEEEVNEAQMVDLSESEEEEEEEDMEGDFVQAEGFDNPEEKLFIFQFPHLFPKFLPSTPVDLTQTDTKPDITASTTASTNGTAHSATNGPLKDVKPDIKPDVKPTPAQLRAGAKKGPEPVPEGRVGTMVVMKSGKVKIVMGKDIVMNVTPGLPTTFIQHLVHLEHKTKSAQVLGEIHKNYIVTPDIDRLLEELYINGGQTPGEVETERRKRLLRENRGLVAMKKERD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.51
3	0.52
4	0.49
5	0.42
6	0.44
7	0.42
8	0.42
9	0.44
10	0.43
11	0.43
12	0.45
13	0.47
14	0.45
15	0.41
16	0.38
17	0.32
18	0.3
19	0.29
20	0.27
21	0.23
22	0.23
23	0.24
24	0.21
25	0.22
26	0.22
27	0.22
28	0.19
29	0.2
30	0.17
31	0.15
32	0.15
33	0.14
34	0.13
35	0.11
36	0.12
37	0.13
38	0.14
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.09
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.09
53	0.11
54	0.14
55	0.16
56	0.18
57	0.18
58	0.21
59	0.21
60	0.22
61	0.22
62	0.21
63	0.2
64	0.19
65	0.19
66	0.16
67	0.16
68	0.18
69	0.2
70	0.2
71	0.26
72	0.34
73	0.42
74	0.46
75	0.48
76	0.56
77	0.63
78	0.72
79	0.73
80	0.75
81	0.75
82	0.82
83	0.84
84	0.77
85	0.76
86	0.75
87	0.71
88	0.68
89	0.64
90	0.54
91	0.48
92	0.44
93	0.35
94	0.27
95	0.22
96	0.15
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.14
102	0.13
103	0.14
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.12
108	0.15
109	0.16
110	0.16
111	0.18
112	0.19
113	0.19
114	0.2
115	0.2
116	0.2
117	0.23
118	0.26
119	0.3
120	0.38
121	0.44
122	0.47
123	0.47
124	0.47
125	0.48
126	0.51
127	0.46
128	0.39
129	0.34
130	0.32
131	0.31
132	0.29
133	0.23
134	0.16
135	0.12
136	0.1
137	0.08
138	0.07
139	0.06
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.07
147	0.12
148	0.16
149	0.2
150	0.22
151	0.21
152	0.21
153	0.2
154	0.2
155	0.2
156	0.2
157	0.21
158	0.21
159	0.23
160	0.24
161	0.24
162	0.24
163	0.2
164	0.18
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.14
171	0.14
172	0.12
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.07
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.09
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.09
202	0.14
203	0.16
204	0.19
205	0.28
206	0.28
207	0.39
208	0.48
209	0.52
210	0.54
211	0.62
212	0.65
213	0.66
214	0.71
215	0.68
216	0.65
217	0.67
218	0.69
219	0.7
220	0.71
221	0.71
222	0.74
223	0.74
224	0.78
225	0.8
226	0.8
227	0.8
228	0.81
229	0.83
230	0.83
231	0.87
232	0.88
233	0.88
234	0.88
235	0.85
236	0.8
237	0.79
238	0.7
239	0.63
240	0.52
241	0.44
242	0.34
243	0.26
244	0.22
245	0.13
246	0.1
247	0.07
248	0.08
249	0.05
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.07
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.12
258	0.18
259	0.25
260	0.29
261	0.29
262	0.32
263	0.32
264	0.34
265	0.36
266	0.31
267	0.26
268	0.25
269	0.27
270	0.24
271	0.24
272	0.2
273	0.19
274	0.18
275	0.15
276	0.12
277	0.1
278	0.08
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.07
283	0.08
284	0.1
285	0.13
286	0.15
287	0.19
288	0.27
289	0.27
290	0.31
291	0.33
292	0.36
293	0.35
294	0.35
295	0.35
296	0.28
297	0.33
298	0.3
299	0.28
300	0.23
301	0.21
302	0.21
303	0.16
304	0.17
305	0.11
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.15
355	0.16
356	0.23
357	0.21
358	0.21
359	0.19
360	0.25
361	0.26
362	0.24
363	0.26
364	0.21
365	0.25
366	0.26
367	0.29
368	0.24
369	0.22
370	0.24
371	0.27
372	0.26
373	0.23
374	0.23
375	0.2
376	0.19
377	0.18
378	0.16
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.11
395	0.16
396	0.15
397	0.16
398	0.2
399	0.21
400	0.23
401	0.27
402	0.3
403	0.3
404	0.35
405	0.4
406	0.44
407	0.46
408	0.48
409	0.52
410	0.51
411	0.48
412	0.48
413	0.51
414	0.47
415	0.47
416	0.44
417	0.45
418	0.47
419	0.49
420	0.46
421	0.38
422	0.38
423	0.43
424	0.42
425	0.36
426	0.37
427	0.37
428	0.38
429	0.4
430	0.36
431	0.3
432	0.26
433	0.24
434	0.19
435	0.18
436	0.14
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.16
441	0.17
442	0.18
443	0.16
444	0.18
445	0.21
446	0.26
447	0.29
448	0.26
449	0.26
450	0.25
451	0.25
452	0.24
453	0.19
454	0.14
455	0.11
456	0.11
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.13
463	0.15
464	0.17
465	0.18
466	0.19
467	0.2
468	0.23
469	0.28
470	0.28
471	0.3
472	0.28
473	0.31
474	0.31
475	0.31
476	0.3
477	0.28
478	0.25
479	0.26
480	0.32
481	0.33
482	0.39
483	0.38
484	0.36
485	0.34
486	0.33
487	0.28
488	0.25
489	0.22
490	0.16
491	0.18
492	0.21
493	0.22
494	0.22
495	0.22
496	0.19
497	0.18
498	0.17
499	0.14
500	0.1
501	0.11
502	0.12
503	0.11
504	0.11
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.1
509	0.08
510	0.1
511	0.11
512	0.15
513	0.26
514	0.34
515	0.38
516	0.41
517	0.44
518	0.49
519	0.59
520	0.66
521	0.66
522	0.68
523	0.72
524	0.72
525	0.73
526	0.7
527	0.62
528	0.62

A0A1A5ZY49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer