FuNGI

A0A1A6AA99

Protein Details

Accession

A0A1A6AA99

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-72	ISSSRTKHPSGKQKANAQAGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
535-542	KKKVVRGK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MSDHRMLEYEEEDDLFGNNEVHSNHAVPLVVNSAAPIASHLPSESTFGVAGISSSRTKHPSGKQKANAQAGPSTGRVYKNVDERLRELQEMRRGGRSDELSHQGGVRSLRTLCIGVVKTNSARIWDIGDLEYPLIKPLLDDMPIEQLQEVETNSPHIKKDTDWLYEIFMLQDYPLFHERCQDRHGVPRTSGWRRMYKKAKEDFAVRQTQAADRVAARYKQLEEEKASKRIVVMDKIMPDKKSPARGSGWGRNRLGGSGTGGLSSSVPKPQNAIAKARLEAQRARVAMTHASGKYIPPAPSKSKNEPNQLFKNPYLPQGFQQAAQQAVQGPGQGQGPRIPPPKLHAPRRPIQRVSSPSSPPSSIPGSYPTSQLNDIRQTLPPHLTHRASQSEETGKTAERSRLEGNQSKYKAVRKKAGEKFVVPELEKEKPKTKAPMVDFFAPSPSPTTASVKKMDKVDLGIKRKRQEEDQVHSVEKQKKQQEDSLTVIPPPAQIVTSPSQAVKPNSTVPRHPQSGQVTTSVSGPGPEVNSVLFRKKKVVRGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.12
3	0.11
4	0.1
5	0.09
6	0.12
7	0.12
8	0.15
9	0.17
10	0.17
11	0.17
12	0.18
13	0.18
14	0.15
15	0.17
16	0.16
17	0.14
18	0.12
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.1
25	0.11
26	0.12
27	0.12
28	0.13
29	0.14
30	0.17
31	0.16
32	0.14
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.1
37	0.1
38	0.08
39	0.11
40	0.12
41	0.14
42	0.18
43	0.22
44	0.25
45	0.34
46	0.42
47	0.5
48	0.58
49	0.67
50	0.71
51	0.76
52	0.81
53	0.81
54	0.74
55	0.66
56	0.58
57	0.5
58	0.45
59	0.37
60	0.31
61	0.26
62	0.26
63	0.25
64	0.28
65	0.31
66	0.36
67	0.44
68	0.46
69	0.46
70	0.48
71	0.53
72	0.51
73	0.47
74	0.42
75	0.41
76	0.44
77	0.45
78	0.44
79	0.42
80	0.4
81	0.4
82	0.43
83	0.4
84	0.36
85	0.36
86	0.39
87	0.34
88	0.34
89	0.33
90	0.27
91	0.27
92	0.24
93	0.2
94	0.17
95	0.16
96	0.17
97	0.17
98	0.17
99	0.14
100	0.19
101	0.19
102	0.18
103	0.2
104	0.22
105	0.21
106	0.25
107	0.25
108	0.21
109	0.21
110	0.19
111	0.2
112	0.18
113	0.18
114	0.15
115	0.15
116	0.13
117	0.12
118	0.13
119	0.1
120	0.1
121	0.09
122	0.08
123	0.07
124	0.09
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.17
130	0.17
131	0.18
132	0.15
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.13
137	0.08
138	0.08
139	0.12
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.18
145	0.17
146	0.25
147	0.27
148	0.28
149	0.28
150	0.28
151	0.28
152	0.27
153	0.27
154	0.19
155	0.14
156	0.1
157	0.08
158	0.09
159	0.08
160	0.11
161	0.16
162	0.17
163	0.16
164	0.24
165	0.26
166	0.27
167	0.3
168	0.3
169	0.28
170	0.36
171	0.43
172	0.39
173	0.38
174	0.41
175	0.47
176	0.48
177	0.53
178	0.49
179	0.51
180	0.53
181	0.61
182	0.65
183	0.64
184	0.68
185	0.68
186	0.67
187	0.61
188	0.61
189	0.58
190	0.55
191	0.54
192	0.44
193	0.39
194	0.36
195	0.34
196	0.31
197	0.25
198	0.2
199	0.14
200	0.17
201	0.18
202	0.18
203	0.18
204	0.17
205	0.17
206	0.22
207	0.24
208	0.24
209	0.25
210	0.32
211	0.34
212	0.37
213	0.36
214	0.3
215	0.28
216	0.3
217	0.3
218	0.24
219	0.23
220	0.21
221	0.23
222	0.28
223	0.3
224	0.25
225	0.23
226	0.27
227	0.28
228	0.34
229	0.32
230	0.31
231	0.31
232	0.37
233	0.42
234	0.45
235	0.49
236	0.48
237	0.47
238	0.45
239	0.42
240	0.36
241	0.31
242	0.22
243	0.16
244	0.11
245	0.11
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.11
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.16
257	0.22
258	0.23
259	0.26
260	0.25
261	0.26
262	0.27
263	0.31
264	0.3
265	0.27
266	0.27
267	0.27
268	0.27
269	0.26
270	0.26
271	0.21
272	0.2
273	0.18
274	0.17
275	0.18
276	0.13
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.15
281	0.18
282	0.19
283	0.18
284	0.23
285	0.28
286	0.36
287	0.42
288	0.46
289	0.51
290	0.56
291	0.63
292	0.64
293	0.66
294	0.65
295	0.64
296	0.6
297	0.52
298	0.51
299	0.42
300	0.42
301	0.38
302	0.31
303	0.28
304	0.29
305	0.29
306	0.23
307	0.24
308	0.2
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.1
316	0.08
317	0.09
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.13
322	0.15
323	0.22
324	0.25
325	0.25
326	0.24
327	0.28
328	0.38
329	0.43
330	0.51
331	0.52
332	0.55
333	0.61
334	0.71
335	0.74
336	0.66
337	0.62
338	0.61
339	0.59
340	0.59
341	0.58
342	0.5
343	0.46
344	0.45
345	0.42
346	0.33
347	0.31
348	0.27
349	0.22
350	0.2
351	0.21
352	0.23
353	0.23
354	0.25
355	0.22
356	0.22
357	0.24
358	0.25
359	0.25
360	0.25
361	0.26
362	0.26
363	0.28
364	0.28
365	0.29
366	0.31
367	0.29
368	0.29
369	0.34
370	0.34
371	0.32
372	0.35
373	0.37
374	0.36
375	0.35
376	0.35
377	0.34
378	0.33
379	0.32
380	0.28
381	0.24
382	0.23
383	0.26
384	0.27
385	0.22
386	0.26
387	0.27
388	0.32
389	0.38
390	0.43
391	0.44
392	0.48
393	0.49
394	0.49
395	0.5
396	0.53
397	0.53
398	0.54
399	0.57
400	0.56
401	0.65
402	0.7
403	0.74
404	0.7
405	0.64
406	0.61
407	0.58
408	0.54
409	0.44
410	0.4
411	0.35
412	0.38
413	0.4
414	0.41
415	0.43
416	0.42
417	0.47
418	0.51
419	0.53
420	0.54
421	0.55
422	0.59
423	0.58
424	0.59
425	0.55
426	0.47
427	0.44
428	0.35
429	0.31
430	0.25
431	0.21
432	0.17
433	0.18
434	0.24
435	0.27
436	0.31
437	0.37
438	0.39
439	0.42
440	0.43
441	0.43
442	0.39
443	0.38
444	0.42
445	0.44
446	0.49
447	0.52
448	0.56
449	0.59
450	0.63
451	0.63
452	0.6
453	0.62
454	0.62
455	0.63
456	0.64
457	0.62
458	0.58
459	0.57
460	0.59
461	0.56
462	0.53
463	0.54
464	0.54
465	0.57
466	0.6
467	0.64
468	0.64
469	0.61
470	0.61
471	0.57
472	0.51
473	0.44
474	0.39
475	0.33
476	0.25
477	0.21
478	0.16
479	0.11
480	0.1
481	0.15
482	0.18
483	0.2
484	0.22
485	0.21
486	0.24
487	0.3
488	0.34
489	0.33
490	0.33
491	0.39
492	0.45
493	0.49
494	0.52
495	0.55
496	0.6
497	0.61
498	0.58
499	0.58
500	0.57
501	0.58
502	0.53
503	0.47
504	0.4
505	0.36
506	0.36
507	0.29
508	0.22
509	0.16
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.15
514	0.14
515	0.13
516	0.19
517	0.22
518	0.3
519	0.32
520	0.33
521	0.42
522	0.48

A0A1A6AA99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer