Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A439

Protein Details
Accession A0A1A6A439    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-347TGTGTGEKKKTKKKRPAPVVEEEEVIDTKDKPKTKKKKKANANTNTAANHydrophilic
357-376EDPPAPPTAKKKKKAAAAAQHydrophilic
389-414SAAAPAPAKKKTQKKKKDGDGGAETKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-315KKKTKKKRPA
327-338KDKPKTKKKKKA
361-374APPTAKKKKKAAAA
391-410AAPAPAKKKTQKKKKDGDGG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVMKKSRRWEPSLTVQLFSSHWRFENSPMTFQYEGDMKPFLLALRSQVIPASLIRFLYNIQPPISFVDGCLVVEIQDYRKSPETRSRVVMRPAAETLAQTIDVMLERKGQNLDEGMGLELESRIIAATSPPLYLGTSILATRNATLALALTSPAGTNLASDGSIHHTSSNGDGGSGDSKTSDRMSRLLRAGINHRTGSATISGGAATSGIGNGGGFQPAWNVLRAKEQWDALKLRMEIEAREAANRPQQSLNNQDPNGSGIGDNASQLNGTNNKDNGAEGAHTGTGTGTGEKKKTKKKRPAPVVEEEEVIDTKDKPKTKKKKKANANTNTAANNAEPEPPKVEDPPAPPTAKKKKKAAAAAQAAAEAAAAAEAASAAAPAPAKKKTQKKKKDGDGGAETKEKKESTGDNPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.67
6 0.74
7 0.79
8 0.75
9 0.72
10 0.71
11 0.68
12 0.69
13 0.73
14 0.66
15 0.58
16 0.51
17 0.47
18 0.41
19 0.39
20 0.32
21 0.25
22 0.24
23 0.28
24 0.29
25 0.33
26 0.41
27 0.39
28 0.4
29 0.39
30 0.43
31 0.39
32 0.38
33 0.35
34 0.29
35 0.26
36 0.23
37 0.22
38 0.16
39 0.16
40 0.17
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.2
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.24
64 0.27
65 0.29
66 0.22
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.11
73 0.08
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.15
78 0.16
79 0.19
80 0.27
81 0.29
82 0.32
83 0.41
84 0.45
85 0.45
86 0.51
87 0.53
88 0.52
89 0.56
90 0.56
91 0.47
92 0.44
93 0.4
94 0.34
95 0.28
96 0.22
97 0.18
98 0.15
99 0.13
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.11
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.14
185 0.17
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.28
192 0.29
193 0.3
194 0.26
195 0.25
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.15
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.02
211 0.03
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.15
225 0.16
226 0.18
227 0.19
228 0.2
229 0.2
230 0.24
231 0.25
232 0.21
233 0.25
234 0.22
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.17
240 0.2
241 0.15
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.22
246 0.22
247 0.21
248 0.21
249 0.23
250 0.26
251 0.33
252 0.38
253 0.39
254 0.39
255 0.37
256 0.34
257 0.33
258 0.29
259 0.22
260 0.15
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.1
270 0.12
271 0.14
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.17
278 0.14
279 0.13
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.14
291 0.19
292 0.25
293 0.34
294 0.44
295 0.54
296 0.63
297 0.71
298 0.78
299 0.84
300 0.89
301 0.91
302 0.88
303 0.87
304 0.83
305 0.73
306 0.64
307 0.53
308 0.44
309 0.33
310 0.27
311 0.18
312 0.12
313 0.15
314 0.21
315 0.26
316 0.33
317 0.43
318 0.54
319 0.64
320 0.74
321 0.81
322 0.85
323 0.91
324 0.94
325 0.94
326 0.92
327 0.9
328 0.84
329 0.77
330 0.68
331 0.58
332 0.48
333 0.37
334 0.3
335 0.22
336 0.23
337 0.2
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.26
342 0.26
343 0.28
344 0.28
345 0.31
346 0.35
347 0.38
348 0.38
349 0.39
350 0.47
351 0.54
352 0.59
353 0.63
354 0.66
355 0.67
356 0.73
357 0.81
358 0.8
359 0.79
360 0.77
361 0.71
362 0.62
363 0.55
364 0.46
365 0.36
366 0.26
367 0.15
368 0.07
369 0.04
370 0.03
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.05
379 0.06
380 0.09
381 0.14
382 0.18
383 0.26
384 0.35
385 0.46
386 0.56
387 0.66
388 0.75
389 0.81
390 0.88
391 0.91
392 0.93
393 0.89
394 0.87
395 0.86
396 0.8
397 0.74
398 0.71
399 0.62
400 0.53
401 0.52
402 0.43
403 0.35
404 0.35
405 0.37