Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6AB00

Protein Details
Accession A0A1A6AB00    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MWTLHQLKKKRKTKHAIAIQVPSAHydrophilic
158-178EEDRPSRPSKRQRRQVSDADQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-12KKRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.5, cyto 7.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MWTLHQLKKKRKTKHAIAIQVPSAPVQRQRNDVEEEQEDRVGIWGFTKAEIDRFPALRKRNFWCIQRHSATAMHYDLRMQIDGGTVSWAVPKGLIGISKNGESSRLAVETTIHPISYTTYEGADGRNFSAGRKGGTLLWDIGEYIITKPSSAADSTSEEDRPSRPSKRQRRQVSDADQPEEEGNLFRQFLYRQVGYGKSRSIHFILRGGRKMTNHHFILVLATAHAHTFSASGQIKKTWFLRLPKEVDEYLWDQGGEEGDFWGRSVKTGRSLKEVTAGYVARPDRWKEEAARFASWFGDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.89
3 0.88
4 0.86
5 0.81
6 0.72
7 0.64
8 0.53
9 0.44
10 0.37
11 0.3
12 0.32
13 0.34
14 0.35
15 0.4
16 0.43
17 0.47
18 0.5
19 0.5
20 0.47
21 0.43
22 0.43
23 0.38
24 0.35
25 0.29
26 0.23
27 0.22
28 0.17
29 0.13
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.17
38 0.2
39 0.22
40 0.23
41 0.28
42 0.33
43 0.4
44 0.43
45 0.48
46 0.5
47 0.56
48 0.61
49 0.62
50 0.65
51 0.65
52 0.68
53 0.66
54 0.62
55 0.54
56 0.5
57 0.45
58 0.38
59 0.33
60 0.24
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.16
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.11
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.24
151 0.31
152 0.41
153 0.52
154 0.61
155 0.71
156 0.76
157 0.79
158 0.81
159 0.81
160 0.77
161 0.75
162 0.68
163 0.6
164 0.5
165 0.41
166 0.35
167 0.26
168 0.2
169 0.12
170 0.1
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.13
177 0.17
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.23
182 0.24
183 0.26
184 0.25
185 0.22
186 0.22
187 0.25
188 0.25
189 0.23
190 0.22
191 0.25
192 0.3
193 0.34
194 0.37
195 0.36
196 0.37
197 0.36
198 0.41
199 0.42
200 0.43
201 0.37
202 0.35
203 0.32
204 0.29
205 0.29
206 0.23
207 0.17
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.19
221 0.22
222 0.23
223 0.26
224 0.29
225 0.28
226 0.32
227 0.38
228 0.44
229 0.49
230 0.53
231 0.52
232 0.55
233 0.48
234 0.42
235 0.39
236 0.34
237 0.28
238 0.24
239 0.2
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.12
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.13
250 0.11
251 0.13
252 0.17
253 0.19
254 0.28
255 0.34
256 0.37
257 0.4
258 0.42
259 0.41
260 0.45
261 0.42
262 0.35
263 0.34
264 0.32
265 0.25
266 0.3
267 0.3
268 0.27
269 0.32
270 0.34
271 0.34
272 0.37
273 0.41
274 0.41
275 0.49
276 0.52
277 0.52
278 0.52
279 0.47
280 0.44
281 0.41