Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A5J1

Protein Details
Accession A0A1A6A5J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-209GMGKRGREGDEKKKKKKKKKKNNFGQPYISNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-199MGKRGREGDEKKKKKKKKKK
232-249KRLREEKRLKLVEERKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSLYGGIKFAASSSSSSGEIDKSSKEPTSTTNPSGSSSTAAAQPAPSASTSNSDIKKPGEWSAALKFAPRVNKPRPQPSSRPAGFGNGNTTSTSQNASGSGSNSPNVSESHKNAPDIIRSAEPTLNVNVNVNVPAGGVGVGLVGSNSKDEDEVQFGPDGLPLAKAPAMTLAATSKALPGMGKRGREGDEKKKKKKKKKKNNFGQPYISNFDPDEQYDPNRPNDLGEYQAYRKRLREEKRLKLVEERKRKAQGLSSDESSYYTDSEDEAPRRDAPKMFAPPKIYSESAQPQQQSYPPAPLQAGFRPPSSLTTSTPSAISGDDAYARRAALSHQNTPAATAPASGEDAYARRLAMSQQAATASSGDDAYARGVAMSQGQGNVSLPPSFAAAPPTFAVPGSAPPPPPPHASAIAPPPPASDIPGFGAFPSGPSAPLPIAESVEEQKDPADFAKMLEDRKKAAEAIAAKFKALAGGGPGIPGSSAPAATPAAAVSQPEEDSGSGTFAEKMMRKWGHQEGSTLGIRNEGLLHALSAEHVTSQPQLKPGEQLSKRQLAKQKIAQANLKNKKWVQNSNSRGRIVNANEDSRLMNERERKGEESRIICLVGVVDSVEDIDEELSDEIGEECSKYGIVERVVLHIVEPPPQDPGEILRIFVVFSGMAGAWRATKELDGRFFGGRKIVSAFDPSIIHPRSREGGES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.19
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.24
11 0.26
12 0.26
13 0.26
14 0.29
15 0.36
16 0.4
17 0.42
18 0.42
19 0.4
20 0.42
21 0.42
22 0.37
23 0.3
24 0.24
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.14
34 0.12
35 0.13
36 0.16
37 0.2
38 0.27
39 0.29
40 0.3
41 0.33
42 0.33
43 0.36
44 0.35
45 0.36
46 0.33
47 0.32
48 0.34
49 0.35
50 0.38
51 0.34
52 0.33
53 0.32
54 0.31
55 0.38
56 0.41
57 0.46
58 0.49
59 0.58
60 0.64
61 0.72
62 0.76
63 0.76
64 0.78
65 0.75
66 0.78
67 0.7
68 0.66
69 0.56
70 0.54
71 0.48
72 0.41
73 0.4
74 0.32
75 0.31
76 0.28
77 0.28
78 0.23
79 0.22
80 0.22
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.25
97 0.34
98 0.36
99 0.37
100 0.39
101 0.4
102 0.39
103 0.36
104 0.35
105 0.28
106 0.27
107 0.29
108 0.27
109 0.25
110 0.23
111 0.23
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.09
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.18
167 0.22
168 0.23
169 0.24
170 0.27
171 0.3
172 0.38
173 0.44
174 0.46
175 0.53
176 0.62
177 0.71
178 0.78
179 0.86
180 0.88
181 0.93
182 0.93
183 0.93
184 0.94
185 0.95
186 0.96
187 0.97
188 0.96
189 0.92
190 0.88
191 0.8
192 0.74
193 0.67
194 0.55
195 0.45
196 0.35
197 0.3
198 0.23
199 0.21
200 0.18
201 0.15
202 0.18
203 0.23
204 0.25
205 0.26
206 0.27
207 0.25
208 0.23
209 0.25
210 0.23
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.26
216 0.28
217 0.28
218 0.3
219 0.34
220 0.41
221 0.45
222 0.52
223 0.59
224 0.65
225 0.73
226 0.74
227 0.68
228 0.69
229 0.71
230 0.69
231 0.7
232 0.65
233 0.62
234 0.64
235 0.64
236 0.57
237 0.54
238 0.52
239 0.47
240 0.46
241 0.42
242 0.37
243 0.35
244 0.33
245 0.27
246 0.2
247 0.14
248 0.11
249 0.08
250 0.08
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.21
257 0.22
258 0.24
259 0.22
260 0.22
261 0.28
262 0.34
263 0.36
264 0.37
265 0.4
266 0.39
267 0.41
268 0.41
269 0.34
270 0.26
271 0.29
272 0.3
273 0.29
274 0.31
275 0.28
276 0.25
277 0.26
278 0.27
279 0.25
280 0.21
281 0.22
282 0.19
283 0.2
284 0.19
285 0.19
286 0.2
287 0.19
288 0.23
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.18
297 0.2
298 0.21
299 0.2
300 0.2
301 0.18
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.07
306 0.06
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.1
315 0.16
316 0.19
317 0.22
318 0.24
319 0.25
320 0.25
321 0.26
322 0.26
323 0.18
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.11
387 0.13
388 0.16
389 0.18
390 0.21
391 0.21
392 0.22
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.26
397 0.27
398 0.25
399 0.23
400 0.21
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.13
405 0.1
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.1
410 0.12
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.1
425 0.1
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.08
435 0.09
436 0.16
437 0.18
438 0.21
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.27
443 0.28
444 0.22
445 0.2
446 0.21
447 0.19
448 0.22
449 0.28
450 0.26
451 0.25
452 0.25
453 0.24
454 0.2
455 0.16
456 0.12
457 0.06
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.12
491 0.13
492 0.14
493 0.22
494 0.24
495 0.24
496 0.3
497 0.37
498 0.38
499 0.37
500 0.38
501 0.3
502 0.34
503 0.34
504 0.3
505 0.22
506 0.18
507 0.17
508 0.16
509 0.14
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.1
523 0.14
524 0.15
525 0.19
526 0.21
527 0.22
528 0.26
529 0.29
530 0.36
531 0.35
532 0.41
533 0.43
534 0.5
535 0.51
536 0.53
537 0.57
538 0.55
539 0.6
540 0.59
541 0.63
542 0.6
543 0.64
544 0.64
545 0.64
546 0.68
547 0.69
548 0.65
549 0.63
550 0.61
551 0.65
552 0.65
553 0.67
554 0.63
555 0.64
556 0.7
557 0.73
558 0.75
559 0.68
560 0.61
561 0.54
562 0.54
563 0.47
564 0.48
565 0.42
566 0.39
567 0.37
568 0.37
569 0.35
570 0.3
571 0.3
572 0.23
573 0.24
574 0.3
575 0.34
576 0.39
577 0.43
578 0.45
579 0.46
580 0.51
581 0.52
582 0.47
583 0.45
584 0.41
585 0.37
586 0.32
587 0.28
588 0.21
589 0.13
590 0.11
591 0.08
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.1
614 0.14
615 0.15
616 0.19
617 0.19
618 0.22
619 0.24
620 0.23
621 0.2
622 0.21
623 0.21
624 0.22
625 0.23
626 0.2
627 0.22
628 0.23
629 0.23
630 0.18
631 0.21
632 0.24
633 0.22
634 0.22
635 0.2
636 0.2
637 0.2
638 0.19
639 0.16
640 0.07
641 0.07
642 0.09
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.11
651 0.14
652 0.2
653 0.25
654 0.3
655 0.31
656 0.34
657 0.37
658 0.38
659 0.36
660 0.36
661 0.3
662 0.27
663 0.26
664 0.25
665 0.23
666 0.27
667 0.26
668 0.24
669 0.25
670 0.25
671 0.32
672 0.32
673 0.33
674 0.28
675 0.32
676 0.34