Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A394

Protein Details
Accession A0A1A6A394    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-146SEEEARAPKRRKRDETPEEERKMBasic
623-646VEKSASTPKKSVKRKVDELKDDVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-136APKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MDEDEVASILGESSSNYAASARPAVPQRGENRAFDRYFDETTAHYDPSEVDFQELRRAAWATWRINPPANFSGNDRADEDDDELARALALSAQEHFSRPTSRQPSVTIGDGDEDDELRRAIALSEEEARAPKRRKRDETPEEERKMLAEAMAASLAESETHSAGPSRPSTQSSTSTIKDKSTTPAPASAAQQSEPVTAPALRIGGQIIDRAQLERERRERQAARQAASGASTPIPSIASVNSRPQPGPARISGMSSIAQSAIHPLQGSGPFPNDAAGEYYPDGELRHVALKIGEPSTERTFSPKEVVGKHSQISLIIMSSYVIDDMWIMEKEILPPPEDVPTIIVRPHPRDKQDYNGKIQAHPNGEMWAYPKMTSTFGSAHMKYYWILYKTGRLRTVFVQDFLPLPTIRPLRADNRTHDFPLQFAHLFNHTRIDTALRNMLRLHPNASHIKFRPDDNFADMGKFDWSKVKVRLVLSIPQTLTGHDEIAKYGMGRLSHVLNEEGWVPGNDEKLDVEYQNSSLGNYKIDWLDKFHAMILGKTSQELMNRPKPKELPDIRVLYPTLANVEQSILGKEGGGTMFCKKAFNNTTRHLFRDARSKRGGVLMHSKMLIAIFEPKENRLGVEKSASTPKKSVKRKVDELKDDVGGWVYVGSHNFSSAAWGNINVKKNPPTESINNYEIGIVFPLDRSNARAAADRIAPYKRPALRYTAGDVPWCEILL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.18
8 0.17
9 0.21
10 0.27
11 0.32
12 0.35
13 0.41
14 0.43
15 0.49
16 0.51
17 0.51
18 0.51
19 0.54
20 0.51
21 0.45
22 0.45
23 0.4
24 0.39
25 0.35
26 0.31
27 0.24
28 0.29
29 0.3
30 0.26
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.22
35 0.25
36 0.19
37 0.19
38 0.21
39 0.22
40 0.3
41 0.29
42 0.25
43 0.24
44 0.26
45 0.23
46 0.3
47 0.37
48 0.33
49 0.4
50 0.45
51 0.46
52 0.52
53 0.53
54 0.51
55 0.49
56 0.48
57 0.42
58 0.4
59 0.46
60 0.41
61 0.41
62 0.35
63 0.32
64 0.31
65 0.31
66 0.28
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.14
72 0.12
73 0.1
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.16
83 0.17
84 0.21
85 0.22
86 0.31
87 0.36
88 0.39
89 0.41
90 0.43
91 0.46
92 0.44
93 0.45
94 0.36
95 0.28
96 0.26
97 0.23
98 0.21
99 0.15
100 0.13
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.21
116 0.27
117 0.34
118 0.37
119 0.45
120 0.55
121 0.63
122 0.7
123 0.78
124 0.8
125 0.82
126 0.86
127 0.86
128 0.79
129 0.72
130 0.62
131 0.51
132 0.42
133 0.33
134 0.23
135 0.14
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.1
151 0.14
152 0.16
153 0.18
154 0.2
155 0.23
156 0.27
157 0.3
158 0.33
159 0.34
160 0.37
161 0.35
162 0.38
163 0.37
164 0.35
165 0.33
166 0.31
167 0.3
168 0.31
169 0.33
170 0.29
171 0.31
172 0.32
173 0.32
174 0.33
175 0.32
176 0.27
177 0.23
178 0.24
179 0.21
180 0.2
181 0.18
182 0.16
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.2
201 0.26
202 0.33
203 0.37
204 0.39
205 0.48
206 0.5
207 0.53
208 0.59
209 0.57
210 0.52
211 0.49
212 0.47
213 0.38
214 0.35
215 0.27
216 0.18
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.13
227 0.19
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.27
232 0.31
233 0.31
234 0.32
235 0.28
236 0.3
237 0.28
238 0.3
239 0.26
240 0.22
241 0.19
242 0.15
243 0.14
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.15
283 0.18
284 0.19
285 0.17
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.23
290 0.21
291 0.22
292 0.23
293 0.28
294 0.29
295 0.29
296 0.28
297 0.27
298 0.24
299 0.2
300 0.18
301 0.14
302 0.09
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.14
332 0.15
333 0.2
334 0.27
335 0.29
336 0.32
337 0.38
338 0.39
339 0.45
340 0.52
341 0.51
342 0.49
343 0.5
344 0.48
345 0.44
346 0.44
347 0.4
348 0.31
349 0.29
350 0.24
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.15
365 0.2
366 0.19
367 0.2
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.17
373 0.14
374 0.15
375 0.14
376 0.21
377 0.26
378 0.31
379 0.32
380 0.29
381 0.3
382 0.31
383 0.38
384 0.32
385 0.27
386 0.23
387 0.2
388 0.2
389 0.18
390 0.18
391 0.1
392 0.1
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.16
397 0.19
398 0.23
399 0.31
400 0.34
401 0.34
402 0.4
403 0.42
404 0.41
405 0.41
406 0.35
407 0.27
408 0.25
409 0.23
410 0.16
411 0.14
412 0.14
413 0.15
414 0.17
415 0.16
416 0.19
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.15
422 0.16
423 0.22
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.24
428 0.25
429 0.25
430 0.26
431 0.21
432 0.26
433 0.33
434 0.34
435 0.36
436 0.33
437 0.37
438 0.36
439 0.37
440 0.36
441 0.33
442 0.32
443 0.29
444 0.31
445 0.25
446 0.24
447 0.22
448 0.18
449 0.17
450 0.15
451 0.12
452 0.14
453 0.17
454 0.21
455 0.25
456 0.28
457 0.3
458 0.31
459 0.36
460 0.33
461 0.36
462 0.33
463 0.34
464 0.3
465 0.27
466 0.27
467 0.22
468 0.22
469 0.17
470 0.15
471 0.13
472 0.13
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.09
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.12
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.12
504 0.14
505 0.13
506 0.11
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.15
512 0.15
513 0.17
514 0.17
515 0.19
516 0.21
517 0.21
518 0.22
519 0.2
520 0.21
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.15
529 0.17
530 0.22
531 0.27
532 0.34
533 0.41
534 0.43
535 0.48
536 0.49
537 0.52
538 0.57
539 0.56
540 0.53
541 0.54
542 0.57
543 0.51
544 0.51
545 0.46
546 0.37
547 0.31
548 0.24
549 0.2
550 0.15
551 0.14
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.11
566 0.15
567 0.15
568 0.17
569 0.16
570 0.25
571 0.32
572 0.37
573 0.42
574 0.45
575 0.54
576 0.56
577 0.59
578 0.56
579 0.52
580 0.5
581 0.53
582 0.51
583 0.49
584 0.5
585 0.48
586 0.43
587 0.45
588 0.43
589 0.38
590 0.43
591 0.38
592 0.36
593 0.35
594 0.33
595 0.28
596 0.26
597 0.21
598 0.12
599 0.17
600 0.15
601 0.2
602 0.22
603 0.23
604 0.26
605 0.26
606 0.26
607 0.24
608 0.25
609 0.23
610 0.27
611 0.27
612 0.27
613 0.38
614 0.39
615 0.38
616 0.41
617 0.48
618 0.52
619 0.6
620 0.67
621 0.68
622 0.74
623 0.8
624 0.85
625 0.87
626 0.85
627 0.8
628 0.74
629 0.65
630 0.56
631 0.46
632 0.37
633 0.26
634 0.18
635 0.13
636 0.09
637 0.1
638 0.1
639 0.12
640 0.11
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.16
645 0.16
646 0.17
647 0.15
648 0.18
649 0.23
650 0.29
651 0.35
652 0.33
653 0.37
654 0.42
655 0.44
656 0.47
657 0.46
658 0.47
659 0.48
660 0.53
661 0.53
662 0.49
663 0.47
664 0.42
665 0.38
666 0.3
667 0.24
668 0.18
669 0.12
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.12
674 0.13
675 0.16
676 0.18
677 0.2
678 0.21
679 0.27
680 0.27
681 0.3
682 0.34
683 0.33
684 0.34
685 0.37
686 0.38
687 0.36
688 0.43
689 0.45
690 0.46
691 0.46
692 0.49
693 0.49
694 0.51
695 0.53
696 0.52
697 0.47
698 0.45
699 0.43
700 0.38