FuNGI

A0A1A6A9C5

Protein Details

Accession

A0A1A6A9C5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
107-127	QEKEKEKEKEKEKENGKKRSL	Basic
146-194	MDGSENKDERRKRKRCDQGEGEAEDTPRAVRPKDKIKSKNKDKDKDIDT	Basic
693-722	LHEDKEEKKERLKKIKRDRKRLKASSSIAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
109-138	KEKEKEKEKEKENGKKRSLPIDEKRLRERS
152-160	KDERRKRKR
174-188	AVRPKDKIKSKNKDK
259-261	GKR
288-315	KRKLVNGKKRTRDGEDEISKKEKKEKQN
699-715	EKKERLKKIKRDRKRLK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MRSNKEAFGMDLSGGRTRTTVVVSSTVKSKSATASSSRAPSQSNGQSSRTTTAMKTSTGTSTRGGNSRALGKTKTNSFSNDPDAFFADMDVRKRDYNRRSDNLQYRQEKEKEKEKEKEKENGKKRSLPIDEKRLRERSTGSNVKAMDGSENKDERRKRKRCDQGEGEAEDTPRAVRPKDKIKSKNKDKDKDIDTIKGRPTRILTRSQSITTNSDSEDELTLGSTPPRHSHEGYRRDKSRSSSPVKARQSSQAGPSKSEGKRKRDVLISNSEEEYDTETRTSANGLSNKRKLVNGKKRTRDGEDEISKKEKKEKQNLEIQKRSLKRASLDDDEEDKSRTPRPKTKHGVGKIILPRNSPFRDVSFMVNDSNGLRLGLEEKGIALSPKKDNKVANAFWDDLERIASEGHLDVDEADDHIDLSKIMDETFVDEDEELSPEDQAYLAAFKNHFDLCPYCSAPLPVNPSANLLRHKAKLETISHPEPSPSNPNARKLGWQQHIEFCQLHHAETSIIPLGLRAGYPERIDFKRLELTLEDGWIRDKLDEIVRYPERSEVFRTIQGEIEEIGKMAWGGIKWQSKPENLEAVKPGYYGELGRSILIDHFMSLRKWGYFPSVSLKSTDPHHPPSLAPLSWTEFLSHVLVPEASIYLIMNDKGHTGFTKAGYEEAKEVRKDSVNHGNWKFREDDLDSQDWLASLHEDKEEKKERLKKIKRDRKRLKASSSIASADDSPSQGDKGEHENIKPAITTPQSSMDYFEGLEDAQILEASRGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.2
3	0.17
4	0.17
5	0.19
6	0.19
7	0.19
8	0.18
9	0.24
10	0.26
11	0.28
12	0.32
13	0.32
14	0.3
15	0.29
16	0.28
17	0.27
18	0.29
19	0.31
20	0.3
21	0.33
22	0.37
23	0.42
24	0.42
25	0.39
26	0.37
27	0.35
28	0.4
29	0.42
30	0.45
31	0.44
32	0.45
33	0.46
34	0.47
35	0.48
36	0.41
37	0.36
38	0.29
39	0.32
40	0.31
41	0.29
42	0.28
43	0.27
44	0.31
45	0.31
46	0.32
47	0.26
48	0.29
49	0.32
50	0.35
51	0.35
52	0.31
53	0.32
54	0.37
55	0.4
56	0.39
57	0.38
58	0.39
59	0.44
60	0.48
61	0.51
62	0.46
63	0.47
64	0.48
65	0.5
66	0.52
67	0.5
68	0.43
69	0.39
70	0.38
71	0.34
72	0.28
73	0.23
74	0.21
75	0.2
76	0.23
77	0.24
78	0.25
79	0.28
80	0.33
81	0.43
82	0.46
83	0.53
84	0.6
85	0.62
86	0.66
87	0.72
88	0.77
89	0.76
90	0.77
91	0.74
92	0.69
93	0.72
94	0.73
95	0.72
96	0.68
97	0.69
98	0.69
99	0.71
100	0.76
101	0.76
102	0.78
103	0.76
104	0.79
105	0.79
106	0.8
107	0.8
108	0.82
109	0.79
110	0.78
111	0.75
112	0.76
113	0.74
114	0.73
115	0.73
116	0.74
117	0.74
118	0.72
119	0.76
120	0.73
121	0.67
122	0.6
123	0.56
124	0.52
125	0.56
126	0.58
127	0.52
128	0.49
129	0.47
130	0.45
131	0.41
132	0.34
133	0.29
134	0.24
135	0.25
136	0.27
137	0.31
138	0.31
139	0.38
140	0.46
141	0.5
142	0.58
143	0.64
144	0.66
145	0.73
146	0.82
147	0.83
148	0.86
149	0.83
150	0.81
151	0.79
152	0.73
153	0.64
154	0.55
155	0.46
156	0.36
157	0.28
158	0.2
159	0.16
160	0.16
161	0.16
162	0.2
163	0.27
164	0.38
165	0.46
166	0.56
167	0.63
168	0.71
169	0.8
170	0.86
171	0.89
172	0.89
173	0.89
174	0.85
175	0.83
176	0.76
177	0.73
178	0.66
179	0.64
180	0.57
181	0.53
182	0.54
183	0.5
184	0.47
185	0.42
186	0.43
187	0.43
188	0.43
189	0.47
190	0.44
191	0.45
192	0.48
193	0.46
194	0.45
195	0.4
196	0.39
197	0.32
198	0.29
199	0.24
200	0.22
201	0.2
202	0.18
203	0.15
204	0.13
205	0.1
206	0.09
207	0.09
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.14
213	0.19
214	0.23
215	0.24
216	0.34
217	0.43
218	0.51
219	0.58
220	0.63
221	0.63
222	0.64
223	0.66
224	0.61
225	0.6
226	0.59
227	0.58
228	0.58
229	0.62
230	0.67
231	0.7
232	0.69
233	0.62
234	0.6
235	0.58
236	0.52
237	0.51
238	0.49
239	0.43
240	0.41
241	0.41
242	0.42
243	0.4
244	0.48
245	0.48
246	0.48
247	0.54
248	0.56
249	0.58
250	0.56
251	0.57
252	0.53
253	0.54
254	0.5
255	0.45
256	0.41
257	0.37
258	0.31
259	0.26
260	0.25
261	0.17
262	0.14
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.12
268	0.09
269	0.13
270	0.18
271	0.24
272	0.32
273	0.35
274	0.38
275	0.38
276	0.4
277	0.43
278	0.49
279	0.54
280	0.56
281	0.63
282	0.68
283	0.73
284	0.74
285	0.71
286	0.66
287	0.61
288	0.6
289	0.58
290	0.53
291	0.5
292	0.51
293	0.48
294	0.43
295	0.46
296	0.44
297	0.46
298	0.53
299	0.59
300	0.59
301	0.67
302	0.75
303	0.76
304	0.74
305	0.67
306	0.64
307	0.58
308	0.57
309	0.5
310	0.43
311	0.37
312	0.36
313	0.39
314	0.35
315	0.34
316	0.31
317	0.31
318	0.3
319	0.28
320	0.24
321	0.2
322	0.17
323	0.21
324	0.26
325	0.29
326	0.35
327	0.41
328	0.5
329	0.57
330	0.63
331	0.67
332	0.65
333	0.66
334	0.59
335	0.6
336	0.57
337	0.55
338	0.48
339	0.4
340	0.38
341	0.37
342	0.37
343	0.32
344	0.26
345	0.21
346	0.24
347	0.23
348	0.24
349	0.2
350	0.19
351	0.17
352	0.16
353	0.15
354	0.11
355	0.1
356	0.08
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.14
371	0.19
372	0.21
373	0.24
374	0.25
375	0.3
376	0.36
377	0.34
378	0.33
379	0.3
380	0.29
381	0.25
382	0.26
383	0.2
384	0.13
385	0.13
386	0.09
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.1
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.13
437	0.13
438	0.17
439	0.17
440	0.15
441	0.16
442	0.17
443	0.16
444	0.18
445	0.22
446	0.2
447	0.21
448	0.2
449	0.23
450	0.24
451	0.26
452	0.25
453	0.23
454	0.24
455	0.26
456	0.28
457	0.26
458	0.26
459	0.29
460	0.3
461	0.32
462	0.35
463	0.35
464	0.35
465	0.33
466	0.32
467	0.27
468	0.27
469	0.28
470	0.24
471	0.3
472	0.32
473	0.37
474	0.4
475	0.4
476	0.42
477	0.42
478	0.49
479	0.46
480	0.47
481	0.45
482	0.46
483	0.47
484	0.44
485	0.38
486	0.28
487	0.3
488	0.26
489	0.23
490	0.18
491	0.17
492	0.15
493	0.14
494	0.16
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.11
505	0.12
506	0.14
507	0.18
508	0.19
509	0.22
510	0.21
511	0.22
512	0.26
513	0.25
514	0.25
515	0.2
516	0.23
517	0.21
518	0.22
519	0.19
520	0.13
521	0.14
522	0.13
523	0.13
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.15
528	0.17
529	0.17
530	0.25
531	0.27
532	0.28
533	0.28
534	0.29
535	0.26
536	0.27
537	0.29
538	0.27
539	0.27
540	0.3
541	0.31
542	0.28
543	0.28
544	0.26
545	0.23
546	0.18
547	0.16
548	0.12
549	0.1
550	0.09
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.06
555	0.05
556	0.07
557	0.14
558	0.2
559	0.21
560	0.28
561	0.32
562	0.33
563	0.38
564	0.39
565	0.42
566	0.38
567	0.4
568	0.37
569	0.35
570	0.32
571	0.28
572	0.24
573	0.15
574	0.16
575	0.13
576	0.11
577	0.13
578	0.13
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.12
585	0.08
586	0.1
587	0.12
588	0.12
589	0.14
590	0.16
591	0.15
592	0.16
593	0.17
594	0.21
595	0.2
596	0.21
597	0.27
598	0.3
599	0.29
600	0.31
601	0.31
602	0.27
603	0.3
604	0.36
605	0.34
606	0.35
607	0.37
608	0.36
609	0.35
610	0.4
611	0.42
612	0.34
613	0.3
614	0.26
615	0.28
616	0.28
617	0.28
618	0.22
619	0.17
620	0.19
621	0.19
622	0.17
623	0.13
624	0.12
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.09
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.06
633	0.08
634	0.09
635	0.09
636	0.09
637	0.11
638	0.11
639	0.13
640	0.12
641	0.13
642	0.16
643	0.17
644	0.2
645	0.19
646	0.22
647	0.22
648	0.23
649	0.25
650	0.28
651	0.31
652	0.29
653	0.3
654	0.31
655	0.35
656	0.36
657	0.38
658	0.43
659	0.45
660	0.53
661	0.57
662	0.62
663	0.57
664	0.58
665	0.53
666	0.43
667	0.43
668	0.38
669	0.4
670	0.38
671	0.4
672	0.37
673	0.35
674	0.34
675	0.28
676	0.23
677	0.16
678	0.12
679	0.11
680	0.12
681	0.16
682	0.18
683	0.2
684	0.29
685	0.38
686	0.4
687	0.47
688	0.55
689	0.61
690	0.7
691	0.79
692	0.8
693	0.83
694	0.9
695	0.91
696	0.94
697	0.94
698	0.94
699	0.95
700	0.94
701	0.9
702	0.89
703	0.84
704	0.79
705	0.72
706	0.63
707	0.53
708	0.45
709	0.38
710	0.3
711	0.26
712	0.2
713	0.18
714	0.17
715	0.16
716	0.16
717	0.16
718	0.17
719	0.21
720	0.29
721	0.31
722	0.31
723	0.37
724	0.37
725	0.37
726	0.35
727	0.29
728	0.29
729	0.29
730	0.3
731	0.26
732	0.32
733	0.33
734	0.33
735	0.36
736	0.29
737	0.27
738	0.24
739	0.22
740	0.16
741	0.13
742	0.12
743	0.09
744	0.08
745	0.07
746	0.07
747	0.07

A0A1A6A9C5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer