Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2K461

Protein Details
Accession I2K461    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MHNKKKKDPKSKKDEDYLINQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-12KKKKDPKSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
Amino Acid Sequences MHNKKKKDPKSKKDEDYLINQLILYLTDTRRKLTRLLDPDQPKFQWRGYTISLDLYEHLRTDEQYSTPDNLXIIDDSLFKCYLXSNPKMIGPFLRIPNFCDFXLVESECLENHMFSELIDFYYIRSRHEKALKLLDHLCFHREDTVNIDEGSSYLSLLFNAEYMVRYLQKLGNSELDLILKYSQELIELDPGYFKIIFMNDTDASESLDKSQILAYVHKHQWAEIEQNYLEYIIFDTNEKXPEFVNSLINLYXNKQDISEVFXKAQGNSSNRFXR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.8
3 0.77
4 0.73
5 0.64
6 0.54
7 0.45
8 0.36
9 0.28
10 0.23
11 0.17
12 0.14
13 0.15
14 0.22
15 0.23
16 0.26
17 0.3
18 0.31
19 0.34
20 0.36
21 0.43
22 0.43
23 0.47
24 0.53
25 0.57
26 0.61
27 0.62
28 0.57
29 0.51
30 0.47
31 0.45
32 0.42
33 0.37
34 0.37
35 0.34
36 0.37
37 0.34
38 0.33
39 0.31
40 0.25
41 0.23
42 0.2
43 0.17
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.16
50 0.14
51 0.16
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.12
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.22
69 0.21
70 0.24
71 0.23
72 0.26
73 0.29
74 0.29
75 0.28
76 0.24
77 0.26
78 0.28
79 0.32
80 0.29
81 0.3
82 0.33
83 0.34
84 0.29
85 0.25
86 0.21
87 0.18
88 0.2
89 0.17
90 0.14
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.09
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.18
110 0.19
111 0.25
112 0.31
113 0.34
114 0.31
115 0.39
116 0.37
117 0.37
118 0.38
119 0.34
120 0.3
121 0.28
122 0.25
123 0.18
124 0.17
125 0.19
126 0.16
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.07
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.18
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.14
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.11
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.17
199 0.19
200 0.26
201 0.28
202 0.31
203 0.3
204 0.28
205 0.31
206 0.31
207 0.34
208 0.27
209 0.29
210 0.25
211 0.26
212 0.26
213 0.22
214 0.18
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.2
229 0.17
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.24
234 0.25
235 0.29
236 0.24
237 0.25
238 0.22
239 0.21
240 0.28
241 0.31
242 0.29
243 0.26
244 0.29
245 0.3
246 0.29
247 0.36
248 0.33