Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A6N1

Protein Details
Accession A0A1A6A6N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-202EGEEKPKKKKASKPKAKKSRRRVPGEGEBasic
235-259EGEVKEKKKRAPRPARERQPRLELTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-197IRKQKDEQRKERREAANAKKAEKAAESAKAAGVPTNGDAKPAEGEEKPKKKKASKPKAKKSRRRV
238-253VKEKKKRAPRPARERQ
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 14.833, nucl 9, mito_nucl 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MVEAVINPIKQATESVVAAANDFVAGKPSTTEEDEKKIADIPKEDDGHRVYIGNLSYATTEEQVREFVAPVGGEIKSVQLPTKFGKRPAGYAFVTYTNGTDANKAVDQLKDKELDGRQVKLELARPAEKVLEIRKQKDEQRKERREAANAKKAEKAAESAKAAGVPTNGDAKPAEGEEKPKKKKASKPKAKKSRRRVPGEGEDGEAEAEGEASADADAAKPASKGRIDVNGGAAEGEVKEKKKRAPRPARERQPRLELTGDDSKNTIFVANLPFSVNDESLATIFTNLSIKVKSAKVVQGIRKPRAGAARTFKPFRASKGFGFVELENEAEQNEAVEKVDGTLIEDRKITAKIAKEMKPIEQEQVADAQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.18
7 0.14
8 0.1
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.13
16 0.16
17 0.2
18 0.27
19 0.27
20 0.33
21 0.35
22 0.35
23 0.33
24 0.35
25 0.35
26 0.33
27 0.33
28 0.31
29 0.36
30 0.39
31 0.38
32 0.38
33 0.36
34 0.34
35 0.31
36 0.28
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.14
66 0.13
67 0.16
68 0.2
69 0.3
70 0.32
71 0.35
72 0.44
73 0.42
74 0.46
75 0.47
76 0.49
77 0.4
78 0.38
79 0.35
80 0.28
81 0.28
82 0.23
83 0.2
84 0.15
85 0.15
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.19
95 0.21
96 0.24
97 0.22
98 0.22
99 0.27
100 0.27
101 0.33
102 0.31
103 0.3
104 0.28
105 0.28
106 0.28
107 0.25
108 0.27
109 0.22
110 0.24
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.21
118 0.25
119 0.28
120 0.31
121 0.36
122 0.4
123 0.47
124 0.55
125 0.61
126 0.63
127 0.7
128 0.75
129 0.74
130 0.78
131 0.74
132 0.72
133 0.72
134 0.7
135 0.67
136 0.62
137 0.59
138 0.53
139 0.49
140 0.42
141 0.33
142 0.27
143 0.2
144 0.21
145 0.2
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.13
151 0.11
152 0.07
153 0.08
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.09
163 0.16
164 0.24
165 0.34
166 0.38
167 0.43
168 0.5
169 0.55
170 0.63
171 0.68
172 0.7
173 0.72
174 0.79
175 0.84
176 0.89
177 0.92
178 0.93
179 0.93
180 0.92
181 0.9
182 0.87
183 0.81
184 0.78
185 0.75
186 0.71
187 0.61
188 0.51
189 0.42
190 0.33
191 0.28
192 0.2
193 0.11
194 0.05
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.13
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.22
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.09
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.15
227 0.19
228 0.26
229 0.35
230 0.45
231 0.53
232 0.62
233 0.71
234 0.78
235 0.86
236 0.91
237 0.92
238 0.9
239 0.84
240 0.82
241 0.73
242 0.66
243 0.58
244 0.47
245 0.42
246 0.44
247 0.38
248 0.3
249 0.28
250 0.24
251 0.21
252 0.21
253 0.15
254 0.06
255 0.09
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.16
262 0.18
263 0.15
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.21
282 0.25
283 0.3
284 0.38
285 0.44
286 0.49
287 0.57
288 0.58
289 0.57
290 0.54
291 0.51
292 0.53
293 0.48
294 0.47
295 0.47
296 0.52
297 0.56
298 0.58
299 0.56
300 0.54
301 0.54
302 0.52
303 0.53
304 0.48
305 0.43
306 0.49
307 0.48
308 0.41
309 0.42
310 0.35
311 0.29
312 0.25
313 0.24
314 0.15
315 0.15
316 0.13
317 0.1
318 0.1
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.09
328 0.12
329 0.18
330 0.19
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.22
338 0.26
339 0.32
340 0.41
341 0.45
342 0.5
343 0.52
344 0.56
345 0.58
346 0.55
347 0.52
348 0.46
349 0.41
350 0.35