Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6A3I6

Protein Details
Accession A0A1A6A3I6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-374SDLTSEKKGRRKKRNAGAALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-368KKGRRKKRN
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 9.333, nucl 7.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR011108  RMMBL  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
PF07521  RMMBL  
Amino Acid Sequences MITLTPLSSSASASSSSEPISYLLQLDEARILLDLGQRDYRSSSLQSSWEYEEKVRELAPTLSLVLLSHSPTNYLSLYPYARARWGLTCPVYATQPTVEMGRVVCLADVESWRSECSVDDTASTPSSAAESSKLDKGKKPLRGPFVPTVEEVHEAFDWIKAIRYNQPLHLGGDLSHLLLTPFPSGHTLGGTLFKIRSPTSGTILYAVGINHTSERHLDGMVGGQNGPTGYADGVLRPDLLIVEGGRSEVINPKRRDRETALLDLVTSTLESNHSVLLPSDPSPRLLELLVLLDQHWTFKLNPANKRRQANQNDPWPYPLCLVSRTGQDMIAFARSLIEWMGGVVKEAGGEEAMSDLTSEKKGRRKKRNAGAALGSEYGALDFRHVQFFLTPSDLLQAYPLMRPKLVLAIPPTMSHGPSRFFFTTMASAEGNVVLLTSRGEDSTLARDLFNKWEIEQDESGKWGKGKIGRLATPQGHVQLEMDSKVPLIGAELEAHLEAERLAKEREAAHQAALDRSKRMLEADDLESESESEGSGDEDYADGIIVAKRLRDENANAFAGDGEDVNRTMSFDIYVKGQQTRINRGYQKDGEMTRFRMFPFLERRGRKIDAYGEGLDIGQWVRKGREIEEEGETEEVREKKRLKEEEEEKQKVKPEAPSKYIKETLDLDLKASVFFVDMEGLHDGQSIKTIISDLQPRKLILVRSQPEITSSLVKYLNSTAGVTQDIFIPATGEQIRIGEHVQSYSITLGDSISAGLAKKWSKFEGYEVAMIDGKIAFAPGSTVPVLEISDLVKPLPVEATIEEEPETEAEAVLVPVSGDGDVEMTTEPAKEAAQETAHDDEAQTEDGAVVKTEIEDVKPNIDGPEKGSIAEKKTKSEKSRYTSQKSSIPSSLLIGTLRLTSLKNHLAALQPLSIPSEFAGEGILVCGPGLQTPENEKVKSGSIVAVKKIGENGIVVEGTIGRVYDLVVRAVKGELASVNSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.12
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.13
21 0.15
22 0.17
23 0.22
24 0.22
25 0.24
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.28
31 0.27
32 0.3
33 0.32
34 0.33
35 0.36
36 0.36
37 0.36
38 0.34
39 0.36
40 0.34
41 0.33
42 0.29
43 0.25
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.19
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.2
65 0.22
66 0.25
67 0.24
68 0.26
69 0.28
70 0.28
71 0.28
72 0.3
73 0.35
74 0.33
75 0.33
76 0.32
77 0.32
78 0.32
79 0.29
80 0.27
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.18
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.21
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.17
119 0.23
120 0.27
121 0.3
122 0.35
123 0.44
124 0.49
125 0.56
126 0.61
127 0.64
128 0.68
129 0.7
130 0.72
131 0.7
132 0.67
133 0.59
134 0.51
135 0.46
136 0.39
137 0.36
138 0.29
139 0.23
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.16
149 0.22
150 0.29
151 0.31
152 0.34
153 0.4
154 0.39
155 0.38
156 0.36
157 0.29
158 0.23
159 0.23
160 0.2
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.17
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.22
186 0.24
187 0.26
188 0.25
189 0.24
190 0.23
191 0.21
192 0.17
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.14
236 0.22
237 0.3
238 0.34
239 0.42
240 0.51
241 0.53
242 0.58
243 0.57
244 0.59
245 0.55
246 0.57
247 0.5
248 0.41
249 0.39
250 0.32
251 0.26
252 0.16
253 0.11
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.15
286 0.22
287 0.27
288 0.37
289 0.45
290 0.56
291 0.6
292 0.66
293 0.67
294 0.7
295 0.72
296 0.73
297 0.72
298 0.71
299 0.7
300 0.64
301 0.62
302 0.53
303 0.46
304 0.37
305 0.32
306 0.23
307 0.19
308 0.21
309 0.19
310 0.19
311 0.21
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.04
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.08
345 0.1
346 0.14
347 0.23
348 0.32
349 0.42
350 0.53
351 0.63
352 0.71
353 0.79
354 0.84
355 0.81
356 0.76
357 0.69
358 0.6
359 0.51
360 0.41
361 0.31
362 0.21
363 0.16
364 0.11
365 0.08
366 0.06
367 0.05
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.09
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.1
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.12
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.21
399 0.17
400 0.17
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.21
406 0.18
407 0.19
408 0.18
409 0.18
410 0.19
411 0.17
412 0.18
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.06
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.16
436 0.17
437 0.14
438 0.12
439 0.16
440 0.17
441 0.19
442 0.19
443 0.18
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.14
448 0.14
449 0.12
450 0.14
451 0.16
452 0.19
453 0.23
454 0.26
455 0.27
456 0.3
457 0.34
458 0.32
459 0.29
460 0.26
461 0.23
462 0.19
463 0.17
464 0.15
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.1
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.09
491 0.1
492 0.13
493 0.16
494 0.16
495 0.15
496 0.16
497 0.17
498 0.18
499 0.2
500 0.18
501 0.14
502 0.14
503 0.15
504 0.13
505 0.13
506 0.12
507 0.1
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.14
512 0.13
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.07
517 0.05
518 0.04
519 0.03
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.11
538 0.14
539 0.17
540 0.21
541 0.21
542 0.2
543 0.19
544 0.18
545 0.16
546 0.13
547 0.08
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.1
561 0.11
562 0.12
563 0.14
564 0.17
565 0.2
566 0.28
567 0.29
568 0.35
569 0.37
570 0.39
571 0.44
572 0.42
573 0.41
574 0.37
575 0.35
576 0.34
577 0.33
578 0.34
579 0.29
580 0.28
581 0.26
582 0.25
583 0.24
584 0.24
585 0.3
586 0.34
587 0.41
588 0.42
589 0.45
590 0.47
591 0.49
592 0.44
593 0.39
594 0.35
595 0.3
596 0.31
597 0.28
598 0.22
599 0.2
600 0.19
601 0.16
602 0.12
603 0.09
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.09
608 0.12
609 0.14
610 0.15
611 0.22
612 0.24
613 0.25
614 0.26
615 0.26
616 0.23
617 0.23
618 0.21
619 0.14
620 0.16
621 0.16
622 0.15
623 0.21
624 0.23
625 0.28
626 0.37
627 0.43
628 0.43
629 0.51
630 0.56
631 0.61
632 0.68
633 0.68
634 0.6
635 0.57
636 0.57
637 0.5
638 0.46
639 0.43
640 0.41
641 0.42
642 0.46
643 0.51
644 0.5
645 0.53
646 0.55
647 0.47
648 0.42
649 0.38
650 0.36
651 0.34
652 0.31
653 0.26
654 0.22
655 0.22
656 0.19
657 0.16
658 0.12
659 0.07
660 0.06
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.08
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.11
678 0.2
679 0.21
680 0.26
681 0.28
682 0.28
683 0.29
684 0.32
685 0.31
686 0.29
687 0.36
688 0.34
689 0.36
690 0.37
691 0.35
692 0.33
693 0.32
694 0.27
695 0.22
696 0.2
697 0.19
698 0.2
699 0.2
700 0.19
701 0.19
702 0.2
703 0.16
704 0.16
705 0.13
706 0.12
707 0.14
708 0.12
709 0.11
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.07
716 0.11
717 0.12
718 0.11
719 0.1
720 0.11
721 0.11
722 0.11
723 0.12
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.1
728 0.1
729 0.11
730 0.1
731 0.09
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.06
741 0.06
742 0.11
743 0.13
744 0.16
745 0.19
746 0.21
747 0.23
748 0.24
749 0.27
750 0.3
751 0.3
752 0.29
753 0.27
754 0.26
755 0.24
756 0.23
757 0.19
758 0.12
759 0.1
760 0.07
761 0.07
762 0.05
763 0.04
764 0.06
765 0.06
766 0.09
767 0.09
768 0.09
769 0.09
770 0.1
771 0.1
772 0.08
773 0.09
774 0.07
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.09
780 0.1
781 0.1
782 0.09
783 0.09
784 0.09
785 0.15
786 0.14
787 0.16
788 0.15
789 0.15
790 0.15
791 0.13
792 0.14
793 0.08
794 0.08
795 0.07
796 0.07
797 0.07
798 0.06
799 0.06
800 0.04
801 0.04
802 0.04
803 0.04
804 0.04
805 0.04
806 0.04
807 0.04
808 0.05
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.09
818 0.12
819 0.13
820 0.13
821 0.17
822 0.19
823 0.2
824 0.18
825 0.17
826 0.15
827 0.16
828 0.16
829 0.12
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.07
838 0.09
839 0.1
840 0.11
841 0.15
842 0.16
843 0.18
844 0.19
845 0.2
846 0.2
847 0.22
848 0.21
849 0.19
850 0.26
851 0.24
852 0.24
853 0.28
854 0.3
855 0.33
856 0.41
857 0.4
858 0.4
859 0.49
860 0.58
861 0.6
862 0.66
863 0.7
864 0.67
865 0.76
866 0.79
867 0.79
868 0.77
869 0.75
870 0.71
871 0.66
872 0.66
873 0.58
874 0.5
875 0.42
876 0.37
877 0.33
878 0.27
879 0.23
880 0.17
881 0.15
882 0.13
883 0.13
884 0.12
885 0.12
886 0.13
887 0.19
888 0.24
889 0.24
890 0.24
891 0.26
892 0.29
893 0.31
894 0.31
895 0.27
896 0.22
897 0.21
898 0.24
899 0.21
900 0.17
901 0.14
902 0.15
903 0.12
904 0.11
905 0.11
906 0.08
907 0.08
908 0.09
909 0.08
910 0.05
911 0.05
912 0.06
913 0.05
914 0.07
915 0.1
916 0.1
917 0.13
918 0.19
919 0.28
920 0.33
921 0.34
922 0.34
923 0.33
924 0.35
925 0.34
926 0.3
927 0.26
928 0.28
929 0.32
930 0.33
931 0.35
932 0.32
933 0.32
934 0.33
935 0.29
936 0.22
937 0.19
938 0.18
939 0.16
940 0.16
941 0.14
942 0.12
943 0.11
944 0.11
945 0.11
946 0.09
947 0.06
948 0.06
949 0.07
950 0.12
951 0.13
952 0.16
953 0.17
954 0.18
955 0.19
956 0.19
957 0.2
958 0.15
959 0.15
960 0.13