Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A5ZVQ1

Protein Details
Accession A0A1A5ZVQ1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-66AESSTKPPPPHSKRRRGDENDEPREPBasic
246-271FKLKTEFSKEKWRRRKEKKFSTTVHPBasic
516-540YRSDSHFRMKRRKTGKAAEKEIPRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-171KRGNGKGKGKGKGREN
253-264SKEKWRRRKEKK
525-531KRRKTGK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSMTDTISQPVEAAGVAQPSMEIDIPHPQIIGDEQVPTLAAESSTKPPPPHSKRRRGDENDEPREPLSEVILRRLTRIKEGDTVMLRLPSDAIKVVTIEKNGLIQLGKYGAFPASQLLNLHYDITYEIIGGSASTSASGTSTPLPFLDEDAAMNDKRGNGKGKGKGKGRENDIKSNPGWKNVLRPLKRQNVVEAVIDDITETNEHIHDLPEMEKQTLSHEEIAELRAQGMSVEEIIKKQEESHERFKLKTEFSKEKWRRRKEKKFSTTVHPLSPSIPNILSHYSDRSPASILHLRMDTLSQLLNMANVRPGGRYLVVDDTGGLVTAAVLERMGAQGKILLFTNSDSPPGWGVLNTMNISERELECVKWLNWMEAQDDYERPPPPPEDENAKPAKVAQRLRKHNAQVAELNATRDELHLGGWDGLIIASTLSPISILSFLSPFLLGSAPLVVYSPHQQVLAELLAWSKKDPNYLHDTLSESWTRTYQVLPGRTHPMMNTSASGGYLWSAIKVHPSEYRSDSHFRMKRRKTGKAAEKEIPRVSLEGATENPATRAENVEAVVEPSVEIAEGEAEVEQVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.1
11 0.18
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.18
16 0.19
17 0.2
18 0.22
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.13
30 0.18
31 0.22
32 0.27
33 0.27
34 0.35
35 0.45
36 0.53
37 0.61
38 0.67
39 0.73
40 0.79
41 0.87
42 0.9
43 0.88
44 0.87
45 0.87
46 0.87
47 0.84
48 0.77
49 0.69
50 0.58
51 0.52
52 0.43
53 0.33
54 0.26
55 0.23
56 0.21
57 0.26
58 0.32
59 0.3
60 0.33
61 0.38
62 0.36
63 0.38
64 0.41
65 0.38
66 0.38
67 0.4
68 0.43
69 0.39
70 0.39
71 0.33
72 0.31
73 0.27
74 0.22
75 0.21
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.13
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.1
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.14
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.16
144 0.19
145 0.23
146 0.26
147 0.34
148 0.42
149 0.49
150 0.55
151 0.6
152 0.63
153 0.66
154 0.68
155 0.67
156 0.68
157 0.66
158 0.68
159 0.64
160 0.61
161 0.53
162 0.55
163 0.48
164 0.43
165 0.41
166 0.32
167 0.37
168 0.41
169 0.5
170 0.45
171 0.51
172 0.56
173 0.62
174 0.65
175 0.58
176 0.54
177 0.49
178 0.47
179 0.4
180 0.32
181 0.23
182 0.19
183 0.17
184 0.13
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.14
211 0.11
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.15
227 0.21
228 0.28
229 0.35
230 0.42
231 0.43
232 0.44
233 0.47
234 0.46
235 0.42
236 0.42
237 0.41
238 0.41
239 0.43
240 0.54
241 0.59
242 0.64
243 0.71
244 0.75
245 0.78
246 0.82
247 0.9
248 0.89
249 0.92
250 0.9
251 0.89
252 0.83
253 0.79
254 0.78
255 0.69
256 0.61
257 0.51
258 0.42
259 0.35
260 0.33
261 0.26
262 0.18
263 0.16
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.15
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.17
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.16
283 0.16
284 0.11
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.06
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.11
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.17
353 0.16
354 0.2
355 0.2
356 0.17
357 0.19
358 0.2
359 0.19
360 0.17
361 0.19
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.2
366 0.19
367 0.19
368 0.21
369 0.21
370 0.23
371 0.25
372 0.25
373 0.28
374 0.3
375 0.36
376 0.37
377 0.35
378 0.31
379 0.31
380 0.35
381 0.35
382 0.4
383 0.42
384 0.49
385 0.58
386 0.64
387 0.69
388 0.67
389 0.64
390 0.6
391 0.54
392 0.47
393 0.41
394 0.4
395 0.33
396 0.29
397 0.24
398 0.22
399 0.18
400 0.15
401 0.14
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.08
439 0.12
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.14
445 0.17
446 0.16
447 0.12
448 0.1
449 0.1
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.15
454 0.16
455 0.23
456 0.24
457 0.28
458 0.36
459 0.37
460 0.38
461 0.35
462 0.38
463 0.32
464 0.35
465 0.31
466 0.24
467 0.23
468 0.23
469 0.22
470 0.19
471 0.19
472 0.2
473 0.25
474 0.31
475 0.32
476 0.36
477 0.41
478 0.41
479 0.41
480 0.36
481 0.33
482 0.29
483 0.28
484 0.25
485 0.19
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.13
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.15
497 0.16
498 0.18
499 0.23
500 0.25
501 0.29
502 0.32
503 0.35
504 0.35
505 0.4
506 0.41
507 0.46
508 0.49
509 0.53
510 0.61
511 0.65
512 0.7
513 0.74
514 0.79
515 0.78
516 0.84
517 0.85
518 0.85
519 0.84
520 0.82
521 0.8
522 0.78
523 0.71
524 0.62
525 0.53
526 0.44
527 0.38
528 0.33
529 0.26
530 0.22
531 0.2
532 0.22
533 0.22
534 0.21
535 0.21
536 0.19
537 0.19
538 0.17
539 0.2
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.2
544 0.19
545 0.19
546 0.18
547 0.14
548 0.12
549 0.09
550 0.09
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.05