Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A6AFV0

Protein Details
Accession A0A1A6AFV0    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-41EPNAQASSSKHKSKKDKSHSHKKDKSHKHKENSSHHVTABasic
303-338TTGWTARQLKQHRKEMDKKKRDAKKARKADKVLEEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-32KHKSKKDKSHSHKKDKSHKHK
312-331KQHRKEMDKKKRDAKKARKA
360-375RKAGEGDGDIRKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPEPNAQASSSKHKSKKDKSHSHKKDKSHKHKENSSHHVTASSSSSKSDKSPFEHRLSSMRLSIPPKFSIDMMEGVREKLDGMIMRYVSQMGGVLLAHWDHCFIDDSSKIINECPSGVIEVEFHSILWAPKIGQKLYGTHSLSSPSHLSLLFSKTFNVSIPLHHIPTDLYEFEHTDEAADSDSEDEEEEGFILGNGIVEDVGRWKEKSTGKSLGDGGKGIKFTVIGMQVTNQMLSLTGSLLSDPWNAPPPAETTLTLPSRVSPSPSPSPEPTRPVKQPRLANNKAAAYQAASAPAYEEEEVDTTGWTARQLKQHRKEMDKKKRDAKKARKADKVLEEVQAEAGGDLVGIQGREEAVGTKRKAGEGDGDIRKKKKGDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.76
3 0.83
4 0.84
5 0.87
6 0.88
7 0.93
8 0.95
9 0.95
10 0.93
11 0.92
12 0.91
13 0.92
14 0.92
15 0.92
16 0.91
17 0.9
18 0.91
19 0.91
20 0.91
21 0.88
22 0.85
23 0.77
24 0.67
25 0.59
26 0.5
27 0.42
28 0.37
29 0.32
30 0.24
31 0.24
32 0.26
33 0.25
34 0.28
35 0.33
36 0.33
37 0.35
38 0.44
39 0.49
40 0.53
41 0.55
42 0.53
43 0.52
44 0.51
45 0.49
46 0.43
47 0.38
48 0.38
49 0.39
50 0.42
51 0.4
52 0.37
53 0.37
54 0.34
55 0.31
56 0.28
57 0.25
58 0.24
59 0.21
60 0.23
61 0.21
62 0.2
63 0.2
64 0.17
65 0.15
66 0.11
67 0.13
68 0.1
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.12
77 0.1
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.1
90 0.09
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.14
98 0.15
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.11
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.23
124 0.3
125 0.28
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.22
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.12
146 0.11
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.16
154 0.17
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.15
193 0.2
194 0.24
195 0.28
196 0.34
197 0.34
198 0.36
199 0.38
200 0.34
201 0.31
202 0.28
203 0.23
204 0.18
205 0.17
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.18
238 0.19
239 0.18
240 0.15
241 0.22
242 0.23
243 0.22
244 0.2
245 0.18
246 0.21
247 0.21
248 0.23
249 0.19
250 0.24
251 0.31
252 0.34
253 0.38
254 0.38
255 0.46
256 0.46
257 0.5
258 0.49
259 0.49
260 0.54
261 0.59
262 0.63
263 0.63
264 0.66
265 0.7
266 0.75
267 0.72
268 0.69
269 0.65
270 0.58
271 0.52
272 0.45
273 0.35
274 0.26
275 0.23
276 0.18
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.14
295 0.18
296 0.27
297 0.36
298 0.47
299 0.56
300 0.65
301 0.71
302 0.77
303 0.83
304 0.85
305 0.87
306 0.86
307 0.86
308 0.86
309 0.88
310 0.89
311 0.9
312 0.89
313 0.89
314 0.9
315 0.9
316 0.9
317 0.86
318 0.84
319 0.82
320 0.78
321 0.7
322 0.64
323 0.55
324 0.45
325 0.4
326 0.31
327 0.22
328 0.15
329 0.12
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.1
342 0.14
343 0.22
344 0.24
345 0.3
346 0.32
347 0.33
348 0.34
349 0.33
350 0.35
351 0.33
352 0.41
353 0.44
354 0.51
355 0.56
356 0.58
357 0.61