FuNGI

A0A1A6A944

Protein Details

Accession

A0A1A6A944

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-218	YLPSTKSKKGKEKAKPTPIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
206-212	KKGKEKA

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MARPGQAAMRRKRAREEMEASPSTSTANGQQDPHTTYDYNDNDDTTVDGAQVQGHDQGNRENPRLQCLPVGILPEDFDGTPLDGSQYLAMANRDNADLPFAKRVSNPYKADTFSRNGHASASTMIGTITSTSSGSSSRHPALPKESWETVFPIHFQGYRKHIRSQLISSSSHSLPYPEDYPPLPRPSVRSEWYTLINGYLPSTKSKKGKEKAKPTPILTEEEALNIALGGETNVEMDQEQVEAEVIEEEVIKKTSRGNEKRVGKPREPLLSVIRDLTSSQALTVLSHFSLWITESLEQSPPPLPESPELLPTEPRPRDRVITKQSREAKVFSPLCANYFNWIFSLLLLVDEQLLSDDISTLRELARAVMKVAGHRWITGVVGKDIGENWVLGSDWKDQNEPQKQPDSTMQVNTNDESTNNDNRVDEVLARSWMIVHAIAAGWGQKDLLMELESLFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.72
3	0.69
4	0.66
5	0.68
6	0.65
7	0.58
8	0.49
9	0.41
10	0.33
11	0.27
12	0.2
13	0.18
14	0.24
15	0.25
16	0.27
17	0.3
18	0.34
19	0.36
20	0.38
21	0.35
22	0.28
23	0.27
24	0.35
25	0.34
26	0.34
27	0.32
28	0.3
29	0.26
30	0.26
31	0.25
32	0.17
33	0.15
34	0.1
35	0.09
36	0.08
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.13
41	0.15
42	0.17
43	0.18
44	0.23
45	0.31
46	0.36
47	0.38
48	0.39
49	0.38
50	0.44
51	0.45
52	0.4
53	0.34
54	0.3
55	0.3
56	0.26
57	0.28
58	0.22
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.17
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.08
71	0.09
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.09
76	0.1
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.14
84	0.16
85	0.16
86	0.22
87	0.21
88	0.22
89	0.23
90	0.31
91	0.34
92	0.41
93	0.41
94	0.39
95	0.43
96	0.44
97	0.46
98	0.42
99	0.4
100	0.35
101	0.38
102	0.35
103	0.31
104	0.3
105	0.27
106	0.23
107	0.19
108	0.17
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.08
121	0.1
122	0.12
123	0.17
124	0.19
125	0.22
126	0.24
127	0.26
128	0.32
129	0.34
130	0.35
131	0.36
132	0.36
133	0.33
134	0.33
135	0.32
136	0.26
137	0.23
138	0.2
139	0.16
140	0.15
141	0.17
142	0.18
143	0.21
144	0.27
145	0.35
146	0.37
147	0.4
148	0.44
149	0.45
150	0.47
151	0.46
152	0.46
153	0.41
154	0.39
155	0.37
156	0.36
157	0.31
158	0.29
159	0.24
160	0.18
161	0.16
162	0.17
163	0.17
164	0.13
165	0.15
166	0.15
167	0.2
168	0.23
169	0.26
170	0.24
171	0.22
172	0.26
173	0.3
174	0.35
175	0.32
176	0.31
177	0.31
178	0.32
179	0.33
180	0.3
181	0.24
182	0.19
183	0.17
184	0.14
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.14
189	0.17
190	0.21
191	0.26
192	0.33
193	0.42
194	0.48
195	0.58
196	0.63
197	0.71
198	0.77
199	0.81
200	0.79
201	0.71
202	0.69
203	0.6
204	0.54
205	0.44
206	0.35
207	0.25
208	0.2
209	0.18
210	0.12
211	0.1
212	0.06
213	0.05
214	0.03
215	0.03
216	0.02
217	0.02
218	0.02
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.09
241	0.16
242	0.26
243	0.31
244	0.37
245	0.45
246	0.53
247	0.62
248	0.69
249	0.7
250	0.62
251	0.62
252	0.61
253	0.58
254	0.51
255	0.45
256	0.39
257	0.35
258	0.33
259	0.29
260	0.23
261	0.18
262	0.17
263	0.15
264	0.12
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.09
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.12
285	0.13
286	0.15
287	0.14
288	0.15
289	0.15
290	0.16
291	0.16
292	0.21
293	0.2
294	0.22
295	0.23
296	0.21
297	0.22
298	0.24
299	0.32
300	0.32
301	0.33
302	0.33
303	0.34
304	0.39
305	0.41
306	0.48
307	0.48
308	0.55
309	0.55
310	0.61
311	0.66
312	0.66
313	0.63
314	0.56
315	0.48
316	0.48
317	0.46
318	0.38
319	0.36
320	0.31
321	0.3
322	0.3
323	0.28
324	0.22
325	0.22
326	0.22
327	0.16
328	0.17
329	0.15
330	0.12
331	0.13
332	0.09
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.17
356	0.18
357	0.19
358	0.21
359	0.25
360	0.21
361	0.21
362	0.21
363	0.18
364	0.19
365	0.19
366	0.2
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.15
373	0.12
374	0.1
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.1
380	0.16
381	0.19
382	0.21
383	0.24
384	0.26
385	0.36
386	0.45
387	0.48
388	0.47
389	0.52
390	0.51
391	0.53
392	0.56
393	0.53
394	0.48
395	0.48
396	0.47
397	0.42
398	0.44
399	0.41
400	0.36
401	0.29
402	0.26
403	0.26
404	0.27
405	0.3
406	0.29
407	0.3
408	0.28
409	0.29
410	0.31
411	0.27
412	0.23
413	0.2
414	0.21
415	0.2
416	0.2
417	0.19
418	0.17
419	0.16
420	0.15
421	0.12
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.11
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.1
436	0.1

A0A1A6A944

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer