Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JRH0

Protein Details
Accession I2JRH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-200VYDSRCSKSQRKREEDERGTSKLRTMKPQAQRKRQRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-204TSKLRTMKPQAQRKRQRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013760  Topo_IIA-like_dom_sf  
IPR013757  Topo_IIA_A_a_sf  
IPR002205  Topo_IIA_dom_A  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF00521  DNA_topoisoIV  
Amino Acid Sequences MVTDLSNQLEKLSSQARFVKMIIERELXVSNKKRPVIVKELQEKGFPGFDKENKPIRVDIXDNDLKDESSTEEEEDADVTTAAETETGMVVDNSKSVNSLYDYLLGMQIWSLTKERYDKLLKQRDQKEIELTTLLGKSAKDLWNEDLDVFVEAWHTFFERRXREAEVYDSRCSKSQRKXREEDERGTSKLRTMKPQAQRKRQRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.32
4 0.33
5 0.33
6 0.35
7 0.34
8 0.37
9 0.35
10 0.32
11 0.3
12 0.31
13 0.37
14 0.35
15 0.36
16 0.38
17 0.38
18 0.41
19 0.44
20 0.44
21 0.45
22 0.49
23 0.5
24 0.52
25 0.57
26 0.58
27 0.56
28 0.53
29 0.47
30 0.4
31 0.37
32 0.29
33 0.25
34 0.25
35 0.29
36 0.33
37 0.39
38 0.45
39 0.44
40 0.45
41 0.42
42 0.4
43 0.38
44 0.35
45 0.33
46 0.34
47 0.33
48 0.32
49 0.31
50 0.28
51 0.24
52 0.21
53 0.18
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.08
99 0.11
100 0.12
101 0.18
102 0.22
103 0.27
104 0.37
105 0.47
106 0.51
107 0.57
108 0.63
109 0.65
110 0.65
111 0.6
112 0.55
113 0.46
114 0.42
115 0.33
116 0.27
117 0.2
118 0.16
119 0.14
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.14
124 0.18
125 0.17
126 0.2
127 0.22
128 0.24
129 0.24
130 0.23
131 0.18
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.14
143 0.21
144 0.26
145 0.28
146 0.33
147 0.35
148 0.35
149 0.42
150 0.45
151 0.44
152 0.44
153 0.45
154 0.42
155 0.44
156 0.48
157 0.49
158 0.52
159 0.56
160 0.61
161 0.67
162 0.74
163 0.79
164 0.85
165 0.82
166 0.81
167 0.77
168 0.71
169 0.66
170 0.58
171 0.54
172 0.51
173 0.48
174 0.48
175 0.51
176 0.55
177 0.62
178 0.73
179 0.78
180 0.81