Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JVM0

Protein Details
Accession I2JVM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-422LDSPASIKASKRKKVKRNILERANSKNSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-417KPSKRKLDSPASIKASKRKKVKRN
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007174  Las1  
Gene Ontology GO:0090730  C:Las1 complex  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04031  Las1  
Amino Acid Sequences MTLPNKITDPEPSRRCVGFAQGGTVPHSIEITSLFTSSILLDERLTKIGVYDDTTVRLSYTMAMIKFVNGILDPYQQSSYAISLHRLAELIKLPSYFVELRHIGTHEHIPTLEMLRWSTRRALQWLDENYWCHVTXLNLREGRPXFLRXGDERFEKRAAVIGELREILHNLKELRLEDSTLTYKEGDFTGNGKFYWEYLXRLKQIAQDSEEMKNLLVQVFIFDPDGIILRSKSLSERAAKSLHFLYKPILQDMGPEFVMLLFXKLYEFMTKNEYLEVVNDVNFGEVLVKGDERYMLPRNEAECVQGRKWIEYMLKNVFVFGKKPQIVRFINEESAEKIVRLISLQNNDESIRMLEFFRDKNSDVIKEVPELSGKIDKALETMNKFKLPDFXVQKPSKRKLDSPASIKASKRKKVKRNILERANSKNSIFKRYDDWIPVPFGCPXL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.42
4 0.43
5 0.41
6 0.37
7 0.37
8 0.35
9 0.35
10 0.36
11 0.34
12 0.27
13 0.19
14 0.19
15 0.14
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.18
40 0.2
41 0.22
42 0.21
43 0.18
44 0.17
45 0.14
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.17
54 0.16
55 0.13
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.21
83 0.18
84 0.16
85 0.2
86 0.19
87 0.21
88 0.22
89 0.23
90 0.19
91 0.21
92 0.25
93 0.2
94 0.2
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.19
99 0.18
100 0.14
101 0.14
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.24
106 0.26
107 0.28
108 0.3
109 0.33
110 0.31
111 0.37
112 0.39
113 0.38
114 0.37
115 0.35
116 0.33
117 0.31
118 0.28
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.19
123 0.25
124 0.27
125 0.26
126 0.27
127 0.28
128 0.28
129 0.27
130 0.25
131 0.2
132 0.25
133 0.25
134 0.32
135 0.39
136 0.42
137 0.42
138 0.41
139 0.39
140 0.3
141 0.33
142 0.26
143 0.2
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.13
150 0.13
151 0.11
152 0.09
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.13
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.24
184 0.24
185 0.24
186 0.27
187 0.28
188 0.25
189 0.24
190 0.25
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.19
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.1
217 0.13
218 0.17
219 0.2
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.26
225 0.26
226 0.22
227 0.2
228 0.19
229 0.22
230 0.23
231 0.21
232 0.18
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.04
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.12
276 0.16
277 0.17
278 0.18
279 0.21
280 0.22
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.27
286 0.26
287 0.27
288 0.27
289 0.26
290 0.26
291 0.27
292 0.26
293 0.24
294 0.3
295 0.29
296 0.33
297 0.31
298 0.32
299 0.3
300 0.26
301 0.25
302 0.22
303 0.27
304 0.27
305 0.3
306 0.32
307 0.38
308 0.39
309 0.41
310 0.44
311 0.38
312 0.38
313 0.36
314 0.34
315 0.27
316 0.28
317 0.25
318 0.18
319 0.15
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.14
324 0.16
325 0.22
326 0.23
327 0.23
328 0.25
329 0.25
330 0.24
331 0.21
332 0.17
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.17
338 0.18
339 0.21
340 0.23
341 0.24
342 0.28
343 0.32
344 0.31
345 0.3
346 0.33
347 0.3
348 0.29
349 0.29
350 0.24
351 0.22
352 0.2
353 0.21
354 0.22
355 0.21
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.19
360 0.23
361 0.25
362 0.25
363 0.31
364 0.33
365 0.35
366 0.36
367 0.35
368 0.37
369 0.36
370 0.42
371 0.42
372 0.46
373 0.54
374 0.62
375 0.68
376 0.71
377 0.75
378 0.69
379 0.69
380 0.7
381 0.7
382 0.7
383 0.69
384 0.69
385 0.67
386 0.68
387 0.67
388 0.67
389 0.66
390 0.66
391 0.7
392 0.71
393 0.75
394 0.81
395 0.87
396 0.89
397 0.9
398 0.92
399 0.92
400 0.91
401 0.87
402 0.85
403 0.82
404 0.74
405 0.65
406 0.62
407 0.56
408 0.55
409 0.51
410 0.44
411 0.43
412 0.45
413 0.5
414 0.49
415 0.49
416 0.44
417 0.46
418 0.45