Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JU55

Protein Details
Accession I2JU55    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-256HSDYLKPKRMKRLKKKTRDGFRNQEKFIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-220RKKRKK
239-251KPKRMKRLKKKTR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
Amino Acid Sequences MLILTVEETNKLRAQVGLSLIPVSGSERSLGAKTGHINRNENDITLNVQGRRSGCREISVEETNRLRNIVGLKPLSSGGLHETEVPXGRDKSDNIIQIKKKLHKITSELKVSDQIAKGGIVERTSPNTNTQDEAKWLEXLGKGDVVSKEKLKLHFKGSINETPKKRITDTKXGIXKDSSDNKIIRSSKSLANXNSPNEPSRKSANLNDNNKGVTRKKRKKFMVILDDDEIETVHSDYLKPKRMKRLKKKTRDGFRNQEKFXIFPERLKNVELVNEDVGNEDDEDIRKSMDSFRKEVLTQMAPRDIQKKNAIQQSDKTQTRGVGLEINEEIDFLNKFDYEKNVQMKGNRRQELNTDTSFDDRSKLGPADTNVVKRDISKIMDKGLNEISNLGIGAMVDALKDATPEKKSSPNQINLVYTDDSGKVLTTKGGLQVFIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.2
8 0.18
9 0.16
10 0.15
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.14
16 0.15
17 0.17
18 0.16
19 0.18
20 0.25
21 0.34
22 0.39
23 0.43
24 0.47
25 0.46
26 0.54
27 0.5
28 0.44
29 0.36
30 0.3
31 0.27
32 0.27
33 0.3
34 0.23
35 0.24
36 0.27
37 0.27
38 0.32
39 0.33
40 0.34
41 0.31
42 0.34
43 0.35
44 0.35
45 0.39
46 0.41
47 0.39
48 0.39
49 0.41
50 0.39
51 0.38
52 0.35
53 0.29
54 0.25
55 0.27
56 0.25
57 0.29
58 0.27
59 0.27
60 0.28
61 0.28
62 0.26
63 0.21
64 0.18
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.2
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.2
78 0.25
79 0.3
80 0.32
81 0.4
82 0.41
83 0.47
84 0.54
85 0.58
86 0.59
87 0.59
88 0.6
89 0.57
90 0.6
91 0.63
92 0.63
93 0.63
94 0.55
95 0.49
96 0.48
97 0.44
98 0.42
99 0.33
100 0.25
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.16
105 0.16
106 0.11
107 0.13
108 0.14
109 0.17
110 0.2
111 0.21
112 0.23
113 0.26
114 0.26
115 0.26
116 0.27
117 0.24
118 0.24
119 0.26
120 0.21
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.19
134 0.22
135 0.27
136 0.33
137 0.35
138 0.37
139 0.43
140 0.43
141 0.45
142 0.47
143 0.48
144 0.49
145 0.52
146 0.5
147 0.48
148 0.5
149 0.47
150 0.43
151 0.44
152 0.45
153 0.48
154 0.54
155 0.57
156 0.59
157 0.57
158 0.55
159 0.52
160 0.5
161 0.44
162 0.46
163 0.37
164 0.32
165 0.38
166 0.4
167 0.36
168 0.35
169 0.33
170 0.29
171 0.36
172 0.39
173 0.36
174 0.41
175 0.43
176 0.4
177 0.42
178 0.41
179 0.37
180 0.34
181 0.32
182 0.29
183 0.29
184 0.3
185 0.31
186 0.38
187 0.44
188 0.47
189 0.48
190 0.45
191 0.43
192 0.41
193 0.39
194 0.34
195 0.35
196 0.42
197 0.49
198 0.55
199 0.64
200 0.68
201 0.73
202 0.76
203 0.75
204 0.73
205 0.66
206 0.62
207 0.53
208 0.48
209 0.39
210 0.3
211 0.21
212 0.11
213 0.08
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.1
219 0.16
220 0.25
221 0.29
222 0.34
223 0.44
224 0.54
225 0.64
226 0.71
227 0.77
228 0.79
229 0.85
230 0.91
231 0.9
232 0.91
233 0.91
234 0.88
235 0.87
236 0.87
237 0.84
238 0.74
239 0.69
240 0.59
241 0.53
242 0.48
243 0.45
244 0.34
245 0.35
246 0.37
247 0.36
248 0.36
249 0.34
250 0.3
251 0.26
252 0.27
253 0.21
254 0.19
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.16
270 0.22
271 0.25
272 0.26
273 0.28
274 0.31
275 0.31
276 0.32
277 0.29
278 0.27
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.26
283 0.29
284 0.34
285 0.3
286 0.32
287 0.36
288 0.39
289 0.42
290 0.47
291 0.48
292 0.44
293 0.47
294 0.51
295 0.53
296 0.5
297 0.45
298 0.41
299 0.38
300 0.37
301 0.33
302 0.25
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.17
307 0.18
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.1
312 0.1
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.1
318 0.15
319 0.18
320 0.25
321 0.3
322 0.33
323 0.36
324 0.41
325 0.5
326 0.55
327 0.6
328 0.57
329 0.54
330 0.52
331 0.56
332 0.56
333 0.52
334 0.44
335 0.37
336 0.34
337 0.34
338 0.34
339 0.28
340 0.24
341 0.18
342 0.18
343 0.19
344 0.18
345 0.18
346 0.2
347 0.22
348 0.27
349 0.31
350 0.34
351 0.32
352 0.33
353 0.32
354 0.28
355 0.31
356 0.29
357 0.28
358 0.3
359 0.3
360 0.35
361 0.38
362 0.37
363 0.37
364 0.38
365 0.35
366 0.29
367 0.27
368 0.21
369 0.18
370 0.18
371 0.13
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.08
383 0.13
384 0.17
385 0.2
386 0.24
387 0.33
388 0.38
389 0.48
390 0.56
391 0.58
392 0.6
393 0.62
394 0.61
395 0.53
396 0.53
397 0.44
398 0.35
399 0.3
400 0.24
401 0.2
402 0.17
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.14
409 0.19
410 0.21