Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JVN0

Protein Details
Accession I2JVN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-375SLLEKEKERNEKRYTREKQKLDWDKKTIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-327KRKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
Amino Acid Sequences MAVKXRLEIFKIEPPGLFRGRGAHPKTGMLKRRVYPEQVTLNLGNEAEVPLPPKGHNWKEVRHDNTVSWLAMWRENISNSFKYVRFANNSSLKGISDFKKFEKARALKNVIDDIRKDYRRKLKSKLMIERQIATATYFIDVLALRAGGEKSEDEADTVGCCSLRYEHIFLRPPNTVIFDFLGKDSVRFYQEVEVDPQVFKNLRIFKKAPKKPGDDLFDRLDPSILNKYFHSYLPGLTAKVFRTYNASKTMQDQLDLIPNKGTVNEKVVRFNAANREVAILCNHQRNVSKGFEASVQKMNEKIEEMQWRKFRLKRMMLQLDKNLKRKKGKAYFDEIETLXKEKEQQIINSLLEKEKERNEKRYTREKQKLDWDKKTIFTERIPRXX
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.37
4 0.31
5 0.29
6 0.35
7 0.43
8 0.44
9 0.45
10 0.44
11 0.49
12 0.57
13 0.6
14 0.63
15 0.6
16 0.63
17 0.61
18 0.68
19 0.67
20 0.64
21 0.6
22 0.58
23 0.59
24 0.53
25 0.53
26 0.45
27 0.41
28 0.36
29 0.31
30 0.24
31 0.16
32 0.15
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.2
40 0.29
41 0.33
42 0.41
43 0.44
44 0.5
45 0.58
46 0.67
47 0.66
48 0.63
49 0.61
50 0.52
51 0.53
52 0.49
53 0.39
54 0.3
55 0.28
56 0.23
57 0.23
58 0.24
59 0.2
60 0.19
61 0.21
62 0.24
63 0.26
64 0.25
65 0.26
66 0.29
67 0.27
68 0.27
69 0.29
70 0.31
71 0.32
72 0.33
73 0.39
74 0.42
75 0.42
76 0.42
77 0.4
78 0.34
79 0.3
80 0.32
81 0.28
82 0.27
83 0.28
84 0.28
85 0.38
86 0.38
87 0.4
88 0.45
89 0.47
90 0.49
91 0.56
92 0.59
93 0.51
94 0.53
95 0.56
96 0.48
97 0.46
98 0.39
99 0.35
100 0.39
101 0.42
102 0.41
103 0.43
104 0.5
105 0.57
106 0.62
107 0.64
108 0.65
109 0.68
110 0.75
111 0.77
112 0.76
113 0.75
114 0.71
115 0.65
116 0.56
117 0.48
118 0.39
119 0.29
120 0.2
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.09
150 0.12
151 0.14
152 0.16
153 0.22
154 0.28
155 0.28
156 0.3
157 0.28
158 0.26
159 0.24
160 0.25
161 0.19
162 0.16
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.13
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.14
187 0.22
188 0.23
189 0.29
190 0.31
191 0.38
192 0.48
193 0.54
194 0.57
195 0.56
196 0.6
197 0.59
198 0.65
199 0.61
200 0.54
201 0.52
202 0.46
203 0.4
204 0.35
205 0.3
206 0.23
207 0.17
208 0.16
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.2
214 0.22
215 0.22
216 0.23
217 0.16
218 0.16
219 0.19
220 0.2
221 0.17
222 0.16
223 0.19
224 0.16
225 0.2
226 0.19
227 0.15
228 0.21
229 0.23
230 0.26
231 0.3
232 0.31
233 0.28
234 0.31
235 0.37
236 0.3
237 0.28
238 0.25
239 0.2
240 0.26
241 0.26
242 0.23
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.18
247 0.19
248 0.13
249 0.18
250 0.23
251 0.23
252 0.27
253 0.28
254 0.3
255 0.28
256 0.3
257 0.32
258 0.3
259 0.3
260 0.26
261 0.28
262 0.25
263 0.25
264 0.23
265 0.19
266 0.2
267 0.25
268 0.25
269 0.26
270 0.29
271 0.31
272 0.34
273 0.32
274 0.3
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.29
279 0.29
280 0.3
281 0.29
282 0.28
283 0.3
284 0.3
285 0.26
286 0.25
287 0.23
288 0.23
289 0.32
290 0.34
291 0.4
292 0.44
293 0.48
294 0.53
295 0.55
296 0.58
297 0.58
298 0.63
299 0.63
300 0.69
301 0.75
302 0.74
303 0.75
304 0.75
305 0.75
306 0.74
307 0.75
308 0.72
309 0.69
310 0.72
311 0.74
312 0.76
313 0.75
314 0.77
315 0.76
316 0.78
317 0.74
318 0.68
319 0.67
320 0.56
321 0.5
322 0.43
323 0.38
324 0.3
325 0.32
326 0.29
327 0.29
328 0.33
329 0.3
330 0.32
331 0.35
332 0.34
333 0.33
334 0.34
335 0.31
336 0.29
337 0.31
338 0.32
339 0.36
340 0.46
341 0.48
342 0.55
343 0.62
344 0.68
345 0.73
346 0.79
347 0.8
348 0.81
349 0.84
350 0.82
351 0.8
352 0.83
353 0.86
354 0.85
355 0.84
356 0.81
357 0.76
358 0.75
359 0.74
360 0.69
361 0.63