Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JV61

Protein Details
Accession I2JV61    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-184SEEREGSHRKRRLKRHQTLVCTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-178RKRRLK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 15, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037850  RBBP5/Swd1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNLSLLDPFAVASDFPETLTETLSYGYSTCVKFNRKGDYLASGLADGNIVIIDVDTNSVILILRGHVRAITSLCWSEDGRYLLSSSRDFKVDLWDLKXGSAIRTVVFDSPIWGSTMFXDDIFKFTASLFENDAVIVDMSEKDNAKIVKLSTKPVMANXEVNSSGSEEREGSHRKRRLKRHQTLVCTLSKDGKYIITGTSRGWINVIDRASVKTLXSFKVCDSNIKGIEISVTGSRMIVNAGDKTLRQYLVAPNWESIQLQQXYQDVVNKIQYNGVKFSYDSEYLCASTLGSTHDIYIWEAKMGSLVKILEGSKEELISVDWNYRRCCIAATGMDSGTIYLWSVVYPQKWSNLAPDFEEIEENIDYEEKEDEFDLIDSAKESGKVDQQEQYDVDVVTKDEKDARGFXFIDSFVIETKLDDFDAIGSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.16
15 0.16
16 0.2
17 0.26
18 0.32
19 0.39
20 0.45
21 0.52
22 0.49
23 0.52
24 0.5
25 0.48
26 0.44
27 0.38
28 0.32
29 0.24
30 0.21
31 0.18
32 0.15
33 0.09
34 0.07
35 0.05
36 0.05
37 0.04
38 0.03
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.07
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.21
65 0.22
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.22
71 0.23
72 0.22
73 0.22
74 0.22
75 0.23
76 0.22
77 0.27
78 0.31
79 0.3
80 0.3
81 0.29
82 0.28
83 0.28
84 0.3
85 0.23
86 0.18
87 0.17
88 0.14
89 0.13
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.07
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.1
119 0.08
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.15
131 0.15
132 0.2
133 0.22
134 0.25
135 0.24
136 0.27
137 0.27
138 0.25
139 0.31
140 0.24
141 0.24
142 0.22
143 0.21
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.14
153 0.2
154 0.23
155 0.32
156 0.38
157 0.47
158 0.56
159 0.67
160 0.72
161 0.78
162 0.82
163 0.83
164 0.84
165 0.81
166 0.77
167 0.71
168 0.62
169 0.53
170 0.44
171 0.4
172 0.32
173 0.27
174 0.22
175 0.18
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.14
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.17
203 0.2
204 0.19
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.18
210 0.16
211 0.13
212 0.11
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.17
232 0.21
233 0.25
234 0.23
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.15
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.2
256 0.21
257 0.18
258 0.17
259 0.19
260 0.2
261 0.19
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.13
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.14
279 0.12
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.15
302 0.18
303 0.22
304 0.23
305 0.25
306 0.25
307 0.24
308 0.24
309 0.2
310 0.23
311 0.22
312 0.24
313 0.25
314 0.24
315 0.24
316 0.22
317 0.2
318 0.14
319 0.11
320 0.07
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.08
325 0.11
326 0.12
327 0.16
328 0.18
329 0.21
330 0.23
331 0.24
332 0.29
333 0.32
334 0.32
335 0.3
336 0.31
337 0.29
338 0.28
339 0.28
340 0.2
341 0.17
342 0.16
343 0.14
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.12
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.14
364 0.2
365 0.24
366 0.26
367 0.31
368 0.31
369 0.34
370 0.34
371 0.33
372 0.29
373 0.25
374 0.23
375 0.18
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.2
381 0.22
382 0.26
383 0.27
384 0.3
385 0.29
386 0.3
387 0.28
388 0.27
389 0.25
390 0.2
391 0.22
392 0.19
393 0.17
394 0.16
395 0.16
396 0.15
397 0.16
398 0.16
399 0.12
400 0.11