Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JW72

Protein Details
Accession I2JW72    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-43IGSSRSSKSRVNKPARNSRRRNGRHFRPVLHHydrophilic
134-171DRIFAASQRKPKKKNNRRKEKKEKKKKQTHRKTAEELDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-37KSRVNKPAXRNSRRRNGR
145-168RKPKKKNNRRKEKKEKKKKQTHRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MSSLLEQSLDEIIGSSRSSKSRVNKPAXRNSRRRNGRHFRPVLHLDEETEHLAKGEPYLRVSNLHPDLTEKDLXELFSRIGEXKFVKLEMNTRGQSTGVAFVGYTHPSDCSLAIDKFDGRRAAGQIICVENAVPLADRIFAASQRKPKKKNNRRKEKKEKKKKQTHRKTAEELDAELSQYMSNEGQIPVAQDNGGANAXDTDAPMDEPAAEQPENVPXSQNAPASESANXQNAPAQNAEPQATDERFAAVNNGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.13
4 0.16
5 0.2
6 0.26
7 0.34
8 0.44
9 0.54
10 0.62
11 0.66
12 0.74
13 0.82
14 0.86
15 0.88
16 0.86
17 0.85
18 0.86
19 0.87
20 0.88
21 0.88
22 0.87
23 0.87
24 0.85
25 0.79
26 0.76
27 0.73
28 0.67
29 0.6
30 0.5
31 0.4
32 0.36
33 0.34
34 0.28
35 0.23
36 0.18
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.13
41 0.15
42 0.14
43 0.16
44 0.19
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.28
49 0.27
50 0.26
51 0.24
52 0.24
53 0.26
54 0.26
55 0.25
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.12
62 0.1
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.17
70 0.2
71 0.14
72 0.19
73 0.22
74 0.27
75 0.27
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.22
80 0.18
81 0.16
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.16
102 0.14
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.08
125 0.12
126 0.16
127 0.24
128 0.34
129 0.42
130 0.49
131 0.58
132 0.68
133 0.75
134 0.82
135 0.85
136 0.87
137 0.9
138 0.94
139 0.96
140 0.96
141 0.96
142 0.96
143 0.96
144 0.96
145 0.96
146 0.96
147 0.96
148 0.96
149 0.95
150 0.93
151 0.9
152 0.85
153 0.8
154 0.75
155 0.65
156 0.54
157 0.46
158 0.36
159 0.28
160 0.21
161 0.16
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.16
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.13
201 0.18
202 0.2
203 0.19
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.22
208 0.25
209 0.23
210 0.24
211 0.25
212 0.26
213 0.27
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.21
221 0.23
222 0.28
223 0.27
224 0.27
225 0.22
226 0.21
227 0.2
228 0.2