Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A194VCG9

Protein Details
Accession A0A194VCG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-563ATAFRDTPRRSRPRDSESPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
648-662SRGRGRGTSRGRRRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 16, nucl 13.5, cyto 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011425  Med9  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF07544  Med9  
Amino Acid Sequences MTSPRPPAGGANPHPLPGGLSPDSIDVPSELYTILSRVRYTDKSGTATASGDGEPGKPGGANTPAAGPSGATPAAGGADGAAGGGNPASKPLSTKDLVAATDPLKHKIQRARAAVHTLPDIERSIPEQEAEIREWENKIARQREVLQQLKEFGIQFSHGSSDIEMGGTADALAVSVAGNEYEDGALLREIAGHRFSGGSPLSSPLQNKAPIVGVGADLETHVEDTPMPDVEGQSITKGPLRDAISVGFSLETQAAIVGIKSQPGELAQEEFALEQQAEDKRPIEDPTLETANIVKNNNAFGTAPVGIGPPEARGETTKSEAIDEQNSITQEQQEGGLSGYHIEELGPSIPGVNPLNKSGQGYYSLQGLGNTSDVDPLAEREATKALSFTEVGDEARRVGISVNREPPQVEVVDAPGSKIVANNAPMELDTAASQAPEQESMVRDYELDGHGDIQPTHSETAEVGRDNTQSKTHENITADLSSQVSSLAATDGWLRIEISEHFKRVRNQLYFMKSLEEMQSASHATPKGKVKDSEPGGPSSSATATAFRDTPRRSRPRDSESPDQIIEEKPTSSLDAEEEVVVLTDPLEADDVAMGQQVDDVNAIAGEQSSIPPSGADRSRDTAASATGDNVTDQVIVADPTAGRATSSRGRGRGTSRGRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.34
4 0.26
5 0.28
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.21
10 0.22
11 0.2
12 0.19
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.15
23 0.15
24 0.18
25 0.24
26 0.26
27 0.32
28 0.38
29 0.39
30 0.41
31 0.42
32 0.41
33 0.36
34 0.34
35 0.28
36 0.23
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.14
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.15
55 0.12
56 0.15
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.06
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.14
79 0.2
80 0.2
81 0.22
82 0.24
83 0.26
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.2
88 0.27
89 0.27
90 0.27
91 0.29
92 0.31
93 0.36
94 0.41
95 0.49
96 0.51
97 0.56
98 0.57
99 0.57
100 0.62
101 0.56
102 0.5
103 0.42
104 0.35
105 0.3
106 0.26
107 0.24
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.18
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.18
120 0.2
121 0.21
122 0.23
123 0.23
124 0.25
125 0.32
126 0.35
127 0.35
128 0.38
129 0.41
130 0.46
131 0.51
132 0.53
133 0.48
134 0.44
135 0.45
136 0.41
137 0.4
138 0.32
139 0.23
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.12
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.21
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.1
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.05
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.16
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.04
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.18
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.17
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.11
287 0.08
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.09
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.04
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.08
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.1
387 0.14
388 0.19
389 0.25
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.26
394 0.25
395 0.2
396 0.16
397 0.1
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.1
415 0.08
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.11
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.12
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.13
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.14
452 0.17
453 0.18
454 0.2
455 0.2
456 0.2
457 0.22
458 0.25
459 0.26
460 0.28
461 0.28
462 0.28
463 0.28
464 0.26
465 0.23
466 0.2
467 0.18
468 0.13
469 0.12
470 0.1
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.11
485 0.18
486 0.21
487 0.23
488 0.26
489 0.31
490 0.36
491 0.43
492 0.5
493 0.45
494 0.47
495 0.52
496 0.55
497 0.52
498 0.48
499 0.42
500 0.34
501 0.33
502 0.29
503 0.22
504 0.17
505 0.14
506 0.16
507 0.14
508 0.14
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.22
513 0.3
514 0.34
515 0.39
516 0.41
517 0.4
518 0.47
519 0.51
520 0.52
521 0.47
522 0.43
523 0.39
524 0.37
525 0.34
526 0.27
527 0.23
528 0.17
529 0.15
530 0.15
531 0.14
532 0.16
533 0.18
534 0.18
535 0.26
536 0.28
537 0.36
538 0.45
539 0.53
540 0.57
541 0.65
542 0.72
543 0.73
544 0.8
545 0.79
546 0.78
547 0.76
548 0.74
549 0.64
550 0.57
551 0.49
552 0.41
553 0.37
554 0.28
555 0.22
556 0.17
557 0.18
558 0.18
559 0.16
560 0.15
561 0.13
562 0.13
563 0.14
564 0.13
565 0.12
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.07
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.06
582 0.05
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.11
601 0.17
602 0.22
603 0.25
604 0.28
605 0.32
606 0.34
607 0.35
608 0.34
609 0.29
610 0.26
611 0.24
612 0.2
613 0.18
614 0.16
615 0.16
616 0.15
617 0.14
618 0.12
619 0.1
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.08
627 0.1
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.12
632 0.18
633 0.23
634 0.32
635 0.37
636 0.4
637 0.44
638 0.49
639 0.54
640 0.58
641 0.62
642 0.64