Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168BYB7

Protein Details
Accession A0A168BYB7    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-249ISGSQGKKQRERERKVKQTLDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-109PRGGYGARVRGSRGSRRPR
236-240RERER
257-296RTRGGGRGGRGGRGGRGGGERGGERGGSDRGRGGSFRGGR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSQVASQNRFAFLGNDSDGEEKPVAPVKTVDKALPRTTKRNVEPQAPAAPTRGTGNRRAGPRGNEGAFRDRGAGSDRNHARSTDEAPRDGPRGGYGARVRGSRGSRRPRENDDRHTTRSGGHAGSEKQSAQSWGATEGEAELNDEQAGEAIAQAEKKEALVEDAAGEEPAEPEDKSVSFTDYLAQLAEKKLALGEDFKPRGPNEGSKLDKKWANAKPIEKADDEDFISGSQGKKQRERERKVKQTLDFDPRFVEPERTRGGGRGGRGGRGGRGGGERGGERGGSDRGRGGSFRGGRGGAASINTKDESAFPSLGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.2
8 0.15
9 0.17
10 0.23
11 0.21
12 0.2
13 0.24
14 0.25
15 0.31
16 0.33
17 0.34
18 0.35
19 0.4
20 0.47
21 0.53
22 0.54
23 0.56
24 0.61
25 0.67
26 0.65
27 0.7
28 0.67
29 0.64
30 0.64
31 0.61
32 0.6
33 0.53
34 0.48
35 0.4
36 0.36
37 0.29
38 0.29
39 0.31
40 0.27
41 0.32
42 0.4
43 0.43
44 0.46
45 0.51
46 0.52
47 0.5
48 0.54
49 0.53
50 0.47
51 0.46
52 0.45
53 0.46
54 0.41
55 0.37
56 0.32
57 0.25
58 0.24
59 0.25
60 0.27
61 0.23
62 0.31
63 0.35
64 0.37
65 0.38
66 0.38
67 0.35
68 0.32
69 0.36
70 0.35
71 0.34
72 0.3
73 0.31
74 0.34
75 0.34
76 0.31
77 0.26
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.21
82 0.2
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.28
88 0.33
89 0.36
90 0.44
91 0.5
92 0.56
93 0.63
94 0.68
95 0.71
96 0.77
97 0.76
98 0.76
99 0.75
100 0.72
101 0.68
102 0.65
103 0.56
104 0.46
105 0.41
106 0.35
107 0.25
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.2
112 0.21
113 0.18
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.25
186 0.25
187 0.29
188 0.29
189 0.3
190 0.27
191 0.34
192 0.38
193 0.4
194 0.42
195 0.42
196 0.42
197 0.4
198 0.44
199 0.41
200 0.45
201 0.46
202 0.47
203 0.49
204 0.51
205 0.52
206 0.43
207 0.4
208 0.34
209 0.31
210 0.28
211 0.21
212 0.17
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.15
218 0.2
219 0.25
220 0.32
221 0.42
222 0.52
223 0.61
224 0.7
225 0.75
226 0.8
227 0.85
228 0.87
229 0.85
230 0.8
231 0.77
232 0.76
233 0.76
234 0.66
235 0.56
236 0.49
237 0.42
238 0.4
239 0.34
240 0.34
241 0.26
242 0.3
243 0.33
244 0.33
245 0.33
246 0.31
247 0.37
248 0.32
249 0.32
250 0.35
251 0.33
252 0.32
253 0.35
254 0.35
255 0.3
256 0.29
257 0.27
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.2
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.19
266 0.16
267 0.14
268 0.15
269 0.19
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.24
277 0.28
278 0.3
279 0.31
280 0.32
281 0.29
282 0.28
283 0.29
284 0.27
285 0.19
286 0.18
287 0.2
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.21
296 0.2