Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167X847

Protein Details
Accession A0A167X847    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-39ESQPAGPPSKRRRRHAGGESQSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-29SKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MGLVDYSSLSSSSADESQPAGPPSKRRRRHAGGESQSDSGLPPLPDMFHDLYASTVRQSVADDPSLHQGRKRQNPHIAGNWPTHIYLEWHPSKVQHDVLVALVEKTQKQIGCANRLHSFLTSDLGTHLPLHISLSKPLSLPASIKDDFLDGVEESIRSGGMSPFSIKPAGLAWHKSPDSDRSFFVLRVATASTAMADKHHDGGESLMQGTNPELMQLLVKCNKVATNFGQPPLYQQTHDEPAHAAFHISIGWTLGRLDDETCLEVLGNFKDNAFREIHSWHIPVDTVKTKIGNIVSRTPLTLTRPGKKEGVDNLIGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.16
4 0.18
5 0.21
6 0.22
7 0.25
8 0.26
9 0.36
10 0.46
11 0.55
12 0.62
13 0.66
14 0.74
15 0.77
16 0.84
17 0.84
18 0.84
19 0.82
20 0.82
21 0.77
22 0.67
23 0.58
24 0.48
25 0.38
26 0.28
27 0.24
28 0.15
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.19
34 0.19
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.17
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.28
52 0.32
53 0.31
54 0.3
55 0.34
56 0.4
57 0.49
58 0.56
59 0.55
60 0.61
61 0.67
62 0.7
63 0.7
64 0.66
65 0.59
66 0.54
67 0.48
68 0.4
69 0.33
70 0.28
71 0.21
72 0.19
73 0.18
74 0.24
75 0.25
76 0.25
77 0.25
78 0.27
79 0.29
80 0.29
81 0.28
82 0.21
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.14
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.12
95 0.14
96 0.2
97 0.23
98 0.29
99 0.31
100 0.33
101 0.33
102 0.34
103 0.33
104 0.28
105 0.25
106 0.18
107 0.17
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.2
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.25
165 0.28
166 0.27
167 0.27
168 0.24
169 0.26
170 0.25
171 0.25
172 0.19
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.13
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.21
213 0.27
214 0.3
215 0.31
216 0.32
217 0.3
218 0.33
219 0.36
220 0.34
221 0.24
222 0.25
223 0.28
224 0.34
225 0.34
226 0.3
227 0.24
228 0.24
229 0.25
230 0.22
231 0.17
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.12
256 0.13
257 0.18
258 0.19
259 0.21
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.22
264 0.27
265 0.26
266 0.26
267 0.24
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.26
272 0.26
273 0.24
274 0.26
275 0.27
276 0.26
277 0.3
278 0.34
279 0.33
280 0.33
281 0.37
282 0.4
283 0.4
284 0.4
285 0.38
286 0.37
287 0.35
288 0.4
289 0.41
290 0.45
291 0.48
292 0.52
293 0.54
294 0.52
295 0.54
296 0.51
297 0.51