FuNGI

A0A166VGL9

Protein Details

Accession

A0A166VGL9

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-33	GSQNATHRSQRPNPLRPMRNRPRLVQSL	Hydrophilic
181-206	APVAKEPIPKRPKKQKEEKTLFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
185-201	KEPIPKRPKKQKEEKTL
489-508	KFKQGEVPRKTKSLKRPGSP
519-525	SRKKFKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MTPQPGSQNATHRSQRPNPLRPMRNRPRLVQSLVAKPQRNPENTTAKPTIMTRQVQSNRSEPNVDELRKQYGGWSDPPPQYSYTDIPILTTKKSLLEGVRYHLMKFSQPRASDSAVDPTDRDEFTRPVTLHRRDARQAPPGRAVKEDPVETPQIDVKEADRLAQIKAERETQRAIDQAKIAPVAKEPIPKRPKKQKEEKTLFNRAPKTEAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGNYVAALSEANVAFMIDKSVFRMLPLEKWYRFTAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGQYDLDATRKLLYGRGQMVKTESATFKAASRSEKLDHDELDVSGDEFQDDDETPYFERMEDDDTKESKERIRREQLGANLFGEGDEKEVDKELRERLQEEFERQKYGKSTKKALIKRDREDIYESDKSEENPWSSSSDDQSSEEEEDDKQEDEKKDSDNKEINGDSKERSKISSGKGSSTPQGKFKQGEVPRKTKSLKRPGSPALSESSGNESSRKKFKKTSAAAPGSRSGTPVSQPNTGRRNKTGNGSTSDGEATGGELSDGTAGPKTAVNSSENRGKGTPGASRADSPNFAQSVATTGIQSSAGIESWEILEKIPAEGISLQDLVKQFHGRVGDRPGQMNRSDWIKLVKQLCDYGQDKRLRQRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.7
3	0.72
4	0.76
5	0.79
6	0.82
7	0.86
8	0.86
9	0.89
10	0.89
11	0.89
12	0.85
13	0.81
14	0.8
15	0.77
16	0.72
17	0.7
18	0.65
19	0.64
20	0.68
21	0.69
22	0.63
23	0.59
24	0.63
25	0.64
26	0.62
27	0.59
28	0.58
29	0.6
30	0.59
31	0.65
32	0.58
33	0.5
34	0.48
35	0.44
36	0.43
37	0.41
38	0.42
39	0.36
40	0.44
41	0.5
42	0.53
43	0.55
44	0.53
45	0.51
46	0.5
47	0.5
48	0.41
49	0.42
50	0.46
51	0.43
52	0.43
53	0.4
54	0.42
55	0.41
56	0.4
57	0.35
58	0.33
59	0.35
60	0.34
61	0.36
62	0.39
63	0.41
64	0.44
65	0.42
66	0.37
67	0.36
68	0.36
69	0.33
70	0.29
71	0.28
72	0.26
73	0.25
74	0.29
75	0.29
76	0.25
77	0.24
78	0.21
79	0.2
80	0.22
81	0.24
82	0.22
83	0.27
84	0.28
85	0.31
86	0.38
87	0.37
88	0.36
89	0.35
90	0.33
91	0.32
92	0.35
93	0.38
94	0.38
95	0.38
96	0.42
97	0.43
98	0.45
99	0.41
100	0.37
101	0.38
102	0.32
103	0.31
104	0.27
105	0.25
106	0.26
107	0.23
108	0.24
109	0.19
110	0.2
111	0.22
112	0.29
113	0.26
114	0.31
115	0.4
116	0.43
117	0.49
118	0.54
119	0.57
120	0.55
121	0.63
122	0.61
123	0.61
124	0.62
125	0.57
126	0.6
127	0.58
128	0.56
129	0.51
130	0.48
131	0.44
132	0.42
133	0.39
134	0.31
135	0.3
136	0.31
137	0.27
138	0.26
139	0.24
140	0.2
141	0.19
142	0.18
143	0.15
144	0.19
145	0.19
146	0.18
147	0.18
148	0.18
149	0.18
150	0.22
151	0.22
152	0.2
153	0.22
154	0.29
155	0.29
156	0.3
157	0.32
158	0.3
159	0.31
160	0.31
161	0.31
162	0.25
163	0.25
164	0.24
165	0.24
166	0.24
167	0.22
168	0.18
169	0.18
170	0.18
171	0.19
172	0.25
173	0.25
174	0.33
175	0.42
176	0.49
177	0.58
178	0.66
179	0.74
180	0.76
181	0.86
182	0.86
183	0.87
184	0.88
185	0.89
186	0.86
187	0.85
188	0.8
189	0.77
190	0.71
191	0.61
192	0.56
193	0.49
194	0.47
195	0.45
196	0.46
197	0.44
198	0.42
199	0.42
200	0.47
201	0.47
202	0.44
203	0.39
204	0.35
205	0.32
206	0.31
207	0.31
208	0.24
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.1
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.13
247	0.12
248	0.16
249	0.21
250	0.26
251	0.25
252	0.28
253	0.3
254	0.32
255	0.31
256	0.33
257	0.38
258	0.4
259	0.47
260	0.5
261	0.5
262	0.45
263	0.48
264	0.44
265	0.41
266	0.36
267	0.28
268	0.22
269	0.22
270	0.21
271	0.18
272	0.18
273	0.13
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.1
278	0.11
279	0.14
280	0.16
281	0.2
282	0.21
283	0.22
284	0.22
285	0.25
286	0.28
287	0.27
288	0.29
289	0.24
290	0.24
291	0.24
292	0.24
293	0.2
294	0.17
295	0.19
296	0.18
297	0.19
298	0.19
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.18
303	0.16
304	0.13
305	0.15
306	0.2
307	0.24
308	0.23
309	0.23
310	0.24
311	0.23
312	0.21
313	0.19
314	0.15
315	0.13
316	0.14
317	0.13
318	0.13
319	0.15
320	0.17
321	0.17
322	0.18
323	0.19
324	0.2
325	0.22
326	0.24
327	0.23
328	0.21
329	0.21
330	0.19
331	0.16
332	0.15
333	0.13
334	0.1
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.07
351	0.12
352	0.13
353	0.16
354	0.18
355	0.19
356	0.21
357	0.22
358	0.22
359	0.22
360	0.27
361	0.29
362	0.35
363	0.42
364	0.45
365	0.47
366	0.51
367	0.51
368	0.48
369	0.44
370	0.35
371	0.27
372	0.22
373	0.18
374	0.15
375	0.09
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.11
384	0.13
385	0.17
386	0.18
387	0.19
388	0.2
389	0.26
390	0.27
391	0.29
392	0.35
393	0.32
394	0.36
395	0.34
396	0.35
397	0.34
398	0.4
399	0.42
400	0.39
401	0.44
402	0.45
403	0.55
404	0.58
405	0.63
406	0.65
407	0.67
408	0.66
409	0.67
410	0.63
411	0.56
412	0.54
413	0.46
414	0.43
415	0.38
416	0.35
417	0.29
418	0.28
419	0.27
420	0.26
421	0.27
422	0.2
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.18
427	0.19
428	0.18
429	0.17
430	0.17
431	0.17
432	0.17
433	0.18
434	0.17
435	0.16
436	0.15
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.17
443	0.18
444	0.2
445	0.22
446	0.24
447	0.31
448	0.33
449	0.39
450	0.38
451	0.38
452	0.39
453	0.39
454	0.37
455	0.32
456	0.32
457	0.27
458	0.28
459	0.3
460	0.26
461	0.26
462	0.28
463	0.31
464	0.34
465	0.41
466	0.36
467	0.37
468	0.4
469	0.4
470	0.41
471	0.42
472	0.39
473	0.38
474	0.4
475	0.41
476	0.39
477	0.39
478	0.44
479	0.45
480	0.53
481	0.53
482	0.57
483	0.56
484	0.61
485	0.64
486	0.62
487	0.65
488	0.65
489	0.66
490	0.63
491	0.68
492	0.68
493	0.7
494	0.64
495	0.55
496	0.48
497	0.41
498	0.36
499	0.3
500	0.29
501	0.24
502	0.23
503	0.25
504	0.26
505	0.29
506	0.39
507	0.43
508	0.43
509	0.48
510	0.56
511	0.63
512	0.66
513	0.7
514	0.7
515	0.74
516	0.71
517	0.66
518	0.62
519	0.54
520	0.48
521	0.39
522	0.3
523	0.23
524	0.23
525	0.27
526	0.26
527	0.29
528	0.32
529	0.4
530	0.47
531	0.52
532	0.55
533	0.54
534	0.58
535	0.54
536	0.6
537	0.59
538	0.54
539	0.53
540	0.51
541	0.46
542	0.4
543	0.37
544	0.29
545	0.22
546	0.16
547	0.12
548	0.08
549	0.08
550	0.06
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.08
559	0.1
560	0.11
561	0.13
562	0.15
563	0.17
564	0.21
565	0.25
566	0.32
567	0.32
568	0.34
569	0.32
570	0.31
571	0.31
572	0.32
573	0.32
574	0.29
575	0.33
576	0.31
577	0.34
578	0.37
579	0.38
580	0.36
581	0.33
582	0.34
583	0.3
584	0.28
585	0.25
586	0.2
587	0.2
588	0.2
589	0.19
590	0.13
591	0.12
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.1
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.12
603	0.11
604	0.1
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.14
614	0.14
615	0.14
616	0.16
617	0.18
618	0.18
619	0.21
620	0.23
621	0.21
622	0.23
623	0.29
624	0.27
625	0.31
626	0.38
627	0.41
628	0.42
629	0.48
630	0.5
631	0.49
632	0.49
633	0.46
634	0.41
635	0.38
636	0.36
637	0.33
638	0.34
639	0.34
640	0.39
641	0.42
642	0.43
643	0.42
644	0.45
645	0.43
646	0.45
647	0.43
648	0.43
649	0.46
650	0.5
651	0.52

A0A166VGL9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer