Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JR56

Protein Details
Accession I2JR56    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-223VPTNLRRKLAEQRKSRKHKKRSLLRTASQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-226RRKLAEQRXKSRKHKKRS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MQIITXRQVGXVDIVXLLGCRLEKHGFLQXCSQSEILTSTLFVIIQANLYERIIDDVIQESRQDFEDSGIDEQTLLDLRNIWKEKLSKTNVAKFSWDKKREEEEAKEKALEAQEQALETSTSIGAPSVGMNGXSDTNEYAIKAEEAKTXPQXQNIXXNTTSKPEENGTANLETHNIILPGGGAAGLGQTDGSLPXEIEITIDDVPTNLRRKLAEQRXKSRKHKKRSLLRTASQADGANDEQSDDSADDSDLGSDLGIDSDEINSDLDDPESDDINSDEDNDNPEANIMLCLYDRVQRVRNRWKCSLKDGIANIDGQDYAFQKATGDSEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.12
6 0.13
7 0.14
8 0.18
9 0.26
10 0.29
11 0.29
12 0.35
13 0.32
14 0.34
15 0.33
16 0.29
17 0.21
18 0.2
19 0.21
20 0.14
21 0.14
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.12
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.09
61 0.11
62 0.19
63 0.22
64 0.22
65 0.26
66 0.29
67 0.34
68 0.41
69 0.45
70 0.45
71 0.5
72 0.58
73 0.58
74 0.55
75 0.55
76 0.51
77 0.56
78 0.57
79 0.56
80 0.5
81 0.51
82 0.56
83 0.57
84 0.58
85 0.56
86 0.54
87 0.53
88 0.51
89 0.46
90 0.4
91 0.36
92 0.31
93 0.24
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.11
127 0.13
128 0.17
129 0.19
130 0.21
131 0.23
132 0.25
133 0.26
134 0.27
135 0.3
136 0.27
137 0.27
138 0.27
139 0.26
140 0.24
141 0.22
142 0.21
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.11
183 0.15
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.21
188 0.31
189 0.4
190 0.45
191 0.52
192 0.62
193 0.71
194 0.81
195 0.88
196 0.88
197 0.89
198 0.89
199 0.9
200 0.9
201 0.9
202 0.9
203 0.88
204 0.81
205 0.79
206 0.73
207 0.63
208 0.55
209 0.45
210 0.34
211 0.28
212 0.25
213 0.17
214 0.14
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.1
268 0.15
269 0.18
270 0.22
271 0.3
272 0.36
273 0.46
274 0.56
275 0.64
276 0.66
277 0.73
278 0.77
279 0.75
280 0.76
281 0.77
282 0.69
283 0.68
284 0.63
285 0.59
286 0.51
287 0.47
288 0.39
289 0.3
290 0.26
291 0.18
292 0.18
293 0.13
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.15