Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168CN62

Protein Details
Accession A0A168CN62    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-256VSPPYSPRRKSKPGRRFFLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-251RRKSKPGR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6.5, cyto_mito 5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MEPGTFNHANVSPYKPRRGASAAAAAAAATADSLDSHSERTLLDSPVLGSVESDSVNFPEQRKATVSTTRSHPSPAVARETTGQELLGVSPKERFELIELIYKDLIEFVFGPLPKHLAKTNPDLRKFLRERLATEQVKELLLWLRHTRFHDPEHRNKVLAELKQLDYLDNESARVQTRVQSEMSLAVPAIAIPSEAAKTTTTAVEEDISETTAAEEVTREPLHAAARPRASAAAPTVSPPYSPRRKSKPGRRFFLIKSSSLENICKSREDSLWMTQEKNESSLGKAFESSDQVILFFSLNRSSAFQGYAQMISLPNSKITLPPWIAATNEEMGGTTPPFQVKWLNKGDTEFRYFDDLVNPYNDHKPIFVARDGTGMVTSRWNTKRQKAPCTTTGSLLIKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.49
4 0.54
5 0.55
6 0.52
7 0.48
8 0.5
9 0.41
10 0.37
11 0.36
12 0.29
13 0.24
14 0.19
15 0.13
16 0.04
17 0.03
18 0.03
19 0.03
20 0.05
21 0.07
22 0.08
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.17
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.2
35 0.15
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.1
43 0.14
44 0.17
45 0.17
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.29
50 0.32
51 0.33
52 0.39
53 0.4
54 0.37
55 0.43
56 0.45
57 0.42
58 0.41
59 0.37
60 0.33
61 0.37
62 0.36
63 0.37
64 0.33
65 0.33
66 0.33
67 0.35
68 0.32
69 0.26
70 0.21
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.17
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.14
83 0.18
84 0.19
85 0.23
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.2
91 0.16
92 0.14
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.13
100 0.17
101 0.16
102 0.18
103 0.18
104 0.2
105 0.24
106 0.32
107 0.41
108 0.46
109 0.49
110 0.51
111 0.51
112 0.56
113 0.55
114 0.52
115 0.51
116 0.45
117 0.45
118 0.49
119 0.56
120 0.47
121 0.46
122 0.42
123 0.34
124 0.32
125 0.28
126 0.22
127 0.17
128 0.16
129 0.18
130 0.2
131 0.21
132 0.25
133 0.28
134 0.32
135 0.31
136 0.36
137 0.43
138 0.47
139 0.55
140 0.59
141 0.58
142 0.53
143 0.49
144 0.5
145 0.45
146 0.39
147 0.34
148 0.29
149 0.28
150 0.3
151 0.3
152 0.24
153 0.19
154 0.19
155 0.16
156 0.12
157 0.12
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.14
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.11
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.16
219 0.14
220 0.12
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.21
228 0.28
229 0.34
230 0.41
231 0.48
232 0.58
233 0.68
234 0.77
235 0.79
236 0.79
237 0.81
238 0.78
239 0.75
240 0.68
241 0.67
242 0.59
243 0.5
244 0.43
245 0.39
246 0.37
247 0.32
248 0.31
249 0.24
250 0.24
251 0.23
252 0.22
253 0.21
254 0.22
255 0.2
256 0.24
257 0.25
258 0.27
259 0.33
260 0.32
261 0.32
262 0.31
263 0.34
264 0.29
265 0.27
266 0.24
267 0.18
268 0.18
269 0.21
270 0.21
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.19
276 0.18
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.11
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.17
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.22
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.22
312 0.22
313 0.21
314 0.23
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.22
328 0.25
329 0.33
330 0.39
331 0.4
332 0.4
333 0.44
334 0.49
335 0.47
336 0.48
337 0.41
338 0.34
339 0.37
340 0.36
341 0.34
342 0.33
343 0.29
344 0.26
345 0.28
346 0.28
347 0.25
348 0.3
349 0.31
350 0.26
351 0.24
352 0.26
353 0.28
354 0.31
355 0.31
356 0.28
357 0.27
358 0.29
359 0.29
360 0.26
361 0.22
362 0.18
363 0.16
364 0.19
365 0.2
366 0.27
367 0.31
368 0.39
369 0.46
370 0.54
371 0.63
372 0.66
373 0.75
374 0.75
375 0.79
376 0.78
377 0.79
378 0.72
379 0.65
380 0.65