FuNGI

A0A168AVB4

Protein Details

Accession

A0A168AVB4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
500-525	KEEENFSAKKKKKQRTVKRSSPELDA	Hydrophilic
606-633	STPVSSNTDKKTKKRKEKGSGVKPQSLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
508-518	KKKKKQRTVKR
615-626	KKTKKRKEKGSG

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKGAYKVHSLSKHIEAAKQGLAAEAHHNKHSTVKAVAGRKKKESVFNNHSDEDEESESDSSDESSDEEGAGLLQKITAQANKAKKLIRNEEIADSDDERRKANDSTARTQEKKQFKREETSDDSGGEAETESGSESKSVSGLSEAKVKANGAAPHDATTPSAGKSSASQSNDNASESDGSGDVTDKKTARVQSSDSGSASDDSSSSDSGSESDGESDSDAKQAPTTAKRPVNGVATKRASTDDSSDEEDSDDSKEEGVASKGKGISSSPSHSVDESMHIADRAQEGQVAIPDFIAPDFVLRKSDENTNGQDVARLCNQANMQGKQVWYFTVPANVPISVVQKMEIPMDNSNRGDRVFSHDGDDYGISFDSMMPKSSISILIPSADGARYSSASRQVDQVMHVKKIAKIGGSSMGVSPVRPEAKPAARPQPKGLRARYQPFGVNTSMGQIGSDESNDESGGDDEDEVMQDAPDDSIAPRKGKRKMTSEDEAAAASEQLKEEENFSAKKKKKQRTVKRSSPELDAEHPPPSASKIKKTLIVPPPAPSSQAAAAASSSTVKAKSKAARTETPVPAPRQTSVPVPPVPGSLLPSKVSPVPVPQLPAVSTPVSSNTDKKTKKRKEKGSGVKPQSLPPSAQGSKTATGKVTPVPAPKLNATT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.49
3	0.47
4	0.42
5	0.41
6	0.39
7	0.34
8	0.29
9	0.24
10	0.22
11	0.2
12	0.26
13	0.29
14	0.3
15	0.32
16	0.33
17	0.32
18	0.38
19	0.4
20	0.35
21	0.3
22	0.34
23	0.37
24	0.46
25	0.53
26	0.57
27	0.6
28	0.62
29	0.67
30	0.66
31	0.68
32	0.68
33	0.7
34	0.7
35	0.72
36	0.72
37	0.65
38	0.6
39	0.53
40	0.45
41	0.39
42	0.32
43	0.24
44	0.2
45	0.19
46	0.18
47	0.16
48	0.15
49	0.11
50	0.09
51	0.09
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.09
57	0.08
58	0.08
59	0.1
60	0.09
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.09
65	0.12
66	0.14
67	0.16
68	0.24
69	0.32
70	0.37
71	0.42
72	0.45
73	0.48
74	0.56
75	0.61
76	0.59
77	0.57
78	0.54
79	0.54
80	0.51
81	0.47
82	0.4
83	0.34
84	0.35
85	0.34
86	0.32
87	0.29
88	0.29
89	0.29
90	0.29
91	0.34
92	0.35
93	0.36
94	0.43
95	0.51
96	0.58
97	0.58
98	0.63
99	0.64
100	0.68
101	0.69
102	0.72
103	0.73
104	0.7
105	0.76
106	0.73
107	0.73
108	0.7
109	0.67
110	0.58
111	0.48
112	0.43
113	0.34
114	0.29
115	0.21
116	0.13
117	0.08
118	0.06
119	0.05
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.1
130	0.12
131	0.13
132	0.2
133	0.2
134	0.21
135	0.22
136	0.22
137	0.21
138	0.24
139	0.26
140	0.22
141	0.26
142	0.25
143	0.25
144	0.26
145	0.24
146	0.19
147	0.19
148	0.17
149	0.13
150	0.14
151	0.12
152	0.12
153	0.14
154	0.18
155	0.22
156	0.24
157	0.25
158	0.26
159	0.31
160	0.31
161	0.3
162	0.25
163	0.19
164	0.17
165	0.15
166	0.15
167	0.1
168	0.09
169	0.08
170	0.09
171	0.11
172	0.11
173	0.15
174	0.14
175	0.16
176	0.21
177	0.25
178	0.27
179	0.28
180	0.29
181	0.31
182	0.35
183	0.36
184	0.31
185	0.28
186	0.25
187	0.23
188	0.2
189	0.14
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.11
212	0.14
213	0.18
214	0.21
215	0.28
216	0.31
217	0.31
218	0.33
219	0.35
220	0.38
221	0.38
222	0.37
223	0.37
224	0.37
225	0.37
226	0.36
227	0.34
228	0.28
229	0.25
230	0.24
231	0.19
232	0.18
233	0.21
234	0.21
235	0.19
236	0.18
237	0.17
238	0.15
239	0.13
240	0.11
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.09
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.15
255	0.16
256	0.19
257	0.19
258	0.21
259	0.22
260	0.21
261	0.22
262	0.19
263	0.17
264	0.16
265	0.13
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.04
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.12
292	0.16
293	0.19
294	0.21
295	0.22
296	0.23
297	0.23
298	0.22
299	0.23
300	0.19
301	0.18
302	0.16
303	0.16
304	0.14
305	0.16
306	0.16
307	0.19
308	0.24
309	0.22
310	0.22
311	0.23
312	0.23
313	0.21
314	0.21
315	0.16
316	0.11
317	0.12
318	0.1
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.12
326	0.14
327	0.11
328	0.11
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.13
336	0.16
337	0.18
338	0.18
339	0.18
340	0.17
341	0.17
342	0.15
343	0.13
344	0.18
345	0.19
346	0.19
347	0.21
348	0.2
349	0.2
350	0.2
351	0.2
352	0.12
353	0.09
354	0.08
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.1
365	0.11
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.1
380	0.16
381	0.18
382	0.18
383	0.2
384	0.21
385	0.21
386	0.22
387	0.28
388	0.23
389	0.23
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.26
394	0.25
395	0.19
396	0.16
397	0.17
398	0.18
399	0.17
400	0.16
401	0.13
402	0.15
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.14
409	0.17
410	0.2
411	0.26
412	0.31
413	0.36
414	0.42
415	0.47
416	0.49
417	0.54
418	0.57
419	0.59
420	0.62
421	0.61
422	0.6
423	0.6
424	0.64
425	0.6
426	0.53
427	0.49
428	0.43
429	0.41
430	0.33
431	0.27
432	0.21
433	0.19
434	0.17
435	0.13
436	0.11
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.12
464	0.15
465	0.19
466	0.24
467	0.31
468	0.39
469	0.48
470	0.55
471	0.56
472	0.61
473	0.65
474	0.66
475	0.62
476	0.56
477	0.47
478	0.4
479	0.32
480	0.25
481	0.17
482	0.12
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.09
487	0.09
488	0.11
489	0.13
490	0.16
491	0.18
492	0.22
493	0.31
494	0.36
495	0.45
496	0.54
497	0.61
498	0.68
499	0.77
500	0.84
501	0.85
502	0.9
503	0.91
504	0.9
505	0.89
506	0.82
507	0.76
508	0.69
509	0.61
510	0.55
511	0.5
512	0.43
513	0.36
514	0.33
515	0.28
516	0.23
517	0.24
518	0.28
519	0.27
520	0.32
521	0.38
522	0.41
523	0.47
524	0.48
525	0.53
526	0.53
527	0.58
528	0.52
529	0.48
530	0.51
531	0.46
532	0.45
533	0.36
534	0.31
535	0.24
536	0.26
537	0.22
538	0.16
539	0.16
540	0.14
541	0.14
542	0.12
543	0.11
544	0.1
545	0.12
546	0.14
547	0.16
548	0.23
549	0.31
550	0.38
551	0.46
552	0.51
553	0.55
554	0.6
555	0.67
556	0.66
557	0.66
558	0.65
559	0.6
560	0.58
561	0.54
562	0.48
563	0.42
564	0.39
565	0.36
566	0.35
567	0.38
568	0.34
569	0.35
570	0.34
571	0.32
572	0.32
573	0.27
574	0.26
575	0.23
576	0.24
577	0.22
578	0.22
579	0.23
580	0.23
581	0.25
582	0.23
583	0.24
584	0.27
585	0.28
586	0.31
587	0.3
588	0.3
589	0.28
590	0.28
591	0.27
592	0.22
593	0.2
594	0.18
595	0.21
596	0.23
597	0.25
598	0.28
599	0.32
600	0.41
601	0.48
602	0.57
603	0.65
604	0.71
605	0.79
606	0.85
607	0.89
608	0.9
609	0.93
610	0.95
611	0.94
612	0.94
613	0.91
614	0.89
615	0.8
616	0.75
617	0.72
618	0.64
619	0.54
620	0.48
621	0.49
622	0.43
623	0.42
624	0.4
625	0.38
626	0.4
627	0.42
628	0.41
629	0.33
630	0.32
631	0.33
632	0.32
633	0.34
634	0.33
635	0.36
636	0.4
637	0.42
638	0.45

A0A168AVB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer