Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JX35

Protein Details
Accession I2JX35    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-124DGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAEHydrophilic
389-414DTILYKKHEKDRRREDNYKRRKIEKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-413KHEKDRRREDNYKRRKIE
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPSLFRWLSRKYPKIISPVIEDDPVIVGGIEQPLDYSAXNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPAPESEDEMMLAVFEYTNRVLNMARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAEISNEERERKMEEMEGRGEVIDESIRHKKTWDSNAITPGTPFMDILAESLRFWVAYKLANDPGWSKLQVIISDSSVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLSLATHEPHFRVLREDVYAKDQLQRKLRNMDQFGIDQQTRNQIELIDKKKPFIWLHIGILREYLAVELSIPRLSFKFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRDSSIDTLVSIWKRIMPRLKGYITCDGQLDLAGVEALLEELGRMEDTILYKKHEKDRRREDNYKRRKIEKDQRSLIKNELLKTVSKGKDNAPIMPSQNMTLTNLNTGKMSGGLKMSNNEIVQNINTISKANSANQSVADXLRQNIANANLTQKDDAETKXYSSSEPIDASTTDDSRKRNTDSAFSXDTEESTSGALVDNNDDVIRMWEPGFRKRYYQAKFHTQDEEQLEQICRNMVKGYVEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPFHYAPFALDFKNLTDIDVTFERGXPFKXFEQLMSVLPAASKHNLPDVFGPLMCDEDSEIIDFYPKEFQVDMNGAKMSWQGISLLPFIDEKRLLKAVRSKYGSLTPEEVERNTLKHEILLIGRDNAHFKWFKTLYTDKNENNTNVDGPVLQFHGREAGLSGKVMPCQEFDPKGERKFPLKATAGVNTEQYVDVPNNSYMELSYRMPPKAKGKSMLLNGYISHLLILTEQDKDNVRHSHNRFYRGNHFEVPTNIDYSQYVGPYGKTEYSNRVGGYKXYLDMYKYNSDRYQQTQQFNXYSGGPQNLGFGNQNGFXNYNSQTSGYNSGYNNQYXNRGYNQGNYNYGYNPHGNANEQYNNGYNQGYGRGGYNQRRSYGNSGRGRGRGDYAGNRYRNDYSNXGSSYPNRENGYGDHHNNRYNDRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.69
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.53
9 0.46
10 0.39
11 0.32
12 0.27
13 0.23
14 0.16
15 0.1
16 0.07
17 0.08
18 0.1
19 0.09
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.15
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.19
33 0.16
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.13
47 0.19
48 0.24
49 0.26
50 0.34
51 0.42
52 0.46
53 0.5
54 0.5
55 0.49
56 0.47
57 0.47
58 0.4
59 0.33
60 0.28
61 0.23
62 0.2
63 0.15
64 0.12
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.08
69 0.09
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.2
75 0.31
76 0.37
77 0.4
78 0.4
79 0.42
80 0.44
81 0.45
82 0.42
83 0.33
84 0.3
85 0.27
86 0.25
87 0.24
88 0.21
89 0.2
90 0.18
91 0.15
92 0.1
93 0.13
94 0.19
95 0.26
96 0.37
97 0.45
98 0.55
99 0.66
100 0.74
101 0.8
102 0.84
103 0.82
104 0.79
105 0.8
106 0.78
107 0.75
108 0.72
109 0.64
110 0.57
111 0.59
112 0.54
113 0.47
114 0.44
115 0.38
116 0.34
117 0.33
118 0.33
119 0.26
120 0.26
121 0.28
122 0.28
123 0.3
124 0.32
125 0.31
126 0.28
127 0.26
128 0.24
129 0.18
130 0.14
131 0.11
132 0.1
133 0.15
134 0.22
135 0.24
136 0.24
137 0.26
138 0.32
139 0.38
140 0.47
141 0.51
142 0.5
143 0.53
144 0.6
145 0.61
146 0.54
147 0.45
148 0.37
149 0.29
150 0.22
151 0.17
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.14
166 0.16
167 0.19
168 0.23
169 0.24
170 0.25
171 0.24
172 0.26
173 0.25
174 0.24
175 0.21
176 0.21
177 0.23
178 0.22
179 0.23
180 0.21
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.23
198 0.29
199 0.31
200 0.34
201 0.36
202 0.4
203 0.42
204 0.41
205 0.47
206 0.44
207 0.45
208 0.44
209 0.4
210 0.39
211 0.36
212 0.34
213 0.24
214 0.21
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.25
239 0.26
240 0.22
241 0.25
242 0.27
243 0.24
244 0.28
245 0.32
246 0.35
247 0.42
248 0.46
249 0.47
250 0.53
251 0.58
252 0.6
253 0.58
254 0.54
255 0.48
256 0.43
257 0.4
258 0.37
259 0.32
260 0.25
261 0.22
262 0.28
263 0.26
264 0.25
265 0.24
266 0.19
267 0.25
268 0.32
269 0.36
270 0.36
271 0.36
272 0.36
273 0.38
274 0.44
275 0.38
276 0.36
277 0.38
278 0.33
279 0.37
280 0.39
281 0.38
282 0.31
283 0.3
284 0.24
285 0.17
286 0.13
287 0.09
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.18
301 0.18
302 0.22
303 0.23
304 0.24
305 0.22
306 0.25
307 0.22
308 0.16
309 0.15
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.12
336 0.1
337 0.1
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.14
343 0.15
344 0.2
345 0.27
346 0.27
347 0.32
348 0.38
349 0.41
350 0.4
351 0.43
352 0.45
353 0.39
354 0.36
355 0.31
356 0.25
357 0.22
358 0.19
359 0.15
360 0.07
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.05
376 0.06
377 0.1
378 0.11
379 0.15
380 0.19
381 0.24
382 0.33
383 0.4
384 0.46
385 0.53
386 0.63
387 0.7
388 0.76
389 0.81
390 0.83
391 0.86
392 0.89
393 0.89
394 0.84
395 0.8
396 0.78
397 0.79
398 0.78
399 0.77
400 0.76
401 0.74
402 0.75
403 0.71
404 0.67
405 0.58
406 0.53
407 0.46
408 0.38
409 0.33
410 0.27
411 0.24
412 0.25
413 0.31
414 0.27
415 0.27
416 0.27
417 0.26
418 0.33
419 0.33
420 0.34
421 0.27
422 0.27
423 0.26
424 0.26
425 0.24
426 0.16
427 0.17
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.15
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.11
476 0.09
477 0.11
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.15
502 0.15
503 0.18
504 0.21
505 0.21
506 0.25
507 0.25
508 0.29
509 0.29
510 0.32
511 0.3
512 0.28
513 0.27
514 0.23
515 0.22
516 0.17
517 0.14
518 0.09
519 0.07
520 0.07
521 0.05
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.09
535 0.12
536 0.18
537 0.23
538 0.23
539 0.25
540 0.29
541 0.38
542 0.39
543 0.45
544 0.44
545 0.5
546 0.52
547 0.52
548 0.5
549 0.42
550 0.43
551 0.39
552 0.35
553 0.25
554 0.24
555 0.22
556 0.18
557 0.18
558 0.14
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.06
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.1
582 0.15
583 0.19
584 0.21
585 0.23
586 0.24
587 0.28
588 0.3
589 0.32
590 0.28
591 0.25
592 0.21
593 0.19
594 0.2
595 0.18
596 0.15
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.17
601 0.15
602 0.12
603 0.12
604 0.11
605 0.14
606 0.14
607 0.16
608 0.11
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.17
613 0.14
614 0.16
615 0.18
616 0.17
617 0.18
618 0.18
619 0.18
620 0.16
621 0.16
622 0.13
623 0.09
624 0.11
625 0.1
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.15
630 0.15
631 0.16
632 0.17
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.12
638 0.13
639 0.12
640 0.1
641 0.07
642 0.07
643 0.08
644 0.07
645 0.07
646 0.06
647 0.08
648 0.07
649 0.08
650 0.11
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.13
656 0.17
657 0.17
658 0.15
659 0.15
660 0.14
661 0.14
662 0.14
663 0.11
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.1
673 0.1
674 0.12
675 0.13
676 0.12
677 0.15
678 0.2
679 0.19
680 0.23
681 0.31
682 0.34
683 0.4
684 0.43
685 0.41
686 0.4
687 0.46
688 0.43
689 0.38
690 0.34
691 0.27
692 0.27
693 0.28
694 0.25
695 0.23
696 0.21
697 0.2
698 0.2
699 0.21
700 0.16
701 0.15
702 0.16
703 0.14
704 0.14
705 0.16
706 0.15
707 0.14
708 0.16
709 0.16
710 0.18
711 0.16
712 0.2
713 0.19
714 0.18
715 0.26
716 0.26
717 0.26
718 0.31
719 0.37
720 0.38
721 0.45
722 0.52
723 0.45
724 0.5
725 0.54
726 0.48
727 0.45
728 0.39
729 0.32
730 0.25
731 0.22
732 0.17
733 0.13
734 0.13
735 0.12
736 0.11
737 0.1
738 0.1
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.12
744 0.12
745 0.12
746 0.14
747 0.12
748 0.14
749 0.15
750 0.15
751 0.13
752 0.15
753 0.2
754 0.21
755 0.22
756 0.28
757 0.34
758 0.38
759 0.42
760 0.43
761 0.43
762 0.46
763 0.47
764 0.48
765 0.44
766 0.45
767 0.42
768 0.44
769 0.42
770 0.37
771 0.34
772 0.26
773 0.24
774 0.2
775 0.17
776 0.13
777 0.11
778 0.12
779 0.13
780 0.14
781 0.13
782 0.13
783 0.13
784 0.11
785 0.13
786 0.15
787 0.14
788 0.19
789 0.23
790 0.25
791 0.28
792 0.33
793 0.39
794 0.45
795 0.49
796 0.49
797 0.5
798 0.54
799 0.58
800 0.58
801 0.51
802 0.43
803 0.38
804 0.35
805 0.3
806 0.22
807 0.16
808 0.11
809 0.09
810 0.08
811 0.1
812 0.09
813 0.11
814 0.11
815 0.14
816 0.18
817 0.19
818 0.25
819 0.29
820 0.33
821 0.41
822 0.44
823 0.53
824 0.55
825 0.61
826 0.59
827 0.59
828 0.64
829 0.6
830 0.61
831 0.55
832 0.51
833 0.46
834 0.45
835 0.45
836 0.36
837 0.33
838 0.28
839 0.24
840 0.22
841 0.22
842 0.21
843 0.15
844 0.15
845 0.13
846 0.14
847 0.15
848 0.18
849 0.18
850 0.19
851 0.22
852 0.27
853 0.31
854 0.34
855 0.32
856 0.32
857 0.3
858 0.28
859 0.31
860 0.27
861 0.25
862 0.25
863 0.26
864 0.25
865 0.28
866 0.35
867 0.35
868 0.37
869 0.38
870 0.39
871 0.42
872 0.47
873 0.54
874 0.53
875 0.55
876 0.55
877 0.55
878 0.52
879 0.49
880 0.43
881 0.39
882 0.39
883 0.33
884 0.3
885 0.26
886 0.27
887 0.26
888 0.27
889 0.22
890 0.16
891 0.18
892 0.18
893 0.19
894 0.19
895 0.21
896 0.2
897 0.23
898 0.22
899 0.2
900 0.19
901 0.2
902 0.2
903 0.24
904 0.24
905 0.25
906 0.25
907 0.29
908 0.34
909 0.38
910 0.37
911 0.36
912 0.39
913 0.38
914 0.4
915 0.42
916 0.39
917 0.37
918 0.44
919 0.44
920 0.42
921 0.41
922 0.41
923 0.35
924 0.34
925 0.36
926 0.29
927 0.26
928 0.27
929 0.26
930 0.28
931 0.29
932 0.33
933 0.33
934 0.33
935 0.34
936 0.32
937 0.32
938 0.31
939 0.28
940 0.22
941 0.19
942 0.21
943 0.19
944 0.16
945 0.17
946 0.22
947 0.31
948 0.39
949 0.48
950 0.48
951 0.5
952 0.53
953 0.57
954 0.59
955 0.59
956 0.6
957 0.59
958 0.61
959 0.64
960 0.65
961 0.63
962 0.56
963 0.51
964 0.46
965 0.44
966 0.46
967 0.48
968 0.53
969 0.54
970 0.53
971 0.54
972 0.53
973 0.51
974 0.48
975 0.44
976 0.4
977 0.42
978 0.42
979 0.43
980 0.42
981 0.43
982 0.44
983 0.46
984 0.43
985 0.37
986 0.38
987 0.35
988 0.4
989 0.45
990 0.44
991 0.47
992 0.5
993 0.55
994 0.56