FuNGI

A0A168CP55

Protein Details

Accession

A0A168CP55

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
863-885	TEEKFSHARRRLQRIEAKRKAQA	Hydrophilic
944-963	AGAFGDRKKVKKGKRKSGFR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
872-882	RRLQRIEAKRK
950-963	RKKVKKGKRKSGFR

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Gene Ontology	GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MSQVSCTRPGSRPKIRDHSWEARRTQERWLANSHPLALIGGADTVSELLGENADEASTSQNSGAERPLLAVGEMADLRNPSRVTGMPLLAAATGESGEKLRLTRMDDSVWQWDEHEDVFLHRLAIDTVYQETENIWEGDGLPIIQIKFATSRRAYGTLRWLMVQTQASITILQPQFHQIPLPGAVQPESYQPPSCLEPNPRAKLQRHEAGGNEWSDFCFCPPSSDSPPRIAVIDVHGFWSIWNASDVLRKGKDSLQLTLHRRGHIAGGILRSVPRNSSYPAQRHGILPAGRSQNDGNRRAASMKHEGKTNSGPSAPIFLWNAQGMALLDLETDSILALRSDILARARGHPDRVLDVQTSQTYDHHVYVLTAKQVIWIDLSPSSADPDVARGPSILLTCSHVGVRNEDALMSLCTKSADRAGGDMVFVYSPHRDQTIAHWFSLAQHSQLPQRHRYITTLTNADHKLRGATQLLRVLPVELEVPSAPGKVSSSSPSPGSEYARDKVKFYQVISLAEDLSVHSQLCASWKDPALEVTPPSCVVSWQQAKQASSHQRRRRLFLRHLGDTFVVPDALDDDMMGAVMEGRRVEPTSGTIADDTPAAEPRTITLRLGRLCELIASSLQDAISRGPIGLPSDLSTVVQRTLDGGLSEGSLPLASWMQLFPDTQQRMRCNGPEDGMETDLEALLDRTDDGAVITQLRRRGADEPPDSFLGYPFLARQFSELWLDTAAAGSSLPEDLQRIREIWVHEIARDVFLASYGVMVQDVPLLGGSSADVAGDSQTEPSQDPSSSRPSQQSPRIAALSPASSASGREVPDAAFRRLRLLAPTIEPGALGLLEQAPVLSYWPAEGGVDTDDYVSSIAVATEEKFSHARRRLQRIEAKRKAQAERYRLPSAAGEHGADEGAGSSSRRRPAPVQIMSSQQAFPNSSQSQGVFGPTVTMSQPVAGAFGDRKKVKKGKRKSGFR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.77
3	0.79
4	0.79
5	0.79
6	0.78
7	0.78
8	0.72
9	0.72
10	0.73
11	0.65
12	0.65
13	0.63
14	0.59
15	0.54
16	0.57
17	0.52
18	0.52
19	0.53
20	0.46
21	0.38
22	0.33
23	0.29
24	0.22
25	0.18
26	0.11
27	0.09
28	0.07
29	0.06
30	0.06
31	0.05
32	0.05
33	0.05
34	0.05
35	0.04
36	0.05
37	0.05
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.09
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.13
48	0.14
49	0.16
50	0.18
51	0.16
52	0.15
53	0.16
54	0.17
55	0.15
56	0.14
57	0.13
58	0.1
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.13
65	0.18
66	0.17
67	0.15
68	0.18
69	0.19
70	0.24
71	0.28
72	0.28
73	0.23
74	0.23
75	0.23
76	0.19
77	0.18
78	0.11
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.07
84	0.08
85	0.09
86	0.1
87	0.13
88	0.16
89	0.2
90	0.25
91	0.27
92	0.29
93	0.31
94	0.34
95	0.38
96	0.36
97	0.32
98	0.28
99	0.26
100	0.24
101	0.21
102	0.2
103	0.13
104	0.12
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.12
112	0.11
113	0.1
114	0.11
115	0.13
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.12
122	0.11
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.11
127	0.09
128	0.07
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.15
135	0.17
136	0.25
137	0.23
138	0.27
139	0.3
140	0.37
141	0.37
142	0.36
143	0.43
144	0.4
145	0.4
146	0.37
147	0.34
148	0.29
149	0.32
150	0.29
151	0.21
152	0.16
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.15
157	0.19
158	0.19
159	0.19
160	0.19
161	0.23
162	0.23
163	0.23
164	0.24
165	0.16
166	0.17
167	0.19
168	0.2
169	0.16
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.18
175	0.2
176	0.21
177	0.21
178	0.21
179	0.23
180	0.25
181	0.27
182	0.28
183	0.3
184	0.36
185	0.45
186	0.49
187	0.52
188	0.56
189	0.58
190	0.61
191	0.63
192	0.6
193	0.54
194	0.52
195	0.48
196	0.45
197	0.44
198	0.36
199	0.29
200	0.22
201	0.19
202	0.18
203	0.17
204	0.13
205	0.14
206	0.13
207	0.16
208	0.19
209	0.25
210	0.32
211	0.4
212	0.42
213	0.41
214	0.43
215	0.4
216	0.38
217	0.32
218	0.25
219	0.21
220	0.22
221	0.18
222	0.17
223	0.17
224	0.16
225	0.15
226	0.17
227	0.12
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.1
232	0.15
233	0.17
234	0.2
235	0.21
236	0.21
237	0.23
238	0.26
239	0.32
240	0.3
241	0.32
242	0.33
243	0.4
244	0.44
245	0.51
246	0.51
247	0.45
248	0.43
249	0.4
250	0.35
251	0.28
252	0.26
253	0.19
254	0.17
255	0.17
256	0.17
257	0.17
258	0.17
259	0.16
260	0.15
261	0.14
262	0.15
263	0.18
264	0.24
265	0.31
266	0.34
267	0.38
268	0.39
269	0.38
270	0.36
271	0.35
272	0.35
273	0.28
274	0.24
275	0.27
276	0.29
277	0.28
278	0.29
279	0.29
280	0.29
281	0.36
282	0.38
283	0.35
284	0.31
285	0.32
286	0.32
287	0.32
288	0.31
289	0.33
290	0.36
291	0.35
292	0.38
293	0.38
294	0.4
295	0.43
296	0.41
297	0.33
298	0.26
299	0.25
300	0.21
301	0.24
302	0.2
303	0.17
304	0.16
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.14
309	0.1
310	0.11
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.05
328	0.06
329	0.07
330	0.12
331	0.13
332	0.17
333	0.23
334	0.24
335	0.26
336	0.26
337	0.26
338	0.25
339	0.26
340	0.24
341	0.19
342	0.19
343	0.19
344	0.17
345	0.17
346	0.14
347	0.13
348	0.14
349	0.15
350	0.15
351	0.13
352	0.12
353	0.12
354	0.14
355	0.15
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.08
382	0.07
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.15
390	0.16
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.12
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.14
422	0.24
423	0.24
424	0.24
425	0.23
426	0.23
427	0.24
428	0.28
429	0.22
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.19
434	0.23
435	0.26
436	0.26
437	0.29
438	0.31
439	0.31
440	0.31
441	0.3
442	0.29
443	0.29
444	0.27
445	0.24
446	0.27
447	0.27
448	0.26
449	0.23
450	0.19
451	0.17
452	0.15
453	0.16
454	0.13
455	0.14
456	0.15
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.17
461	0.15
462	0.13
463	0.12
464	0.1
465	0.05
466	0.06
467	0.05
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.15
482	0.15
483	0.16
484	0.18
485	0.2
486	0.21
487	0.27
488	0.27
489	0.27
490	0.28
491	0.31
492	0.29
493	0.26
494	0.3
495	0.24
496	0.25
497	0.25
498	0.23
499	0.17
500	0.15
501	0.14
502	0.09
503	0.08
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.12
513	0.13
514	0.14
515	0.14
516	0.15
517	0.15
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.1
525	0.08
526	0.08
527	0.16
528	0.19
529	0.2
530	0.25
531	0.27
532	0.28
533	0.29
534	0.36
535	0.38
536	0.44
537	0.52
538	0.55
539	0.62
540	0.63
541	0.68
542	0.68
543	0.66
544	0.64
545	0.63
546	0.62
547	0.57
548	0.55
549	0.51
550	0.43
551	0.35
552	0.28
553	0.18
554	0.12
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.02
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.09
576	0.11
577	0.11
578	0.12
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.09
584	0.07
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.09
589	0.1
590	0.14
591	0.14
592	0.14
593	0.14
594	0.19
595	0.2
596	0.23
597	0.23
598	0.19
599	0.18
600	0.18
601	0.15
602	0.11
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.07
614	0.07
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.08
628	0.08
629	0.09
630	0.09
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.07
647	0.08
648	0.09
649	0.17
650	0.2
651	0.23
652	0.29
653	0.31
654	0.34
655	0.37
656	0.39
657	0.34
658	0.33
659	0.31
660	0.26
661	0.26
662	0.24
663	0.21
664	0.18
665	0.14
666	0.12
667	0.1
668	0.09
669	0.07
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.06
680	0.08
681	0.1
682	0.12
683	0.15
684	0.16
685	0.17
686	0.19
687	0.22
688	0.25
689	0.34
690	0.35
691	0.35
692	0.37
693	0.37
694	0.35
695	0.32
696	0.26
697	0.19
698	0.15
699	0.12
700	0.11
701	0.12
702	0.13
703	0.12
704	0.14
705	0.13
706	0.15
707	0.17
708	0.16
709	0.15
710	0.14
711	0.15
712	0.12
713	0.11
714	0.09
715	0.06
716	0.05
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.05
722	0.07
723	0.08
724	0.11
725	0.12
726	0.13
727	0.14
728	0.18
729	0.2
730	0.21
731	0.27
732	0.25
733	0.23
734	0.26
735	0.25
736	0.22
737	0.2
738	0.17
739	0.1
740	0.1
741	0.1
742	0.06
743	0.06
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.04
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.05
758	0.05
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.05
764	0.06
765	0.06
766	0.07
767	0.09
768	0.09
769	0.13
770	0.15
771	0.15
772	0.17
773	0.19
774	0.27
775	0.29
776	0.32
777	0.35
778	0.39
779	0.47
780	0.53
781	0.57
782	0.53
783	0.55
784	0.53
785	0.48
786	0.43
787	0.37
788	0.3
789	0.23
790	0.19
791	0.16
792	0.14
793	0.14
794	0.15
795	0.16
796	0.16
797	0.16
798	0.17
799	0.16
800	0.24
801	0.28
802	0.29
803	0.29
804	0.28
805	0.31
806	0.33
807	0.33
808	0.28
809	0.28
810	0.27
811	0.26
812	0.29
813	0.26
814	0.24
815	0.22
816	0.19
817	0.15
818	0.12
819	0.08
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.05
826	0.06
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.06
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.08
837	0.09
838	0.09
839	0.09
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.06
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.06
849	0.07
850	0.1
851	0.11
852	0.13
853	0.17
854	0.2
855	0.3
856	0.37
857	0.45
858	0.51
859	0.62
860	0.66
861	0.73
862	0.8
863	0.81
864	0.85
865	0.85
866	0.82
867	0.79
868	0.79
869	0.76
870	0.76
871	0.74
872	0.72
873	0.71
874	0.71
875	0.69
876	0.62
877	0.56
878	0.5
879	0.44
880	0.41
881	0.34
882	0.27
883	0.23
884	0.23
885	0.21
886	0.17
887	0.13
888	0.08
889	0.07
890	0.08
891	0.08
892	0.13
893	0.19
894	0.25
895	0.27
896	0.31
897	0.34
898	0.44
899	0.53
900	0.55
901	0.56
902	0.53
903	0.57
904	0.55
905	0.54
906	0.45
907	0.37
908	0.33
909	0.29
910	0.27
911	0.3
912	0.28
913	0.28
914	0.29
915	0.27
916	0.26
917	0.25
918	0.26
919	0.18
920	0.17
921	0.17
922	0.15
923	0.16
924	0.14
925	0.15
926	0.13
927	0.12
928	0.13
929	0.11
930	0.12
931	0.1
932	0.12
933	0.15
934	0.2
935	0.28
936	0.32
937	0.36
938	0.45
939	0.55
940	0.63
941	0.69
942	0.75
943	0.77

A0A168CP55

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer