Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166V712

Protein Details
Accession A0A166V712    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-35SPDPVAPNSEKKHKKNKSATSEKKRAREEDHydrophilic
39-59DGERKHKKSKSVTDPASRPNEBasic
61-87TINQELVKEEKKKKKKKDKDVLAEAVPHydrophilic
92-116VPESNGEIKHKKKRKKDDALEDASEBasic
122-147QAEFNSVKKEKRKKKRHSEAKSAVAEHydrophilic
417-437MQMRRNKKGGRGIERRRAPDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-48KKHKKNKSATSEKKRAREEDAVGDGERKHKKSK
69-79EEKKKKKKKDK
100-107KHKKKRKK
129-140KKEKRKKKRHSE
420-433RRNKKGGRGIERRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPAAASPDPVAPNSEKKHKKNKSATSEKKRAREEDAVGDGERKHKKSKSVTDPASRPNEITINQELVKEEKKKKKKKDKDVLAEAVPEGNAVPESNGEIKHKKKRKKDDALEDASEARPNGQAEFNSVKKEKRKKKRHSEAKSAVAEEGANGHAQDTLDEPDGDAMEVDESSGSHVKAIRPPYQPPDIPTDPQFPFFRQTVSLYEPIYPNGWAQPVTSALHQHLQHLHNKYVPSLRGVLLDCKNIALGPAPGRDGAAADDETPTTLTSKNDYAVGFGWITADVELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPAWKWVSNESTEANGFEDTASVITADDHGVVRQIHSTGFWVDGDGERVKGKIRFRIRNFDAGTSGEATYLSLEGTMLDKESEKKLVKEEAAAMQMRRNKKGGRGIERRRAPDFSMTRFEPEKADGQDDAAEPAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.6
4 0.7
5 0.76
6 0.83
7 0.85
8 0.89
9 0.89
10 0.91
11 0.93
12 0.92
13 0.93
14 0.91
15 0.89
16 0.86
17 0.79
18 0.76
19 0.72
20 0.66
21 0.63
22 0.59
23 0.52
24 0.45
25 0.44
26 0.38
27 0.38
28 0.41
29 0.37
30 0.41
31 0.44
32 0.52
33 0.6
34 0.69
35 0.71
36 0.74
37 0.78
38 0.8
39 0.81
40 0.8
41 0.77
42 0.67
43 0.57
44 0.5
45 0.46
46 0.38
47 0.37
48 0.32
49 0.29
50 0.29
51 0.29
52 0.27
53 0.27
54 0.33
55 0.37
56 0.43
57 0.49
58 0.59
59 0.69
60 0.79
61 0.86
62 0.9
63 0.92
64 0.94
65 0.94
66 0.94
67 0.93
68 0.87
69 0.77
70 0.68
71 0.56
72 0.46
73 0.34
74 0.24
75 0.14
76 0.09
77 0.08
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.08
82 0.11
83 0.13
84 0.17
85 0.24
86 0.32
87 0.43
88 0.52
89 0.58
90 0.66
91 0.76
92 0.82
93 0.87
94 0.89
95 0.89
96 0.9
97 0.87
98 0.78
99 0.68
100 0.59
101 0.48
102 0.39
103 0.28
104 0.19
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.18
111 0.24
112 0.24
113 0.28
114 0.3
115 0.34
116 0.41
117 0.51
118 0.56
119 0.63
120 0.72
121 0.77
122 0.86
123 0.92
124 0.94
125 0.92
126 0.93
127 0.9
128 0.88
129 0.8
130 0.69
131 0.58
132 0.47
133 0.38
134 0.26
135 0.19
136 0.11
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.12
164 0.17
165 0.22
166 0.28
167 0.3
168 0.33
169 0.37
170 0.41
171 0.4
172 0.37
173 0.41
174 0.36
175 0.35
176 0.34
177 0.35
178 0.3
179 0.33
180 0.32
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.22
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.2
211 0.21
212 0.27
213 0.29
214 0.29
215 0.27
216 0.27
217 0.27
218 0.25
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.21
226 0.19
227 0.19
228 0.17
229 0.15
230 0.15
231 0.12
232 0.12
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.19
306 0.24
307 0.24
308 0.26
309 0.26
310 0.23
311 0.24
312 0.31
313 0.33
314 0.33
315 0.36
316 0.4
317 0.42
318 0.42
319 0.41
320 0.33
321 0.3
322 0.26
323 0.23
324 0.18
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.18
360 0.21
361 0.25
362 0.31
363 0.4
364 0.49
365 0.55
366 0.65
367 0.65
368 0.7
369 0.67
370 0.61
371 0.53
372 0.44
373 0.4
374 0.31
375 0.27
376 0.18
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.1
381 0.08
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.1
390 0.13
391 0.16
392 0.24
393 0.25
394 0.27
395 0.31
396 0.37
397 0.37
398 0.37
399 0.38
400 0.35
401 0.37
402 0.38
403 0.34
404 0.33
405 0.39
406 0.41
407 0.42
408 0.43
409 0.42
410 0.47
411 0.56
412 0.61
413 0.65
414 0.7
415 0.76
416 0.8
417 0.84
418 0.82
419 0.77
420 0.71
421 0.63
422 0.63
423 0.59
424 0.54
425 0.54
426 0.5
427 0.51
428 0.49
429 0.47
430 0.4
431 0.37
432 0.38
433 0.34
434 0.35
435 0.3
436 0.29
437 0.31
438 0.29