Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168EEA3

Protein Details
Accession A0A168EEA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-469EREWEEARLRRRQKRKDGVTEGASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-460RRRQKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto_mito 7.666, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQSQAPPRAFSPPQHSPSPASQQPGFALPPTKRVRTDGPVSQPGSPYPGSPFAMSPSAAGSPPHNSPTFSPPTPGASGFHTPYANGNHTTALNLPDARTGNNTPPLIVPQPPPLTMPQYTNSTMVPMPPAAASPAQTPNVMGPPQRPADRPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSELYSNAMDSNSEARTGFAQLPPGGKASFYGAGVANKPAEVISEQDQKKFALQAAEQAWAESSMRLAVSRTQEIKDPFLLVAILHRRAEKIAKDNHIGLNLEMKNNSQTMGKLRLPEQFPTPQVTVKMETGPDSTMVHTTGSYIPHDAFLVDQLALMSIATKQRLRELVEDANIVAAQRQKTSHGEIPDEWSAAAAPSNMELLGDGPRNEQAMDLDDGAVVVPSETAPLKRSASEATLEMSSRPVKKVAKISSLVTTTMRELARQEREWEEARLRRRQKRKDGVTEGASTTSRAGSVAPGTPGSVAPEVEKPMTKKEIRKQQSMKVAEANSHANQNLTSSMFAGLGGKGGLFGKKKTGKTYDWLNPNRGGSGASTPTGAKASPGLPGVKGPNGVPGTPSPGNPAMTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWVVVLERDGREGKALQHAYVHLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.54
4 0.54
5 0.55
6 0.52
7 0.56
8 0.59
9 0.54
10 0.5
11 0.46
12 0.44
13 0.43
14 0.42
15 0.35
16 0.29
17 0.32
18 0.27
19 0.36
20 0.4
21 0.44
22 0.42
23 0.46
24 0.5
25 0.51
26 0.57
27 0.56
28 0.57
29 0.6
30 0.6
31 0.58
32 0.52
33 0.45
34 0.43
35 0.35
36 0.28
37 0.24
38 0.27
39 0.26
40 0.26
41 0.26
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.21
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.18
52 0.21
53 0.26
54 0.24
55 0.24
56 0.27
57 0.34
58 0.39
59 0.36
60 0.36
61 0.33
62 0.36
63 0.37
64 0.35
65 0.28
66 0.26
67 0.3
68 0.28
69 0.3
70 0.25
71 0.23
72 0.27
73 0.31
74 0.29
75 0.27
76 0.26
77 0.24
78 0.24
79 0.25
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.24
89 0.24
90 0.27
91 0.34
92 0.33
93 0.29
94 0.3
95 0.33
96 0.3
97 0.31
98 0.27
99 0.28
100 0.31
101 0.3
102 0.31
103 0.3
104 0.32
105 0.31
106 0.31
107 0.27
108 0.29
109 0.3
110 0.3
111 0.27
112 0.25
113 0.23
114 0.2
115 0.19
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.18
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.22
130 0.22
131 0.2
132 0.18
133 0.23
134 0.27
135 0.3
136 0.3
137 0.3
138 0.39
139 0.43
140 0.44
141 0.45
142 0.48
143 0.46
144 0.46
145 0.44
146 0.39
147 0.36
148 0.33
149 0.26
150 0.2
151 0.18
152 0.16
153 0.14
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.16
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.09
209 0.12
210 0.21
211 0.22
212 0.24
213 0.25
214 0.24
215 0.25
216 0.24
217 0.21
218 0.16
219 0.15
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.21
224 0.19
225 0.18
226 0.14
227 0.15
228 0.09
229 0.07
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.1
235 0.13
236 0.17
237 0.19
238 0.19
239 0.24
240 0.25
241 0.27
242 0.23
243 0.21
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.09
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.21
256 0.2
257 0.23
258 0.27
259 0.3
260 0.32
261 0.34
262 0.34
263 0.32
264 0.29
265 0.22
266 0.23
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.09
275 0.09
276 0.12
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.22
281 0.27
282 0.28
283 0.28
284 0.28
285 0.25
286 0.25
287 0.27
288 0.26
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.13
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.22
335 0.23
336 0.22
337 0.22
338 0.19
339 0.16
340 0.14
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.13
348 0.16
349 0.21
350 0.23
351 0.22
352 0.24
353 0.23
354 0.28
355 0.26
356 0.24
357 0.18
358 0.14
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.1
396 0.11
397 0.12
398 0.14
399 0.14
400 0.15
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.17
410 0.17
411 0.21
412 0.22
413 0.27
414 0.36
415 0.38
416 0.4
417 0.4
418 0.41
419 0.4
420 0.39
421 0.35
422 0.28
423 0.24
424 0.18
425 0.21
426 0.19
427 0.16
428 0.17
429 0.23
430 0.28
431 0.28
432 0.31
433 0.28
434 0.32
435 0.34
436 0.35
437 0.35
438 0.35
439 0.4
440 0.46
441 0.53
442 0.59
443 0.67
444 0.74
445 0.77
446 0.82
447 0.86
448 0.87
449 0.85
450 0.81
451 0.75
452 0.68
453 0.57
454 0.49
455 0.39
456 0.29
457 0.22
458 0.16
459 0.12
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.1
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.14
475 0.16
476 0.17
477 0.2
478 0.19
479 0.23
480 0.31
481 0.35
482 0.41
483 0.48
484 0.57
485 0.6
486 0.69
487 0.69
488 0.7
489 0.74
490 0.69
491 0.63
492 0.58
493 0.53
494 0.45
495 0.42
496 0.39
497 0.3
498 0.3
499 0.27
500 0.21
501 0.2
502 0.19
503 0.18
504 0.14
505 0.13
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.12
518 0.13
519 0.14
520 0.24
521 0.31
522 0.35
523 0.41
524 0.47
525 0.46
526 0.49
527 0.58
528 0.57
529 0.6
530 0.62
531 0.59
532 0.57
533 0.55
534 0.5
535 0.41
536 0.33
537 0.25
538 0.24
539 0.22
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.19
544 0.19
545 0.17
546 0.12
547 0.12
548 0.13
549 0.15
550 0.17
551 0.18
552 0.17
553 0.21
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.21
558 0.27
559 0.27
560 0.27
561 0.26
562 0.24
563 0.29
564 0.29
565 0.29
566 0.27
567 0.29
568 0.3
569 0.28
570 0.29
571 0.27
572 0.28
573 0.31
574 0.32
575 0.36
576 0.37
577 0.38
578 0.36
579 0.38
580 0.41
581 0.45
582 0.47
583 0.47
584 0.51
585 0.58
586 0.63
587 0.65
588 0.69
589 0.68
590 0.7
591 0.68
592 0.66
593 0.67
594 0.68
595 0.63
596 0.55
597 0.5
598 0.4
599 0.37
600 0.34
601 0.27
602 0.27
603 0.23
604 0.25
605 0.26
606 0.25
607 0.26
608 0.27
609 0.28
610 0.3
611 0.32
612 0.28
613 0.3
614 0.31
615 0.32
616 0.32
617 0.3
618 0.2