Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168DDX7

Protein Details
Accession A0A168DDX7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-205KQDLRDPKRVKHPTKKHLKLVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-198KRVKHPTK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSSSAVRSGERMVHQDFIARIRYSNALPPPPNPPKLLDIPNTGLSSGQYTNPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLVGMPGVFDGDERSIQAPDQTPAVHPHDRPLLRPIAALGKPKVAEANVSFLRRTEYISSITPKRFEGGNPRALLAKARKPARLPLDAAADSPEVIKRKIDRSFDIAKQDLRDPKRVKHPTKKHLKLVEAIPLLPDLDAFPDSGAYVTVKFSNNPVASSTQYDTRLLSGLFRPIDRTQAEEAAYEAALEAHEHDPHNNPKPQNLMNYDFYLGQSTSVAANFRRKFDLDDPAHRDDSLYTHQGDGGGYFQFNRVRAYETEKETELDHPTKYDEEIILAYNDDDTYPKQKAMYYYPIMQKTTIRPQRTKNIARTIGLPPTDEEEQIVDQLDVTVDDPTEEMRDAMTKYAKNPLGWEQEEVEEEVEEVEEVVEEVEEAEEEEEDEDVLAAGAGDDDEELPTTELDQDQDEDADGDDVEPPLGAADRLDELSDERDAEGEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.32
4 0.3
5 0.33
6 0.28
7 0.26
8 0.27
9 0.3
10 0.27
11 0.33
12 0.36
13 0.38
14 0.4
15 0.42
16 0.5
17 0.55
18 0.57
19 0.52
20 0.48
21 0.46
22 0.51
23 0.55
24 0.5
25 0.47
26 0.47
27 0.5
28 0.47
29 0.4
30 0.33
31 0.27
32 0.26
33 0.21
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.19
41 0.21
42 0.26
43 0.23
44 0.3
45 0.31
46 0.34
47 0.34
48 0.35
49 0.35
50 0.32
51 0.31
52 0.24
53 0.22
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.11
58 0.08
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.22
87 0.28
88 0.29
89 0.27
90 0.31
91 0.39
92 0.39
93 0.39
94 0.39
95 0.38
96 0.33
97 0.33
98 0.3
99 0.29
100 0.31
101 0.35
102 0.3
103 0.3
104 0.29
105 0.3
106 0.3
107 0.22
108 0.22
109 0.18
110 0.24
111 0.24
112 0.25
113 0.24
114 0.23
115 0.26
116 0.22
117 0.25
118 0.2
119 0.19
120 0.2
121 0.24
122 0.29
123 0.32
124 0.34
125 0.33
126 0.3
127 0.29
128 0.28
129 0.27
130 0.32
131 0.33
132 0.37
133 0.36
134 0.36
135 0.36
136 0.35
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.34
141 0.38
142 0.4
143 0.41
144 0.48
145 0.48
146 0.47
147 0.42
148 0.38
149 0.39
150 0.36
151 0.34
152 0.29
153 0.22
154 0.18
155 0.16
156 0.16
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.23
162 0.29
163 0.32
164 0.32
165 0.37
166 0.43
167 0.44
168 0.46
169 0.42
170 0.37
171 0.35
172 0.38
173 0.4
174 0.37
175 0.42
176 0.4
177 0.44
178 0.53
179 0.61
180 0.65
181 0.68
182 0.75
183 0.76
184 0.84
185 0.85
186 0.83
187 0.79
188 0.72
189 0.66
190 0.58
191 0.55
192 0.44
193 0.37
194 0.29
195 0.23
196 0.2
197 0.15
198 0.13
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.18
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.12
230 0.13
231 0.1
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.16
236 0.15
237 0.2
238 0.18
239 0.21
240 0.18
241 0.19
242 0.2
243 0.16
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.08
248 0.06
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.14
258 0.19
259 0.26
260 0.29
261 0.28
262 0.29
263 0.34
264 0.35
265 0.36
266 0.35
267 0.33
268 0.3
269 0.31
270 0.3
271 0.26
272 0.24
273 0.2
274 0.15
275 0.11
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.18
283 0.19
284 0.21
285 0.23
286 0.23
287 0.27
288 0.29
289 0.37
290 0.32
291 0.39
292 0.43
293 0.44
294 0.44
295 0.4
296 0.36
297 0.27
298 0.26
299 0.22
300 0.19
301 0.16
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.12
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.12
314 0.14
315 0.13
316 0.16
317 0.18
318 0.25
319 0.28
320 0.3
321 0.31
322 0.3
323 0.3
324 0.28
325 0.3
326 0.27
327 0.24
328 0.2
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.19
333 0.17
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.2
352 0.25
353 0.31
354 0.3
355 0.35
356 0.41
357 0.44
358 0.43
359 0.41
360 0.39
361 0.37
362 0.44
363 0.46
364 0.46
365 0.48
366 0.53
367 0.62
368 0.69
369 0.71
370 0.68
371 0.7
372 0.67
373 0.63
374 0.61
375 0.54
376 0.5
377 0.42
378 0.35
379 0.26
380 0.26
381 0.26
382 0.22
383 0.19
384 0.15
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.1
404 0.1
405 0.14
406 0.19
407 0.19
408 0.21
409 0.3
410 0.33
411 0.31
412 0.34
413 0.37
414 0.41
415 0.4
416 0.41
417 0.34
418 0.32
419 0.33
420 0.3
421 0.23
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.09
426 0.07
427 0.06
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.06
484 0.08
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.15
491 0.16
492 0.15
493 0.13
494 0.13
495 0.14