Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JQH6

Protein Details
Accession I2JQH6    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
474-510ARKHELLTHERKRQRREKALKKKSQKNKNFSWSDKNSHydrophilic
512-535KETRIERHDKLKRRREAIERKIQEBasic
553-578DWKLDILEAKRKRKARKNAIVQGSFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-535KKETARKHELLTHERKRQRREKALKKKSQKNKNFSWSDKNSGKETRIERHDKLKRRREAI
568-575KRKRKARK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17960  DEADc_DDX55  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MTPVQASTIPLLSXNKDVVVQAVTGSGKTLXYVIPVLEKICSALXEGSFKNAHFGALVMVPTRELANQVVQVFESFLEYQPDDLPDIXAQLLVGSIQSVQEDLQYFXENNSFILVGTPGRVNDFLSSPQVKTNSCEIIILDEADRLLDISFLHATESVLKMLPKQRRTGLFSATLSDAGXDIFKTGMTNPVKITVKSNSLHLKNSTVPAKLSLYSMVLNPRLKLKVLLKLLTEYSYRKIIVYFPTCVSVSYFYGMFHNFIKRKGLKFKDISIFSLHGRLDAKPRMKTLNKFENSSSDKSILFTTDVSARGLDIPEVDIVVQIDPPTDPSMFLHRCGRCGRANKPGIAITMLSIGREEEYIDFLKIKGITLKSMEPVIISKEENCWYDETLKVWLCEDRSRYDQAIRSYVGYVRYYSKHLASSIFRVRTLDYKGVARMYGLTRLPKMPENKYVKDFPEDGYLDHTIDFNTYAYADKKKETARKHELLTHERKRQRREKALKKKSQKNKNFSWSDKNSGKETRIERHDKLKRRREAIERKIQEEQVHGSSSSGEEETDQNDWKLDILEAKRKRKARKNAIVQGSFDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.14
9 0.15
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.18
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.11
29 0.15
30 0.16
31 0.21
32 0.25
33 0.25
34 0.27
35 0.26
36 0.25
37 0.2
38 0.19
39 0.16
40 0.12
41 0.13
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.14
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.16
57 0.14
58 0.14
59 0.11
60 0.12
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.09
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.2
108 0.22
109 0.21
110 0.25
111 0.27
112 0.26
113 0.28
114 0.31
115 0.27
116 0.25
117 0.25
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.18
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.16
143 0.23
144 0.3
145 0.32
146 0.35
147 0.41
148 0.45
149 0.52
150 0.51
151 0.48
152 0.45
153 0.41
154 0.39
155 0.34
156 0.28
157 0.21
158 0.18
159 0.14
160 0.09
161 0.09
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.23
172 0.25
173 0.25
174 0.29
175 0.24
176 0.29
177 0.28
178 0.33
179 0.34
180 0.34
181 0.37
182 0.35
183 0.34
184 0.31
185 0.35
186 0.33
187 0.27
188 0.25
189 0.24
190 0.24
191 0.21
192 0.2
193 0.16
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.25
205 0.24
206 0.27
207 0.29
208 0.31
209 0.28
210 0.28
211 0.29
212 0.26
213 0.24
214 0.18
215 0.17
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.21
222 0.23
223 0.23
224 0.21
225 0.23
226 0.23
227 0.22
228 0.21
229 0.16
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.26
242 0.28
243 0.32
244 0.41
245 0.43
246 0.45
247 0.46
248 0.5
249 0.5
250 0.48
251 0.45
252 0.37
253 0.35
254 0.27
255 0.28
256 0.22
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.19
261 0.24
262 0.27
263 0.25
264 0.27
265 0.33
266 0.36
267 0.41
268 0.44
269 0.48
270 0.46
271 0.46
272 0.45
273 0.45
274 0.45
275 0.42
276 0.35
277 0.27
278 0.25
279 0.23
280 0.23
281 0.16
282 0.12
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.16
311 0.17
312 0.19
313 0.26
314 0.24
315 0.28
316 0.3
317 0.33
318 0.31
319 0.37
320 0.39
321 0.42
322 0.45
323 0.42
324 0.43
325 0.4
326 0.34
327 0.29
328 0.24
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.05
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.16
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.17
366 0.16
367 0.18
368 0.19
369 0.16
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.22
377 0.23
378 0.22
379 0.25
380 0.28
381 0.29
382 0.32
383 0.34
384 0.33
385 0.34
386 0.3
387 0.28
388 0.26
389 0.27
390 0.25
391 0.21
392 0.2
393 0.2
394 0.21
395 0.23
396 0.24
397 0.24
398 0.22
399 0.23
400 0.25
401 0.23
402 0.29
403 0.34
404 0.33
405 0.31
406 0.3
407 0.31
408 0.32
409 0.34
410 0.3
411 0.24
412 0.25
413 0.27
414 0.27
415 0.25
416 0.21
417 0.19
418 0.17
419 0.2
420 0.2
421 0.21
422 0.23
423 0.25
424 0.27
425 0.3
426 0.35
427 0.34
428 0.42
429 0.47
430 0.49
431 0.52
432 0.54
433 0.51
434 0.5
435 0.46
436 0.38
437 0.38
438 0.34
439 0.29
440 0.29
441 0.27
442 0.23
443 0.22
444 0.2
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.1
452 0.13
453 0.18
454 0.19
455 0.2
456 0.26
457 0.33
458 0.41
459 0.46
460 0.54
461 0.58
462 0.62
463 0.64
464 0.64
465 0.64
466 0.66
467 0.69
468 0.68
469 0.68
470 0.7
471 0.74
472 0.78
473 0.8
474 0.81
475 0.82
476 0.83
477 0.85
478 0.89
479 0.92
480 0.93
481 0.94
482 0.94
483 0.93
484 0.93
485 0.92
486 0.89
487 0.88
488 0.88
489 0.86
490 0.82
491 0.82
492 0.77
493 0.76
494 0.73
495 0.66
496 0.62
497 0.59
498 0.55
499 0.53
500 0.52
501 0.52
502 0.56
503 0.61
504 0.59
505 0.64
506 0.71
507 0.73
508 0.78
509 0.79
510 0.79
511 0.78
512 0.82
513 0.82
514 0.84
515 0.84
516 0.84
517 0.79
518 0.75
519 0.74
520 0.7
521 0.61
522 0.54
523 0.48
524 0.4
525 0.38
526 0.33
527 0.26
528 0.24
529 0.22
530 0.2
531 0.15
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.15
536 0.18
537 0.19
538 0.17
539 0.18
540 0.18
541 0.17
542 0.16
543 0.15
544 0.19
545 0.24
546 0.33
547 0.42
548 0.51
549 0.58
550 0.65
551 0.75
552 0.77
553 0.83
554 0.84
555 0.86
556 0.88
557 0.9
558 0.92
559 0.86
560 0.77