FuNGI

A0A197KD67

Protein Details

Accession

A0A197KD67

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MSFLRKRPPVQSNRQQQARA	Hydrophilic
78-100	PNSFTAPVKLHRKKNENPHRGYY	Hydrophilic
596-618	DLIYELKKKLKKDERNKNILAMC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
313-320	DRKKKRGK
445-486	KAKNKTKANAKAPLTPKKANATKPTASKPVSAKALKNKPAMP

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSFLRKRPPVQSNRQQQARALAAGQASSNSGPTIKKKIPTSTTPQPVPGTYTDYKLVSTSRDVLHHVMRFHGQKIVTPNSFTAPVKLHRKKNENPHRGYYGKYSQYNQQQQQQAAKDATGDKKDGAASGAGTVGGATAGAPGGAAAPAATGANTALIAPYGGGVRNKQMLFKKRTRQIYIANEDERKKKEIEAAPWVLDDYDSQNNWTGQLEGGQGANYVLFVFAEDGFKVVPADKWYKFSPKLQYATLTAEEAEEQYQKSQKQSNSIRWLMRSKNKKAEDGEEGGEEDIETEQLLAVDHDDDAGYDEDEAKDRKKKRGKHGDVDEMDFDEVWQDDEEMPADMPGFDDDAKDDPRNKHGPQMDSDEDEDDEEDRARLNETGKAVKKALRKLEKNKAYDDDDDKDPYASDKDSSDSDLDEIDKEKEMKKEEDTAAAAGGNTPDLSKAKNKTKANAKAPLTPKKANATKPTASKPVSAKALKNKPAMPAPRNASAGTQPSTKPAGPSSSSTPRGSSPPAAVNGRAGSPTLPDKKRKKMDGASQEQVEDSPKKVARSSEASTSGAAASHAAEPQDDSNLITEAEVIALLRSRPRVTTRDLIYELKKKLKKDERNKNILAMCVKKVATPVDGVLVLKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.79
3	0.71
4	0.69
5	0.62
6	0.53
7	0.43
8	0.36
9	0.29
10	0.27
11	0.24
12	0.17
13	0.15
14	0.13
15	0.13
16	0.11
17	0.13
18	0.16
19	0.21
20	0.3
21	0.33
22	0.4
23	0.45
24	0.54
25	0.58
26	0.61
27	0.65
28	0.66
29	0.7
30	0.66
31	0.65
32	0.58
33	0.52
34	0.49
35	0.42
36	0.39
37	0.32
38	0.33
39	0.31
40	0.29
41	0.28
42	0.26
43	0.25
44	0.21
45	0.23
46	0.24
47	0.24
48	0.25
49	0.28
50	0.31
51	0.36
52	0.36
53	0.33
54	0.31
55	0.35
56	0.36
57	0.34
58	0.35
59	0.29
60	0.29
61	0.36
62	0.41
63	0.37
64	0.36
65	0.36
66	0.33
67	0.38
68	0.34
69	0.3
70	0.27
71	0.33
72	0.42
73	0.49
74	0.55
75	0.61
76	0.69
77	0.74
78	0.8
79	0.84
80	0.83
81	0.81
82	0.79
83	0.77
84	0.7
85	0.65
86	0.61
87	0.59
88	0.56
89	0.53
90	0.49
91	0.49
92	0.58
93	0.65
94	0.62
95	0.61
96	0.59
97	0.59
98	0.64
99	0.59
100	0.53
101	0.45
102	0.39
103	0.34
104	0.33
105	0.35
106	0.31
107	0.29
108	0.25
109	0.26
110	0.26
111	0.23
112	0.19
113	0.14
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.05
121	0.04
122	0.04
123	0.03
124	0.03
125	0.03
126	0.03
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.03
131	0.03
132	0.03
133	0.03
134	0.03
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.07
149	0.08
150	0.1
151	0.13
152	0.19
153	0.19
154	0.24
155	0.32
156	0.4
157	0.47
158	0.54
159	0.61
160	0.63
161	0.72
162	0.71
163	0.69
164	0.68
165	0.69
166	0.67
167	0.64
168	0.6
169	0.57
170	0.56
171	0.57
172	0.51
173	0.44
174	0.38
175	0.34
176	0.38
177	0.38
178	0.39
179	0.42
180	0.41
181	0.39
182	0.38
183	0.36
184	0.27
185	0.21
186	0.17
187	0.12
188	0.14
189	0.13
190	0.14
191	0.17
192	0.17
193	0.18
194	0.17
195	0.14
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.04
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.11
221	0.17
222	0.17
223	0.21
224	0.23
225	0.3
226	0.32
227	0.37
228	0.41
229	0.42
230	0.44
231	0.42
232	0.42
233	0.37
234	0.37
235	0.32
236	0.24
237	0.17
238	0.14
239	0.13
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.13
246	0.14
247	0.17
248	0.23
249	0.23
250	0.32
251	0.38
252	0.45
253	0.49
254	0.53
255	0.52
256	0.49
257	0.53
258	0.5
259	0.52
260	0.52
261	0.51
262	0.56
263	0.56
264	0.58
265	0.55
266	0.52
267	0.49
268	0.42
269	0.37
270	0.27
271	0.25
272	0.2
273	0.17
274	0.13
275	0.08
276	0.05
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.03
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.17
300	0.21
301	0.3
302	0.37
303	0.45
304	0.55
305	0.65
306	0.7
307	0.73
308	0.76
309	0.76
310	0.7
311	0.64
312	0.53
313	0.42
314	0.34
315	0.24
316	0.17
317	0.08
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.08
337	0.1
338	0.12
339	0.17
340	0.18
341	0.24
342	0.3
343	0.29
344	0.34
345	0.36
346	0.37
347	0.35
348	0.41
349	0.36
350	0.32
351	0.32
352	0.26
353	0.21
354	0.19
355	0.16
356	0.1
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.12
366	0.14
367	0.21
368	0.23
369	0.25
370	0.26
371	0.3
372	0.34
373	0.37
374	0.45
375	0.47
376	0.53
377	0.59
378	0.68
379	0.71
380	0.69
381	0.66
382	0.61
383	0.55
384	0.51
385	0.46
386	0.4
387	0.34
388	0.33
389	0.3
390	0.26
391	0.22
392	0.19
393	0.16
394	0.13
395	0.11
396	0.1
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.13
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.11
409	0.12
410	0.15
411	0.19
412	0.22
413	0.24
414	0.25
415	0.31
416	0.3
417	0.32
418	0.29
419	0.26
420	0.22
421	0.19
422	0.17
423	0.1
424	0.09
425	0.06
426	0.05
427	0.05
428	0.06
429	0.07
430	0.09
431	0.15
432	0.23
433	0.32
434	0.41
435	0.43
436	0.5
437	0.59
438	0.67
439	0.68
440	0.69
441	0.63
442	0.63
443	0.68
444	0.7
445	0.67
446	0.6
447	0.57
448	0.57
449	0.6
450	0.59
451	0.59
452	0.57
453	0.55
454	0.58
455	0.6
456	0.58
457	0.53
458	0.52
459	0.47
460	0.46
461	0.48
462	0.46
463	0.46
464	0.49
465	0.57
466	0.59
467	0.6
468	0.57
469	0.53
470	0.58
471	0.6
472	0.53
473	0.52
474	0.49
475	0.5
476	0.49
477	0.45
478	0.39
479	0.34
480	0.36
481	0.3
482	0.29
483	0.24
484	0.26
485	0.29
486	0.28
487	0.26
488	0.24
489	0.26
490	0.25
491	0.29
492	0.32
493	0.37
494	0.41
495	0.4
496	0.39
497	0.37
498	0.38
499	0.39
500	0.34
501	0.29
502	0.29
503	0.33
504	0.33
505	0.32
506	0.31
507	0.28
508	0.26
509	0.22
510	0.18
511	0.13
512	0.14
513	0.22
514	0.29
515	0.34
516	0.43
517	0.51
518	0.61
519	0.7
520	0.73
521	0.75
522	0.74
523	0.78
524	0.79
525	0.79
526	0.75
527	0.67
528	0.61
529	0.52
530	0.43
531	0.38
532	0.29
533	0.23
534	0.24
535	0.26
536	0.27
537	0.3
538	0.32
539	0.33
540	0.38
541	0.4
542	0.4
543	0.4
544	0.39
545	0.37
546	0.35
547	0.29
548	0.22
549	0.18
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.1
555	0.1
556	0.12
557	0.12
558	0.15
559	0.13
560	0.12
561	0.13
562	0.13
563	0.13
564	0.11
565	0.1
566	0.08
567	0.08
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.07
572	0.08
573	0.12
574	0.16
575	0.17
576	0.22
577	0.27
578	0.31
579	0.37
580	0.44
581	0.45
582	0.49
583	0.52
584	0.53
585	0.55
586	0.59
587	0.58
588	0.6
589	0.6
590	0.56
591	0.63
592	0.68
593	0.71
594	0.74
595	0.79
596	0.8
597	0.86
598	0.84
599	0.81
600	0.73
601	0.68
602	0.65
603	0.59
604	0.5
605	0.46
606	0.44
607	0.38
608	0.38
609	0.35
610	0.29
611	0.26
612	0.24
613	0.22
614	0.23
615	0.22
616	0.19

A0A197KD67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer