Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JHA6

Protein Details
Accession A0A197JHA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-281RGEDGGREHKHKKKKKKRKHEHDHEHGHHEGEGDSEHRKKKKRKREREEHEHGDHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-272GGREHKHKKKKKKRKHEHDHEHGHHEGEGDSEHRKKKKRKRER
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MADNEDTADNKAPSPNLYFIKEAREASVPQPLTGSHDLMSIFKLQPLYDQYVKQKLPNNEDVPPIEPTYFPFIKHLPGKNVIRPGNYIRQLLEAPEKNYQPIHQFTSSTLRDAFSLRVGPVPGFDASVLGTDEGAGYKQAMKNLAAVAPAAGLTASAGAAGASNSLRPSSAAHGYGVPGYADTSSVPMSSDLPVHSSHGHSSHHGHSSHHGSKSSTSSPYVDKAERGEDGGREHKHKKKKKKRKHEHDHEHGHHEGEGDSEHRKKKKRKREREEHEHGDHGEHGELVIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.3
4 0.32
5 0.34
6 0.32
7 0.37
8 0.39
9 0.35
10 0.32
11 0.31
12 0.3
13 0.29
14 0.36
15 0.3
16 0.26
17 0.26
18 0.23
19 0.27
20 0.27
21 0.26
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.18
33 0.22
34 0.27
35 0.27
36 0.31
37 0.35
38 0.43
39 0.44
40 0.45
41 0.48
42 0.48
43 0.52
44 0.57
45 0.54
46 0.49
47 0.51
48 0.48
49 0.43
50 0.38
51 0.32
52 0.24
53 0.2
54 0.2
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.21
59 0.21
60 0.27
61 0.34
62 0.36
63 0.33
64 0.41
65 0.44
66 0.46
67 0.53
68 0.5
69 0.44
70 0.43
71 0.44
72 0.45
73 0.44
74 0.4
75 0.32
76 0.32
77 0.3
78 0.29
79 0.31
80 0.25
81 0.25
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.27
86 0.27
87 0.24
88 0.24
89 0.26
90 0.23
91 0.23
92 0.23
93 0.31
94 0.29
95 0.26
96 0.24
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.04
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.03
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.21
189 0.23
190 0.27
191 0.27
192 0.26
193 0.29
194 0.36
195 0.4
196 0.39
197 0.36
198 0.32
199 0.34
200 0.38
201 0.37
202 0.31
203 0.27
204 0.26
205 0.27
206 0.29
207 0.31
208 0.27
209 0.25
210 0.25
211 0.26
212 0.24
213 0.24
214 0.22
215 0.19
216 0.23
217 0.29
218 0.3
219 0.34
220 0.42
221 0.48
222 0.57
223 0.65
224 0.72
225 0.76
226 0.84
227 0.89
228 0.92
229 0.95
230 0.96
231 0.97
232 0.97
233 0.97
234 0.96
235 0.96
236 0.89
237 0.84
238 0.74
239 0.63
240 0.53
241 0.42
242 0.32
243 0.22
244 0.18
245 0.14
246 0.18
247 0.24
248 0.31
249 0.38
250 0.48
251 0.58
252 0.67
253 0.77
254 0.82
255 0.87
256 0.91
257 0.94
258 0.95
259 0.96
260 0.95
261 0.93
262 0.86
263 0.8
264 0.69
265 0.6
266 0.51
267 0.42
268 0.32
269 0.23