Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JVX5

Protein Details
Accession A0A197JVX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74ASKLKFAPTVPSKRNKKEGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-71KRNKK
81-117AKAGSGPAERGAGRGRGERGERGMRGGRGGRVPGRGR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSDESGNQRSAASASASGSIGSLHTPTVTPAGRLTSLRGGRGGAGASTASTRGGASKLKFAPTVPSKRNKKEGNLSLLEEAKAGSGPAERGAGRGRGERGERGMRGGRGGRVPGRGRGDDIAATASGPFSLGPAAQARSRAIATGGSASGAHSSYTGSREVKMEGEGGGSDYGASVDMKFGSTVTDASVPTGLEKPNDDTKVVGSSIKEEKMREQDMDEDTDVNESAHAAGEADIKPKVEGPAQDLTPESEYDQMFFFQFPSVMPTFRPRPVATAPLSSITSTAGSSPNVSSLYSTPDGTDKTEDSEDGLLAIKSEPMDQDRPIMIPDNDLVPVKSEQKDVKLGLSLGDGAPGSSAPVGQRAKPKAPGAAAAKTTEKEEETEDSHLQQEGKIGRLLIYKSGKVKMKVGDILMDVSSGSECSFLQDLVVVDSNNKQAFVMGSVQKRMVCVPNLTELLNGLEGLDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.23
20 0.24
21 0.26
22 0.29
23 0.31
24 0.32
25 0.31
26 0.28
27 0.26
28 0.27
29 0.23
30 0.14
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.12
41 0.17
42 0.18
43 0.26
44 0.29
45 0.32
46 0.33
47 0.32
48 0.38
49 0.42
50 0.5
51 0.5
52 0.57
53 0.64
54 0.71
55 0.8
56 0.77
57 0.76
58 0.77
59 0.77
60 0.76
61 0.7
62 0.64
63 0.58
64 0.53
65 0.45
66 0.34
67 0.26
68 0.17
69 0.14
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.17
79 0.19
80 0.2
81 0.24
82 0.25
83 0.28
84 0.31
85 0.32
86 0.35
87 0.37
88 0.36
89 0.37
90 0.39
91 0.34
92 0.36
93 0.36
94 0.33
95 0.3
96 0.34
97 0.32
98 0.34
99 0.36
100 0.38
101 0.41
102 0.38
103 0.37
104 0.34
105 0.33
106 0.25
107 0.24
108 0.18
109 0.13
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.05
118 0.04
119 0.06
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.14
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.08
177 0.09
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.14
183 0.19
184 0.2
185 0.19
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.18
190 0.16
191 0.1
192 0.13
193 0.16
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.21
198 0.26
199 0.27
200 0.24
201 0.22
202 0.23
203 0.23
204 0.24
205 0.21
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.14
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.16
253 0.2
254 0.22
255 0.26
256 0.22
257 0.25
258 0.27
259 0.32
260 0.28
261 0.27
262 0.25
263 0.23
264 0.23
265 0.19
266 0.17
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.11
305 0.14
306 0.14
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.2
312 0.16
313 0.15
314 0.16
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.14
321 0.18
322 0.19
323 0.22
324 0.23
325 0.26
326 0.3
327 0.28
328 0.27
329 0.25
330 0.23
331 0.2
332 0.18
333 0.16
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.05
344 0.13
345 0.15
346 0.19
347 0.27
348 0.33
349 0.37
350 0.43
351 0.45
352 0.42
353 0.41
354 0.44
355 0.41
356 0.4
357 0.37
358 0.34
359 0.34
360 0.3
361 0.31
362 0.26
363 0.22
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.24
369 0.23
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.21
374 0.18
375 0.21
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.23
382 0.24
383 0.26
384 0.29
385 0.31
386 0.34
387 0.41
388 0.45
389 0.43
390 0.48
391 0.44
392 0.46
393 0.46
394 0.42
395 0.38
396 0.33
397 0.32
398 0.26
399 0.22
400 0.15
401 0.12
402 0.11
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.1
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.16
415 0.13
416 0.14
417 0.17
418 0.23
419 0.21
420 0.21
421 0.18
422 0.17
423 0.18
424 0.19
425 0.24
426 0.25
427 0.28
428 0.31
429 0.34
430 0.34
431 0.34
432 0.36
433 0.35
434 0.32
435 0.32
436 0.31
437 0.36
438 0.37
439 0.36
440 0.32
441 0.27
442 0.25
443 0.21
444 0.18