Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197JFS1

Protein Details
Accession A0A197JFS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-55THKPTLKAPKRTALPKPKPKPKSPYGRPAHKAABasic
148-169RPEPSGSRRHENRQRRNSRDAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-53AKKVTHKPTLKAPKRTALPKPKPKPKSPYGRPAHK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 15.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MELMDQSLDDIIKLNKLEAKKVTHKPTLKAPKRTALPKPKPKPKSPYGRPAHKAAPLFTETYKAWNAPVAAIFTSAYVPKSESIKLVVYNDRISKSTRNDIGASTSSTYEPGTKSGIRLSTTHRTQAESYRPAASTSGGYSSQGDFYRPEPSGSRRHENRQRRNSRDAGRLSSSSASHGNWDDRRKSSARESAPVSGMGIDEVRKYYNKHSQNNGGSSNRNHNNNDNGKGKDNHGNNRRGSRSVENNASSPPKTVDVDMDIVEIKQEEEDQFISIKGAAPVEVDAVNGPVTIEIENLDRGTTAEDVKVVCSRFGEIKSCVCSNGFSQVTYARKAAGIAAVETLNGKKADNNQILRVTMLKVPIFHNVTIAPSPHVPSSIAGPMKLLTRAVQGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.23
4 0.29
5 0.32
6 0.4
7 0.46
8 0.55
9 0.61
10 0.66
11 0.7
12 0.68
13 0.73
14 0.75
15 0.75
16 0.76
17 0.74
18 0.73
19 0.75
20 0.8
21 0.8
22 0.8
23 0.81
24 0.82
25 0.86
26 0.88
27 0.89
28 0.9
29 0.89
30 0.87
31 0.88
32 0.86
33 0.86
34 0.85
35 0.87
36 0.81
37 0.78
38 0.74
39 0.69
40 0.62
41 0.53
42 0.49
43 0.41
44 0.39
45 0.33
46 0.31
47 0.25
48 0.27
49 0.27
50 0.22
51 0.2
52 0.2
53 0.2
54 0.17
55 0.19
56 0.16
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.24
74 0.26
75 0.26
76 0.29
77 0.31
78 0.3
79 0.29
80 0.31
81 0.33
82 0.34
83 0.39
84 0.39
85 0.38
86 0.38
87 0.37
88 0.38
89 0.33
90 0.3
91 0.23
92 0.2
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.15
100 0.15
101 0.16
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.22
106 0.27
107 0.32
108 0.34
109 0.39
110 0.36
111 0.36
112 0.36
113 0.41
114 0.43
115 0.37
116 0.37
117 0.34
118 0.33
119 0.31
120 0.29
121 0.23
122 0.16
123 0.13
124 0.14
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.22
139 0.3
140 0.34
141 0.42
142 0.43
143 0.52
144 0.61
145 0.69
146 0.75
147 0.77
148 0.82
149 0.79
150 0.81
151 0.79
152 0.76
153 0.73
154 0.66
155 0.59
156 0.52
157 0.46
158 0.4
159 0.34
160 0.28
161 0.21
162 0.19
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.2
168 0.25
169 0.27
170 0.27
171 0.31
172 0.31
173 0.32
174 0.34
175 0.38
176 0.35
177 0.35
178 0.35
179 0.34
180 0.33
181 0.3
182 0.23
183 0.16
184 0.13
185 0.1
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.1
193 0.15
194 0.24
195 0.31
196 0.37
197 0.41
198 0.48
199 0.52
200 0.53
201 0.52
202 0.46
203 0.41
204 0.38
205 0.42
206 0.38
207 0.38
208 0.36
209 0.35
210 0.42
211 0.43
212 0.47
213 0.43
214 0.4
215 0.4
216 0.4
217 0.4
218 0.38
219 0.38
220 0.42
221 0.45
222 0.5
223 0.49
224 0.54
225 0.54
226 0.49
227 0.48
228 0.45
229 0.45
230 0.44
231 0.46
232 0.4
233 0.39
234 0.4
235 0.39
236 0.33
237 0.27
238 0.22
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.11
292 0.11
293 0.13
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.19
300 0.21
301 0.24
302 0.23
303 0.27
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.26
308 0.25
309 0.22
310 0.28
311 0.24
312 0.2
313 0.21
314 0.26
315 0.28
316 0.29
317 0.28
318 0.21
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.17
323 0.15
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.14
334 0.22
335 0.33
336 0.4
337 0.43
338 0.45
339 0.48
340 0.48
341 0.45
342 0.4
343 0.32
344 0.26
345 0.27
346 0.23
347 0.22
348 0.23
349 0.31
350 0.32
351 0.3
352 0.29
353 0.25
354 0.27
355 0.28
356 0.27
357 0.22
358 0.21
359 0.24
360 0.23
361 0.23
362 0.2
363 0.19
364 0.22
365 0.26
366 0.26
367 0.23
368 0.23
369 0.23
370 0.25
371 0.26
372 0.22
373 0.16