Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2JVP1

Protein Details
Accession I2JVP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-205EDTKSHKSRVKSGGNKKRKFDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-203SHKSRVKSGGNKKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences METDIENKNKKLDESIYGVNTSGSDSEEEEEETKHKEVEVDQGERFKAKRAQSRFXESESESESESESESEENESEDKSEDKSEDKEDEKEKDEDEISQKQIEEDQDNEEYDEIEEMEKQLANEGTFGIHKMKKLTPEQLEKAQKRIKRSGVVYLSSMPPYMKPTKLRQIMERFGAVGRIFLKPEDTKSHKSRVKSGGNKKRKFDEGWCEFKSKKAAKLAAETLNGNIIGGKKRGILP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.37
4 0.35
5 0.34
6 0.28
7 0.24
8 0.2
9 0.15
10 0.11
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.23
26 0.28
27 0.28
28 0.29
29 0.32
30 0.32
31 0.33
32 0.33
33 0.3
34 0.3
35 0.34
36 0.42
37 0.45
38 0.53
39 0.56
40 0.64
41 0.6
42 0.56
43 0.54
44 0.46
45 0.42
46 0.35
47 0.31
48 0.23
49 0.2
50 0.18
51 0.14
52 0.13
53 0.11
54 0.09
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.15
69 0.17
70 0.2
71 0.22
72 0.25
73 0.27
74 0.29
75 0.31
76 0.3
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.21
81 0.22
82 0.22
83 0.2
84 0.2
85 0.19
86 0.17
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.08
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.17
119 0.22
120 0.25
121 0.32
122 0.34
123 0.39
124 0.41
125 0.47
126 0.54
127 0.5
128 0.54
129 0.53
130 0.49
131 0.49
132 0.52
133 0.49
134 0.46
135 0.47
136 0.47
137 0.46
138 0.45
139 0.4
140 0.35
141 0.31
142 0.26
143 0.24
144 0.16
145 0.13
146 0.17
147 0.19
148 0.22
149 0.25
150 0.32
151 0.41
152 0.49
153 0.5
154 0.53
155 0.57
156 0.57
157 0.55
158 0.48
159 0.39
160 0.32
161 0.32
162 0.24
163 0.18
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.18
169 0.17
170 0.21
171 0.27
172 0.32
173 0.39
174 0.44
175 0.54
176 0.53
177 0.55
178 0.6
179 0.61
180 0.65
181 0.67
182 0.73
183 0.75
184 0.81
185 0.85
186 0.82
187 0.79
188 0.74
189 0.69
190 0.66
191 0.66
192 0.63
193 0.65
194 0.62
195 0.6
196 0.55
197 0.54
198 0.56
199 0.5
200 0.49
201 0.49
202 0.52
203 0.51
204 0.58
205 0.59
206 0.55
207 0.52
208 0.46
209 0.38
210 0.35
211 0.3
212 0.23
213 0.19
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.19