Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A197K649

Protein Details
Accession A0A197K649    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-254GRSSSRSRSRSRSRSLSRSRSRSRSRSRSRLRSRSKSASSSRSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-248RGERGRSSSRSRSRSRSRSLSRSRSRSRSRSRSRLRSRSKSA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 16, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
IPR024767  PRP38_C  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
PF12871  PRP38_assoc  
Amino Acid Sequences MAMDNKTVRDAIQVHGTNPQFLIEKILRTRIYESTYWKESCFGLTESSIIEKAYELTSIGGQYGVQKPTEFICLVLKLLQLQPREEIVIKYITGLTENDSNKYLRALGAFYLRLVGKPIDIYKNLEPLLVDGRKLRKRGNNGYSIIHMDEFIDELLREERVCDVVLPRLTKRYVLEDTGELNPRISALEEAEMELEQEREAEEAAARGERGRSSSRSRSRSRSRSLSRSRSRSRSRSRSRLRSRSKSASSSRSRTGSQTFEIAVKESKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.36
3 0.36
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.21
8 0.19
9 0.26
10 0.2
11 0.25
12 0.27
13 0.34
14 0.33
15 0.34
16 0.38
17 0.35
18 0.38
19 0.36
20 0.4
21 0.4
22 0.44
23 0.43
24 0.4
25 0.37
26 0.33
27 0.31
28 0.27
29 0.21
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.16
34 0.17
35 0.15
36 0.12
37 0.11
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.07
49 0.11
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.21
57 0.17
58 0.13
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.16
66 0.2
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.21
72 0.2
73 0.17
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.11
103 0.08
104 0.09
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.18
109 0.17
110 0.21
111 0.2
112 0.19
113 0.17
114 0.15
115 0.2
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.22
120 0.26
121 0.28
122 0.32
123 0.32
124 0.4
125 0.49
126 0.52
127 0.51
128 0.49
129 0.48
130 0.45
131 0.4
132 0.33
133 0.23
134 0.17
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.17
155 0.2
156 0.21
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.23
161 0.23
162 0.24
163 0.21
164 0.23
165 0.25
166 0.26
167 0.21
168 0.18
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.09
174 0.07
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.14
198 0.17
199 0.22
200 0.29
201 0.4
202 0.48
203 0.55
204 0.61
205 0.67
206 0.74
207 0.78
208 0.79
209 0.79
210 0.79
211 0.81
212 0.85
213 0.86
214 0.85
215 0.86
216 0.86
217 0.86
218 0.87
219 0.87
220 0.88
221 0.88
222 0.88
223 0.89
224 0.91
225 0.92
226 0.93
227 0.93
228 0.93
229 0.92
230 0.91
231 0.9
232 0.86
233 0.84
234 0.81
235 0.8
236 0.78
237 0.75
238 0.72
239 0.66
240 0.62
241 0.58
242 0.56
243 0.5
244 0.44
245 0.4
246 0.35
247 0.33
248 0.32
249 0.29